Předběžné údaje ukazují, že je možné, aby se mezi raltegravirem a jinými inhibitory proteázy objevily přinejmenším některé stupně zkřížené rezistence.
Sākotnējie dati liecina, ka potenciāli varētu veidoties neliela krustotā rezistence starp raltegravīru un citiem integrāzes inhibitoriem.