Ceftriaxon je jako všechna antibiotika účinný pouze proti určitým typům bakterií.
Tāpat kā visi antibiotiskie līdzekļi, ceftriaksons ir efektīvs tikai pret dažiem baktēriju veidiem, tādēļ tas ir piemērots tikai dažu infekciju veidu ārstēšanai.