De mest almindelige bivirkninger ved behandling med Ziagen (observeres blandt 1 til 10 patienter ud af 100) er anoreksi (appetitløshed), hovedpine, kvalme, opkast, diarré, udslæt, feber, apati (mangel på energi) og træthed.
Ziageni kõige sagedamad kõrvalnähud (esinenud ühel kuni kümnel patsiendil sajast) on isutus, peavalu, iiveldus, oksendamine, kõhulahtisus, lööve, palavik, loidus ja väsimus.