Nejčastěji se vyskytující nežádoucí účinky sachinaviru (u více než deseti ze sta) užívaného v kombinaci s ritonavirem postihují trávicí trakt a obvykle se jedná o nevolnost, průjem, zvýšenou únavu, zvracení, plynatost a bolest břicha.
Lietojot sakvinavīru kopā ar ritonavīru, visbiežāk ziņotās blakusparādības (vairāk par desmit no simts) skar kuņģi un zarnu traktu, raksturīgākās no tām ir slikta dūša, caureja, nogurums, vemšana, vēdera uzpūšanās un sāpes vēderā.