Da abacavir øger den hastighed, hvormed metadon fjernes fra kroppen, vil patienter der tager metadon, blive undersøgt for abstinenssymptomer, og skal måske have ændret deres metadondosis.
Kuna abakaviir kiirendab metadooni eritumist organismist, kontrollitakse metadooni kasutavaid patsiente võimalike võõrutusnähtude suhtes ning nende metadooniannust võidakse muuta.