V pivotní studii ICC byly hlášeny nežádoucí účinky spojené s podáním infúze anidulafunginu, tyto účinky zahrnovaly zarudnutí/ návaly horka (2, 3%), svědění (2, 3%), vyrážku (1, 5%), a kopřivku (0, 8%).
Anidulafungīna terapijas laikā novērotas ar infūziju saistītas blakusparādības; galvenajā IKK pētījumā novērotas šādas blakusparādības: pietvīkums/ karstuma viļņi (2, 3%), nieze (2, 3%), izsitumi (1, 5%) un nātrene (0, 8%).