Det vides ikke nøjagtigt, hvordan alfa- interferoner virker ved virussygdomme, men de menes at være immunmodulerende (dvs. de ændrer den måde, kroppens immunsystem (kroppens forsvarssystem) virker på).
Alfainterferoonide täpne toimemehhanism viirushaiguste korral ei ole täielikult teada, kuid arvatakse, et need toimivad immunomodulaatoritena (ained, mis mõjutavad immuunsüsteemi ehk organismi kaitsesüsteemi).