Bindingen af bivalirudin til trombin – og dermed dets aktivitet – er reversibel, idet trombin langsomt spalter bivalirudin, Arg3- Pro4- bindingen, hvilket medfører en genetablering af trombins funktion som aktiv site.
Bivalirudiini seondumine trombiiniga ja seega ka bivalirudiini toime on pöörduv, sest trombiin lõhustab aeglaselt bivalirudiini Arg3- Pro4 sidet, mistõttu trombiini aktiivtsentrite funktsioon taastub.