Clomipramin og dets vigtigste metabolit, desmethylclomipramin, forhindrer en række neurotransmittere i at blive genoptaget i nerveceller i hjernen og rygmarven.
Klomipramiin ja selle peamine metaboliit desmetüülklomipramiin takistavad organismis mõnede neurotransmitterite tagasihaaret peaaju ja seljaaju närvirakkudesse.