Bortset fra reaktioner på injektionsstedet er de hyppigst rapporterede bivirkninger hos patienter, som får retrovirusdræbende behandling med eller uden Fuzeon, diarré og kvalme.
Peale süstekoha reaktsioonide on retroviirusevastast ravi (Fuzeon’ iga või ilma) saavatel patsientidel kõige sagedamini kirjeldatud kõrvaltoimeteks kõhulahtisus ja iiveldus.