Vzhledem k mechanizmu účinku ciprofloxacin nevykazuje zkříženou rezistenci vůči jiným významným, chemicky odlišným skupinám látek, jako jsou beta- laktamová antibiotika, aminoglykosidy, tetracykliny, makrolidy a polypeptidová antibiotika, sulfonamidy, trimethoprim a nitrofurantoin.
Tās darbības mehānisma rezultātā ciprofloksacīns neuzrāda krustenisku rezistenci ar citām svarīgām, ķīmiski atšķirīgām vielu grupām, tādām kā beta - laktamāzes, antibakteriālie līdzekļi, aminoglikozīdi, tetraciklīni, makrolīdi un polipeptīdi, sulfonamīdi, trimetoprims un nitrofurantoīni.