Metabolismus aprepitantu probíhá ve velké míře cestou oxidace v morfolinovém kruhu a jeho postranních řetězcích a výsledné metabolity jsou pouze slabě aktivní.
Aprepitanta metabolisms noris galvenokārt oksidācijas ceļā pie morfolīnu gredzena un tā sānu ķēdēm, un rezultātā metabolīti bija tikai ar vāju aktivitāti.