Orale antikoagulans (eks. warfarin) Ciprofloxacin kan, som andre quinoloner, påvirke virkningen af coumarinderivater inklusiv warfarin.
Tsiprofloksatsiini ja tsüklosporiini samaaegsel manustamisel on üksikutel juhtudel täheldatud kreatiniinisisalduse ajutist tõusu seerumis.