Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Rebif (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří chřipkové příznaky, neutropenie, lymfopenie a leukopenie (nízký počet bílých krvinek), trombocytopenie (nízký počet krevních destiček), anémie (nízký počet červených krvinek), bolest hlavy, zánět a další reakce v místě vpichu injekce a zvýšené hodnoty transamináz (jaterních enzymů).
Visbiežāk novērotās Rebif nevēlamās blakusparādības (vairāk nekā vienam pacientam no desmit) ir gripai līdzīgi simptomi, neitropēnija, limfopēnija, leikopēnija (zems balto asinsķermenīšu skaits), trombocitopēnija (zems asins plātnīšu skaits), anēmija (zems sarkano asinsķermenīšu skaits), galvassāpes, iekaisums un cita veida reakcijas injekcijas vietā, kā arī transamināžu (aknu fermentu) pieaugums.