Mezi závažné nežádoucí účinky hlášené po uvedení přípravku na trh patřily erythema multiforme, Stevensův- Johnsonův syndrom a kožní lupus erythematosus.
Kopš imikvimoda ieviešanas ārstniecības praksē ziņots par tādām nopietnām ādas reakcijām, kā multiformas eritēma, Stīvensa– Džonsona sindroms, ādas sarkanā vilkēde.