Kivexa kan ligesom alle andre NRTI' er også medføre ophobning af mælkesyre i kroppen, og nyfødte, hvis mødre har fået Kivexa under graviditeten, kan udvikle mitokondriel dysfunktion (beskadigelse af de energiproducerende cellebestanddele med blodproblemer til følge).
Nagu kõik teisedki nukleosiid- pöördtranskriptaasi inhibiitorid, võib ka Kivexa põhjustada piimhappeatsidoosi (piimhappe kogunemist kehas) ning raseduse ajal Kivexat kasutanud emade imikutel mitokondrite funktsioonihäiret (rakkude energiat genereerivate komponentide kahjustus, mis võib põhjustada verehäireid).