Udvikling af resistens mod ciprofloxacin og andre fluoroquinoloner er observeret ved stafylokokker, især methicillin- resistente S. aureus, P. aeruginosa, E. coli og E. faecalis (se følsomhedstabellen).
Resistentsuse kujunemist tsiprofloksatsiini ja teiste fluorokinoloonide suhtes on täheldatud stafülokokkide hulgas, eelkõige aga metitsilliinresistentse S. aureus’ e, P. aeruginosa, E. coli ja E. faecalis’ e puhul (vt tundlikkuse tabelit).