Na základě toho reaguje se sulfhydrylovou skupinou H+/ K+ATP- ázy, čímž vyvolává inhibici aktivity enzymu.
Lansoprazols koncentrējas parietālās šūnās un kļūst aktīvs skābajā vidē, kur tas reaģē ar H+/ K+ ATF- āzes sulfhidrila grupu, nomācot enzīma darbību.