Hos begge arter kan difloxacin konjugeres (glucuronideres eller sulfateres), demetyleres til sarafloxacin eller oxideres til N- oxid- difloxacin.
Mõlemal linnuliigil võib difloksatsiin konjugeeruda (tekivad glükuroniidid, sulfaadid), desmetüleeruda sarafloksatsiiniks või oksüdeeruda N- oksiid- difloksatsiiniks.