De almindeligste bivirkninger af Comtan (der ses hos mellem 1 og 10 patienter af hver 100) er frivillige bevægelser (dyskinesi), kvalme og (harmløs) farvning af urinen.
Kõige sagedamad kõrvalnähud Comtani kasutamisel (täheldatud ühel kuni kümnel patsiendil sajast) on düskineesia (tahtele allumatud liigutused), iiveldus ja uriini kahjutu värvimuutus.