Der er påvist abacavirresistente isolater af HIV- 1 in vitro, som er forbundet med specifikke genotypeforandringer i RT- codonregionen (codoner M184V, K65R, L74V og Y115F).
In vitro on välja selgitatud ka abakaviirile resistentsed HIV- 1 isolaadid, nende puhul on resistentsus seotud spetsiifiliste genotüübiliste muutustega RT kodeerivas regioonis (koodonid M184V, K65R, L74V ja Y115F).