Ikke desto mindre er der en potentiel risiko for at vælge HIV- stammer, som er resistente over for adefovir med mulig krydsresistens over for andre antivirale lægemidler.
Sellele vaatamata esineb võimalik oht adefoviirile resistentsete HIV tüvede tekkeks koos ristuva resistentsuse võimalusega teiste viirustevastaste ravimite suhtes.