Selv om in vitro- forsøg tyder på, at CYP2D6 og CYP3A4 spiller en rolle i metaboliseringen af paliperidon, findes der ingen in vivo- evidens for, at disse isozymer spiller en signifikant rolle i metaboliseringen af paliperidon.
Kuigi in vitro uuringud viitasid CYP2D6 ja CYP3A4 rollile paliperidooni metabolismis, puudub in vivo tõestus selle kohta, et nendel isoenüümidel oleks metabolismis märkimisväärne roll.