Ammonaps kan desuden anvendes til patienter, der er over en måned gamle og delvis mangler enzymerne eller tidligere har lidt af hyperammonæmisk encefalopati (hjerneskade forårsaget af højt ammoniakindhold).
Ammonapsi saab kasutada ka üle ühe kuu vanustel patsientidel, kellel on ensüümide osaline puudulikkus või kellel on hüperammoneemiline entsefalopaatia anamnees (vere kõrgest ammoniaagisisaldusest tingitud ajukahjustus).