Nejčastěji hlášené nežádoucí účinky v souvislosti s léčbou azacitidinem byly hematologické reakce (71, 4%) zahrnující trombocytopenii, neutropenii a leukopenii (obvykle stupně 3- 4), gastrointestinální případy (60, 6%) zahrnující nevolnost, zvracení (obvykle stupně 1- 2) nebo reakce v místě vpichu injekce (77, 1%, obvykle stupně 1- 2).
Visbiežāk ziņotās nevēlamās blakusparādības pēc azacitidīna lietošanas bija hematoloģiskās reakcijas (71, 4%), ieskaitot trombocitopēniju, neitropēniju un leikopēniju (parasti 3. - 4. pakāpe), kuņģa- zarnu trakta traucējumi (60, 6%), ieskaitot sliktu dūšu, vemšanu (parasti 1. - 2. pakāpe), vai reakcijas injekcijas vietā (77, 1%; parasti 1. - 2. pakāpe).