De mest almindelige bivirkninger ved Thymanax (som optræder hos mellem 1 og 10 patienter ud af 100) er hovedpine, svimmelhed, søvntrang, søvnløshed, migræne, kvalme, diarré, forstoppelse, mavepine, øget svedafsondring, rygsmerter, træthed, forhøjet leverenzymniveau og angst.
Thymanaxi kõige sagedamad kõrvalnähud (esinenud ühel kuni kümnel patsiendil sajast) on peavalu, peapööritus, unisus, unetus, migreen, iiveldus, kõhulahtisus, kõhukinnisus, ülakõhuvalu, hüperhidroos (liigne higistamine), seljavalu, väsimus, maksaensüümide sisalduse suurenemine veres ja ärevus.