Trabektedin působí tak, že se váže na DNA, což je chemická molekula, která vytváří geny, a blokuje aktivitu některých genů v lidských buňkách.
A trabektedin úgy fejti ki a hatását, hogy a DNS- hez, a géneket felépítő kémiai anyaghoz, kötődik, és ezáltal megakadályoz néhány gént abban, hogy hatásukat kifejtsék az emberi sejtekben.