Zatímco IgM odpověď je po vakcinaci ojedinělá, pozitivní výsledky IgM- ELISA testu jsou silným indikátorem přirozené nákazy West Nile virem. V případě podezření na infekci u zvířat po vakcinaci, je potřebné otestovat IgM protilátky a stanovit, zda byla zvířata skutečně infikovaná nebo vakcinovaná.
Mivel azonban az IgM válasz a vakcinázást követően ritka, egy pozitív IgM ELISA teszt eredmény erős indikátora lehet a Nyugat- Nílusi vírussal történt természetes fertőződésnek. Ha a pozitív IgM válasz következtében a fertőződés gyanítható, kiegészítő vizsgálat vezethet annak végső eldöntéséhez, hogy az állat fertőzött vagy vakcinázott.