Anvendelse af ibafloxacin kan føre til øget forekomst af resistente stammer, men dette skulle ikke give grund til særlig betænkelighed, da produktet anvendes til behandling af individuelle dyr.
Ibafloksatsiini kasutamise tulemusena võib suureneda resistentsete tüvede esinemine sihtliigil, kuigi üksikloomade ravimisel selle ravimiga on see oht tõenäoliselt väiksem.