Stejně jako u jiných antitrombotických léků, je nejčastějším vedlejším účinkem (zaznamenaným u více než 1 pacienta z 10) přípravku Refludan krvácení.
Tāpat kā citām antitrombotiskajām zālēm, visbiežāk novērotās Refludan blakusparādības (vairāk nekā 1 pacientam no 10) ir asiņošana.