Da ciprofloxacin har nogen aktivitet over for Mycobacerium turberculosis kan falsk negativ resultat forekomme, hvis prøver tages under behandling med ciprofloxacin.
Kuna tsiprofloksatsiin omab teatud toimet Mycobacerium tuberculosis’ e suhtes, võivad tsiprofloksatsiinravi ajal teostatud bakterikultuuri testid anda valenegatiivseid tulemusi.