Der vil blive holdt løbende kontakt med andre af EU' s decentraliserede agenturer, navnlig Den Europæiske Fødevaresikkerhedsautoritet, Det Europæiske Overvågningscenter for Narkotika og Narkotikamisbrug og Det Europæiske Center for Forebyggelse af og Kontrol med Sygdomme.
Regulaarselt suheldakse ka teiste ELi detsentraliseeritud asutustega, eriti Euroopa Toiduohutusameti, Euroopa Narkootikumide ja Narkomaania Seirekeskuse ning Haiguste Ennetamise ja Tõrje Euroopa Keskusega.