Podobně jako všechny léky, může mít i Helixate NexGen 2000 IU nežádoucí účinky, které se ale nemusí vyskytnout u každého.
Mint minden gyógyszernek, a Helixate NexGen 2000 NE készítménynek is lehetnek mellékhatásai, noha nem mindenkinél jelentkezik.