Mezi nejčastější vedlejší účinky u přípravku Yondelis (pozorované u více než 1 pacienta z 10) patří zvýšené hladiny kreatinfosfokinázy v krvi (ukazatel svalového metabolismu) a kreatininu (ukazatel onemocnění ledvin), snížené hladiny albuminu v krvi (ukazatel onemocnění jater), neutropenie (nízké hladiny neutrofilů, což je typ bílých krvinek), trombocytopenie (nízké hladiny krevních destiček v krvi), anémie (nízké hladiny červených krvinek), leukopenie (nízké hladiny leukocytů, což je typ bílých krvinek), bolesti hlavy, zvracení, nauzea (nevolnost), zácpa, anorexie (nechutenství), únava, astenie (slabost), hyperbilirubinemie (vysoké hladiny bilirubinu v krvi) a zvýšené hladiny jaterních enzymů v krvi (alaninaminotransferáza, aspartátaminotransferáza, alkalická fosfatáza a gammaglutamyltransferáza).
A Yondelisszel kapcsolatban leggyakrabban (10 közül egynél több betegnél) előforduló mellékhatások a vér emelkedett kreatin foszfokináz (az izom lebomlását jelző anyag) és kreatinin (egy vesebetegséget jelző anyag) szintje, csökkent albumin (egy májbetegséget jelző anyag) szintje, neutropenia (a neutrofilek, a fehérvérsejtek egy típusának alacsony száma), thrombocytopenia (alacsony trombocita szám a vérben), anaemia (alacsony vörösvérsejt szám), leucopenia (a leukociták, a fehérvérsejtek egy típusának alacsony száma), fejfájás, hányás, hányinger (rossz közérzet), székrekedés, anorexia (étvágycsökkenés), kimerültség (fáradtság), asthenia (gyengeség), hyperbilirubinaemia (a vér magas bilirubin szintje), és a vér emelkedett májenzim (alanin aminotranszferáz, aszpartát aminotranszferáz, alkalikus foszfatáz és gamma- glutamiltranszferáz) szintje.