affinitet og specifikt til antitrombinprotein med en dosisafhængig plasmakoncentrationsbinding (98, 6 - 97, 0% i koncentrationsintervallet fra 0, 5 til 2 mg/ l).
In vitro, on fondapariinuks suures ulatuses ja spetsiifiliselt seondunud antitrombiin- valgule annusest sõltuva plasmakontsentratsiooni seonduvusega (98, 6% … 97, 0% kontsentratsioonivahemikus 0, 5… 2 mg/ l).