Nicméně jako většina ostatních chinolonů je ciprofloxacin fototoxický u zvířat, která jsou vystavena dávkám relevantním lidským dávkám.
A ciprofloxacin a mutagenitási vizsgálatok során nem mutatott mutagén hatást, ugyanakkor, mint számos kinolon, a ciprofloxacin az emberi értékeknek megfelelő expozíció esetében az állatokban fototoxikus.