Ačkoliv populační analýza neukázala žádný vztah mezi koncentracemi jaterních enzymů v séru a plazmatickou clearance trabektedinu, systémová expozice trabektedinu může být u pacientů s poruchou funkce jater zvýšená; proto je důležité, aby toxiticity byly pečlivě sledovány.
Lai gan pētījumos ar cilvēkiem iegūto datu analīze saikni starp aknu enzīmu koncentrāciju serumā un trabektedīna plazmas klīrensu neuzrādīja, aknu darbības traucējumi var pastiprināt trabektedīna sistēmisko iedarbību, tādēļ ir ieteicams rūpīgi kontrolēt pacienta stāvokli, lai savlaicīgi konstatētu trabektedīna toksisko iedarbību uz aknām.