Mezi biochemické faktory, které mohou indikovat dědičnou nebo získanou predispozici k tvorbě žilní nebo arteriální trombózy, patří rezistence k APC (aktivovaný protein C), hyperhomocysteinémie, deficience antitrombinu- III, deficience proteinu C, deficience proteinu S, protilátka proti fosfolipidům (protilátka proti kardiolipinu, lupus vyvolaný antikoagulancii).
Bioķīmiskie faktori, kas varētu norādīt uz iedzimtu vai iegūtu noslieci uz vēnu vai artēriju trombozi, ir rezistence pret C reaktīvo proteīnu, hiperhomocisteinēmija, antitrombīna- III nepietiekamība, C proteīna nepietiekamība, S proteīna nepietiekamība, antivielas pret fosfolipīdiem (antivielas pret kardiolipīniem, sistēmas (vilkēdes) antikoagulanti).