De almindeligste bivirkninger af Yondelis (der ses hos mere end 1 ud af 10 patienter) er forhøjet indhold i blodet af kreatinfosfokinase (en markør for nedbrydning af muskelvæv) og af kreatinin (en markør for nyreproblemer), nedsat indhold i blodet af albumin (en markør for leverproblemer), neutropeni (for lavt antal neutrofile, en type hvide blodlegemer), for lavt indhold af blodplader, anæmi (for lavt indhold af røde blodlegemer), for lavt indhold af hvide blodlegemer, hovedpine, opkastning, kvalme, forstoppelse, appetitløshed, træthed, kraftesløshed, for højt bilirubinindhold i blodet og forhøjet indhold af leverenzymer i blodet (alaninaminotransferase, aspartataminotransferase, alkalisk fosfatase og gammaglutamyltransferase).
Kõige sagedamad Yondelise kõrvalnähud (täheldatud rohkem kui ühel patsiendil kümnest) on kreatiinfosfokinaasi (lihaskoe lagunemise marker) ja kreatiniini (neeruhäirete marker) taseme tõus veres, albumiini (maksaprobleemide marker) taseme langus veres, neutropeenia (neutrofiilide ehk teatud valgeliblede vähesus), trombotsütopeenia (trombotsüütide ehk vereliistakute vähesus), aneemia (punaliblede vähesus), leukopeenia (leukotsüütide ehk valgeliblede vähesus), peavalu, oksendamine, iiveldus, kõhukinnisus, isutus, väsimus, nõrkus, hüperbilirubineemia (vere kõrge bilirubiinitase) ja maksaensüümide