Vzácně vedla léčba lidským menopauzálním gonadotropinem k tromboembolismu, adnexální torzi (komplikace zvětšení ovárií) a hemo- peritoneu.
Retos gadījumos cilvēka menopauzālā gonadotropīna terapijas laikā novērota trombembolija, olvadu sagriešanās (olnīcu palielināšanās komplikācija) un asinsizplūdums vēderplēves dobumā.