Nyfødte børn, hvis mødre har fået Combivir under graviditeten, kan få mitokondriel dysfunktion (beskadigelse af de energiproducerende cellebestanddele med blodproblemer til følge).
Nagu kõik teisedki nukleosiid- pöördtranskriptaasi inhibiitorid, võib ka Combivir põhjustada laktoatsidoosi (piimhappe kogunemist organismi) ning raseduse ajal Combiviri kasutanud emade imikutel mitokondrite talitlushäireid (energiat tootvate rakuosade kahjustus, mis võib põhjustada verehäireid).