V průběhu zkoumání přípravku ATryn byly nejběžnějšími vedlejšími účinky (zaznamenanými u 1 až 10 pacientů ze 100) závrať, bolest hlavy, krvácení (včetně krvácení v místě vpichu a pooperačního krvácení), nauzea (pocit nevolnosti) a sekrece z rány (výtok z místa operační rány).
Visbiežāk novērotās blakusparādības ATryn izpētes laikā (ko novēroja vienam līdz desmit pacientiem no simta) bija reibonis, galvassāpes, hemorāģija (asiņošana, arī asiņošana injekcijas vietā vai asiņošana pēc ķirurģiskās operācijas), slikta dūša un brūces sulošana (izdalījumi ķirurģiskā griezuma vietā).