Patienter behandlet med immunsuppressiva, herunder Rapamune, har øget risiko for opportunistiske infektioner (bakteriel, svamp, viral og protozoal).
Immunosupressantide, sealhulgas Rapamunega ravitavatel patsientidel suureneb oportunistlike (bakteriaalsete, seen - või viirusinfektsioonide ja algloomadest põhjustatud) infektsioonide tekkimise risk.