Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Isentress (zaznamenané u 1 až 10 pacientů ze 100) patří insomnie (nespavost), závratě, bolesti hlavy, nadýmání břicha, bolesti břicha, zácpa, průjem, nadýmání (plynatost), nauzea (pocit nevolnosti), zvracení, hyperhidróza (nadměrné pocení), noční pocení, pruritus (svědění), vyrážka, artralgie (bolest kloubů), astenie (slabost), únava a zvýšení hladin jaterních enzymů (alaninaminotransferázy, aspartátaminotransferázy), triglyceridů (druhu tuku), kreatininkinázy (enzymu nacházejícího se ve svalech) a lipázy (enzym nacházející se ve slinivce břišní) v krvi.
Az Isentress alkalmazása során előforduló leggyakoribb mellékhatások (100 beteg közül 1- 10- nél fordult elő) az insomnia (alvászavar), a szédülés, fejfájás, hasi puffadás (felfújódás), hasfájás, székrekedés, hasmenés, haspuffadás (gázképződés), émelygés (hányinger), hányás, túlzott izzadás, éjszakai izzadás, viszketés, kiütés, izületi fájdalom, fáradtság, gyengeség, valamint a vérben magas májenzim- szint (alanin- aminotranszferáz és aszpartát- aminotranszferáz), triglicerid- szint (egyfajta zsírsav), kreatinin- kináz- szint (az izmokban található egyik enzim) és lipáz- szint (a hasnyálmirigyben található egyik enzim).