Den baktericide effekt af moxifloxacin fremkommer ved hæmning afbegge type II - topoisomeraser (DNA- gyrase og topoisomerase IV), som er nødvendig for bakteriel DNA - replikation, - transskription og - reparation.
Moksifloksatsiini bakteritsiidne toime tuleneb bakteriaalse DNA replikatsiooniks, transkriptsiooniks ja taastootmiseks vajaliku topoisomeraas II (DNA güraas) ja IV inhibeerimisest.