Det er vanskeligt at vurdere bivirkningerne af Pedea, da de kan være relateret til både den åbentstående ductus arteriosus og Pedeas egne virkninger.
Pedea kõrvaltoimete põhjuseid on raske hinnata, sest need võivad olla seotud nii avatud arterioosjuha kui ka Pedea enda toimetega.