Som med andre lægemidler mod hiv kan der hos patienter, der tager APTIVUS, være risiko for lipodystrofi (ændringer i fordelingen af kropsfedt), osteonekrose (knoglevævsdød)) eller immunt reaktiveringssyndrom (symptomer på infektion forårsaget af genopretning af immunsystemet).
Nagu ka teisi HIV infektsiooni vastaste ravimite kasutajaid, võib ka APTIVUSt võtvaid patsiente ohustada lipodüstroofia (keharasva jaotuvuse muutused), osteonekroos (luukoe surm) või immuunreaktivatsiooni sündroom (immuunsüsteemi taastumisest põhjustatud infektsioonisümptomid).