Som ved alle rekombinante dna- afledte humaniserede monoklonale antistoffer kan patienter i sjældne tilfælde udvikle antistoffer mod omalizumab.
Nagu kõigi rekombinantse DNA tehnoloogia abil saadud humaniseeritud monoklonaalsete antikehade puhul, võivad patsientidel harva tekkida omalizumabi vastased antikehad.