K nežádoucím účinkům, které vedly nejčastěji k ukončení léčby entakaponem během klinických studií, patřily gastrointestinální symptomy (např. průjem, 2, 5%) a zvýšení dopaminergních nežádoucích účinků levodopy (např. dyskineze, 1, 7%).
Klīniskajos pētījumos visbiežākās blaknes, kas izraisīja entakapona lietošanas pārtraukšanu, bija gastrointestinālie simptomi (piem., caureja 2, 5%) un pastiprinātas levodopas dopamīnerģiskās blaknes (piem., diskinēzijas 1, 7%).