Toxikologie mikafunginu po opakované nitrožilní dávce u potkanů a/ nebo psů ukázala nežádoucí ovlivnění jater, močového traktu, červených krvinek a samčích reprodukčních orgánů.
Ismételt intravénás adagolást követően a mikafungin toxikológiája patkányoknál és/ vagy kutyáknál kedvezőtlen hatásokat mutatott a májban, a vizeletelvezető rendszerben, a vörösvértestekben és a férfi nemiszervekben.