De hyppigst forekommende bivirkninger ved ViraferonPeg (der ses hos flere end 1 ud af hver 10 patienter) er virusinfektion, vægttab, depression, irritabilitet, søvnbesvær, angst, nedsat koncentrationsevne, emotionel labilitet (humørsvingninger), hovedpine, mundtørhed, dyspnø (åndenød), pharyngitis (ondt i halsen), hoste, opkastning, kvalme, mavesmerter, diarré, anoreksi (appetitløshed), hårtab, kløe, tør hud, udslæt, myalgi (muskelsmerter), ledsmerter, smerter i muskler og knogler, inflammation på injektionsstedet, reaktioner på injektionsstedet (smerte og rødmen), svimmelhed, træthed, kulderystelser, feber, influenzalignende symptomer og asteni (kraftesløshed).
Kõige sagedamad kõrvalnähud ViraferonPegi kasutamisel (täheldatud rohkem kui ühel patsiendil kümnest) on viirusinfektsioon, kehakaalu langus, depressioon, ärrituvus, unetus, ärevusseisund, keskendumishäired, emotsionaalne labiilsus (meeleolu kõikuvus), peavalu, suukuivus, düspnoe (raskendatud hingamine), farüngiit (neelupõletik), köha, oksendamine, iiveldus, kõhuvalu, kõhulahtisus, iiveldus, anoreksia (isutus), alopeetsia (juuste väljalangemine), pruritus (kihelus), nahakuivus, nahalööve, müalgia (lihasevalu), artralgia (liigesevalu), luu- lihaskonna valu (valu luudes ja lihastes), põletik süstekohal, reaktsioon süstekohal (valu ja punetus), peapööritus, väsimus, külmavärinad, palavik, gripilaadsed sümptomid ja asteenia (nõrkus).