20 Zonisamid je metabolizován primárně redukčním štěpením benzisoxazolového kruhu výchozího léčiva prostřednictvím CYP3A4, za vzniku 2- sulfamoylacetylfenolu (SMAP), a také N- acetylací.
Zonisamīds tiek metabolizēts, galvenokārt ar tā pirmsākuma zāļu benzisoksazola gredzena reducējošu šķelšanu ar CYP3A4, izveidojot 2- sulfamoilacetilfenolu (SMAP), kā arī ar N- acetilēšanu.