U osob, kterým byl podáván Cubicin byly v průběhu léčby a dalšího sledování nejčastěji zaznamenány tyto nežádoucí účinky: bolesti hlavy, nauzea, zvracení, průjem, mykotické infekce, vyrážka, reakce v místě infuze, zvýšená kreatin- fosfokináza (CPK) a abnormální jaterní enzymy: alanin aminotransferáza (ALT), aspartát aminotransferáza (AST), alkalická fosfatáza.
A Cubicin- nel kezelt betegeknél a kezelés során és a követési időszakban a leggyakrabban a következő nemkívánatos hatásokról számoltak be: fejfájás, émelygés, hányás, diarrhoea, gombás fertőzések, bőrkiütések, a infúzió beadási helyén fellépő reakciók, emelkedett kreatin- foszfokináz - (CPK) és kóros májenzim- értékek: alanin- aminotranszferáz (ALT), aszpartát- aminotranszferáz (AST), alkalikus foszfatáz.