Obráceně, amprenavir si udržuje aktivitu k některým izolátům s rezistencí k jiným inhibitorům proteázy, a tato zachovaná aktivita by závisela na počtu a typu mutací způsobujících rezistenci k inhibitorům proteázy přítomných v izolátech.
Ugyanakkor az amprenavir megtartja aktivitását néhány, más PI- kre rezisztens izolátummal szemben, és a megmaradó aktivitás az izolátumban található proteáz rezisztencia mutánsok számától és típusától függ.