Den bevarede aktivitet afhænger af antallet og typen af protease- resistente mutationer i isolaterne.
Vastupidiselt säilitab amprenaviir aktiivsuse mõnede isolaatide vastu, mis on resistentsed teiste PIde suhtes ja aktiivsuse säilimine sõltub isolaatides esinevate proteaasi resistentsusmutatsioonide arvust ja tüübist.