I løbet af undersøgelserne indtrådte de hyppigste bivirkninger (hos mere end 1 ud af 10 patienter) i løbet af eller lige efter infusionen.
Myozyme uuringutes olid kõige sagedamad kõrvalnähud (esinenud enam kui ühel patsiendil kümnest) on tahhükardia (südamerutlus), õhetus, köha, tahhüpnoe (sage hingamine), oksendamine, nõgestõbi, lööve, püreksia (palavik) ning vere hapnikupuudus veres.