Mezi nejčastější vedlejší účinky u přípravku Yondelis (pozorované u více než 1 pacienta z 10) patří zvýšené hladiny kreatinfosfokinázy v krvi (ukazatel svalového metabolismu) a kreatininu (ukazatel onemocnění ledvin), snížené hladiny albuminu v krvi (ukazatel onemocnění jater), neutropenie (nízké hladiny neutrofilů, což je typ bílých krvinek), trombocytopenie (nízké hladiny krevních destiček v krvi), anémie (nízké hladiny červených krvinek), leukopenie (nízké hladiny leukocytů, což je typ bílých krvinek), bolesti hlavy, zvracení, nauzea (nevolnost), zácpa, anorexie (nechutenství), únava, astenie (slabost), hyperbilirubinemie (vysoké hladiny bilirubinu v krvi) a zvýšené hladiny jaterních enzymů v krvi (alaninaminotransferáza, aspartátaminotransferáza, alkalická fosfatáza a gammaglutamyltransferáza).
Visbiežākās Yondelis blakusparādības (ko novēro vairāk nekā vienam pacientam no desmit) ir paaugstināta kreatīna fosfokināzes (muskuļu sabrukuma rādītāja) un kreatinīna (nieru darbības traucējumu rādītāja) koncentrācija asinīs, pazemināta albumīna koncentrācija asinīs (aknu darbības traucējumu rādītājs), neitropēnija (zems neitrofīlu, balto asinsķermenīšu veida) skaits, trombocitopēnija (zems plātnīšu skaits asinīs), anēmija (zems sarkano asinsķermenīšu skaits), leikopēnija (zems leikocītu, balto asinsķermenīšu veida, skaits), galvassāpes, vemšana, nelabums (slikta dūša), aizcietējumi, anoreksija (apetītes zudums), nogurums (sagurums), astēnija (vājums), hiperbilirubinēmija (augsts bilirubīna līmenis asinīs) un paaugstināts aknu fermentu (alanīna aminotransferāzes, aspartāta aminotransferāzes, sārmainās fosfatāzes un gamma- glutamiltransferāzes) līmenis asinīs.