Ve studiích in vitro bylo prokázáno, že za metabolismus nelfinaviru jsou odpovědné četné izoformy cytochromu P- 450 včetně CYP3A, CYP2C19/ C9 a CYP2D6.
In vitro nelfinavira metabolismu nodrošina vairākas citohroma P- 450 izoformas, tostarp CYP3A, CYP2C19/ C9 un CYP2D6.