Rezistence na efavirenz může být selektována in vitro a má za následek jednoduchou nebo vícenásobnou substituci aminokyselin u HIV- 1 RT, včetně L100I, V108I, V179D a Y181C.
Rezistence: in vitro varēja noteikt rezistenci pret efavirenzu un tā bija vienas vai vairāku aminoskābju HIV- 1 RT aizvietošana, tai skaitā L1000I, V108I un Y181C.