Mavetarmkanalen Forekommer der alvorlig og vedvarende diaré under eller efter behandling med ciprofloxacin eller andre fluroquinoloner skal muligheden for pseudomembranøs colitis overvejes (livstruende med mulig fatal udgang).
Kui tsiprofloksatsiini või teiste fluorokinoloonidega teostatava ravi ajal või pärast seda tekib raske ja püsiv kõhulahtisus, tuleb arvestada pseudomembranoosse koliidi võimalusega (tegemist on eluohtliku seisundiga, mis võib lõppeda ka surmaga).