Hos de patienter, der blev behandlet med Cubicin, blev de efterfølgende bivirkninger nævnt oftest under behandlingen samt ved follow- up: hovedpine, kvalme, opkastning, diarré, svampeinfektioner, udslæt, reaktioner på infusionsstedet, forhøjet kreatinfosfokinase (CPK) og abnorme leverenzymer, alanin- amino- transferase (ALAT), aspartat- amino- stransferase (ASAT), alkalinfosfatase.
Cubicin’ i saanud isikutel olid kõige sagedamini ravi ajal pluss kontrollperioodi jooksul esinenud kõrvaltoimeteks: peavalu, iiveldus, oksendamine, kõhulahtisus, seeninfektsioonid, lööve, infusioonikoha reaktsioon, kreatiinfosfokinaasi (KFK), normist erinevad maksaensüümide: alaniinaminotransferaasi (ALAT), aspartaataminotransferaasi (ASAT) ja aluselise fosfataasi tõusnud tasemed.