Následující nežádoucí účinky, které jsou přinejmenším v možném vztahu k léčbě, byly hlášeny v klinických studiích, i když všechny reakce nebyly zkoušejícími jednoznačně přisuzovány systému IONSYS, a proto nemohla být stanovena kauzalita.
7 mellékhatásokat – melyek legalábbis lehetséges, hogy összefüggésbe hozhatók a kezeléssel – a klinikai vizsgálatok során jelentették; a vizsgálók véleménye szerint azonban ezek nem mindegyike tulajdonítható egyértelműen az IONSYS- nak, ezért ok- okozati összefüggés nem állapítható meg.