Absorptionen af doxycyclin fra mave- tarmkanalen kan blive hæmmet af bi - eller trivalente ioner såsom aluminium, zink, kalcium (som blandt andet findes i mælk, mælkeprodukter og kalciumholdige frugtsafter), af magnesium (som findes i f. eks. anticider) eller af jernpræparater, aktivt kul, kolestyramin, bismuth- chelater og sukralfat.
Doksütsükliinili imendumist seedetraktist võivad pärssida bi - või trivalentsed ioonid, nagu alumiiniumi, tsingi, kaltsiumi (leiduvad näiteks piimas, piimatoodetes ja kaltsiumi sisaldavates puuviljamahlades), magneesiumi või rauapreparaadid, aktiivsüsi, kolestüramiin, vismuti kelaadid ja sukralfaat.