In vitro- resistens over for ciprofloxacin kan erhverves gennem en trinvis proces af mutationer på målstedet af både topoisomerase II, DNA gyrase og topoisomerase IV.
In vitro võib omandada resistentsuse tsiprofloksatsiini suhtes astmelise protsessina, mille käigus toimuvad sihtmärkide mutatsioonid nii DNA güraasis kui ka topoisomeraasis IV.