Fondaparinux se neváže na destičkový faktor 4 a nereaguje zkříženě se sérem pacientů s heparinem vyvolanou trombocytopenií (HIT) typu II.
Heparin indukálta thrombocytopeniában szenvedő betegek A fondaprinux nem kötődik a thrombocyta IV. faktorhoz és nem ad keresztreakciót a II- es típusú heparin indukálta thrombocytopeniában (HIT) szenvedő betegek szérumával.