Indinavir neinhiboval významně eukaryotické proteázy, lidský renin, lidský cathepsin D, lidskou elastázu a lidský faktor Xa.
Indinavīrs būtiski neinhibēja cilvēku eikariotiskās proteāzes renīnu, cilvēku katepsīnu D, cilvēku elastāzi un cilvēku Xa faktoru.