Stejně jako u všech inhibitorů nukleosidové reverzní transkriptázy může Trizivir vyvolat také laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí matek užívajících Trizivir během těhotenství může vzniknout mitochondriální dysfunkce (poškození složek buněk, které vytváří energii, což může vyvolat onemocnění krve).
Mint minden más NRTI, a Trizivir is tejsavas acidózist (a tejsav felhalmozódása a szervezetben) okozhat, valamint a terhesség alatt Trizivirt szedő anyák csecsemőiben a mitokondriumok rendellenes működését (a sejtek energiatermelő komponensének károsodása, ami a vérrel összefüggő rendellenességeket okozhat) idézheti elő.