Micafungin udviser fungicid effekt på de fleste Candida- arter og hæmmer kraftigt aktivt voksende hyfer af Aspergillus- arter.
Mikafungiinil on fungitsiidne toime enamike Candida liikide vastu ning ta inhibeerib märkimisväärselt Aspergillus liikide seeneniitide aktiivset kasvu.