Ciprofloxacin når høje koncentrationer i mange væv som f. eks. lungevæv (epitelvæske, alveolære makrofager, biopsivæv), bihuler og inflammerede læsioner (cantharides blistervæske) og urogenitalsystemet (urin, prostata, endometrium), hvor totalkoncentrationerne kan overstige plasmakoncentrationerne.
Tsiprofloksatsiini kontsentratsioonid on suured mitmesugustes kudedes, näiteks kopsudes (epiteelkoe vedelik, alveoolide makrofaagid, biopsiakude), ninakõrvalurgetes ja põletikulistes kahjustustes (kantariin- villivedelik) ja kuseteedes (uriin, eesnääre, emakalimaskest), kus saavutatakse kokku plasmakontsentratsiooni ületav kontsentratsioon.