Ve studiích TORO 1 a TORO 2 byly nejčastěji udávanými nežádoucími účinky průjem (výskyt u 38 pacientů, kterým byl podáván Fuzeon v kombinaci s ostatními antiretrovirotiky oproti 73 pacientům léčeným ostatními antiretrovirotiky bez Fuzeonu na 100 paciento- roků) a nevolnost (u 27 pacientů, kterým byl podáván Fuzeon v kombinaci s ostatními antiretrovirotiky oproti 50 pacientům léčeným ostatními antiretrovirotiky bez Fuzeonu na 100 paciento- roků).
TORO 1 un TORO 2 pētījumos visbiežāk novērotās blakusparādības bija caureja (38 pret 73 pacienti, kam ir blakne, uz 100 pacientu gadiem Fuzeon un optimizētas pamatterapijas (OP) gadījumā, salīdzinot ar OP) un slikta dūša (27 pret 50 pacienti, kam ir nevēlamās blakusparādības, uz 100 pacientu gadiem Fuzeon un OP gadījumā, salīdzinot ar OP).