Nicméně je vulnerabilní vůči chromozomálně kódovaným efluxním pumpám pro více léků u Proteeae (viz dále) a Pseudomonas aeruginosa (efluxní systém MexXY- OprM).
Rezisztenciamechanizmus A tigeciklin képes legyőzni a két legfontosabb tetraciklinrezisztencia- mechanizmust, a riboszomális védettséget és a baktériumokból kifelé irányuló transzportmechanizmusokat (efflux); ugyanakkor érzékeny a Proteeae (lásd alább) és a Pseudomonas aeruginosa (MexXY- OprM transzportrendszer) kromoszomálisan kódolt multidrog efflux- pumpájára.