De mest almindelige bivirkninger ved Rebif (der ses hos flere end 1 ud af 10 patienter) er influenzalignende symptomer, neutropeni, lymfopeni og leukopeni (lavt antal hvide blodlegemer), trombocytopeni (lavt antal blodplader), anæmi (lavt antal røde blodlegemer), hovedpine, betændelse og andre reaktioner på injektionsstedet samt forhøjede leverenzymer (transaminaser).
Rebifi kõige sagedamad kõrvalnähud (esinenud enam kui ühel patsiendil kümnest) on gripisarnased sümptomid, neutropeenia, lümfopeenia ja leukopeenia (vere valgeliblede vähesus), trombotsütopeenia (vereliistakute vähesus), aneemia (punaliblede vähesus), peavalu, põletik ja muud süstekoha reaktsioonid ning transaminaaside (teatud maksaensüümid) sisalduse suurenemine.