Ve studiích in vitro bylo prokázáno, že za metabolismus nelfinaviru jsou odpovědné četné izoformy cytochromu P- 450 včetně CYP3A, CYP2C19/ C9 a CYP2D6.
In vitro, több citokróm P450 izoenzim, köztük a CYP 3A, CYP 2C19/ C9 és a CYP 2D6 végzi a nelfinavir lebontását.