Látky, které mohou zvyšovat riziko krvácení, by neměly být podávány současně s fondaparinuxem.
Ilyen készítmények a dezirudin, fibrinolytikumok, GP IIb/ IIIa- receptor- antagonisták, heparin, heparinoidok vagy alacsony molekulatömegű heparinkészítmények (LMWH).