Stejně jako jiné léky této skupiny bylo u ciprofloxacinu hlášeno poškození nosných kloubů mláďat živočichů.
Tāpat kā citu šīs grupas zāļu lietošanas gadījumos, ir aprakstīts, ka arī ciprofloksacīns nenobriedušiem dzīvniekiem izraisa ķermeņa masu nesošo locītavu patoloģijas.