Fluoxetin skal anvendes med forsigtighed under graviditet, specielt sent i graviditeten eller lige op til fødslen, da følgende bivirkninger er rapporteret for nyfødte: irritabilitet, tremor, hypotoni, vedvarende gråd, problemer med at sutte samt søvnproblemer.
Fluoksetiini võib raseduse ajal kasutada, kuid rasedale ordineerimisel tuleb olla ettevaatlik, eriti raseduse hilisjärgus või vahetult enne sünnitustegevuse algust, kuna on teatatud vastsündinutel järgmistest kõrvalnähtudest: ärrituvus, treemor, hüpotoonia, püsiv nutmine, imemisraskused või unehäired.