Toxikologie mikafunginu po opakované nitrožilní dávce u potkanů a/ nebo psů ukázala nežádoucí ovlivnění jater, močového traktu, červených krvinek a samčích reprodukčních orgánů.
Mikafungīna toksikoloģijas pētījumā pēc atkārtotu intravenozu devu ievadīšanas žurkām un/ vai suņiem tika konstatēta nelabvēlīga iedarbība uz aknām, urīnceļiem, sarkanajām asins šūnām un tēviņu reproduktīvajiem orgāniem.