Metabolizmus Moxifloxacin prochází fází II biotransformace a je vylučován renálními a žlučovými/ fekálními cestami v nezměněné podobě a stejně jako thiosloučenina (M1) a glukuronid (M2).
A moxifloxacin II. fázisú biológiai átalakuláson megy keresztül és a vizelettel, ill. az epe- faeces utat követve részben változatlan formában részben egy szulfo (Ml), ill. glukuronid (M2) metabolit formájában ürül.