Tilfælde af interstitiel lungesygdom (herunder pneumonitis og sjældent bronchiolit og pulmonal fibrose), nogle dødelige, uden identificeret smitsom ætiologi er opstået hos patienter, som fik immunosupressive behandlinger, herunder Rapamune.
10 Immunosupressiivseid aineid, k. a Rapamune, tarvitavatel patsientidel on esinenud ebaselge infektsioosse etioloogiaga interstitsiaalse kopsuhaiguse juhte (pneumoniit, harvaesinev oblitereeriv bronhioliit organiseeruva pneumooniaga (BOOP) ja kopsufibroos), mõned neist on lõppenud letaalselt.