Stejně jako všechny ostatní NRTI také přípravek Emtriva může způsobit laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí matek užívajících přípravek Emtriva během těhotenství mitochondriální dysfunkci (poškození složek buněk, jež tvoří energii, které může způsobit problémy s krví).
Minden egyéb NRTI- hez hasonlóan az Emtriva is okozhat tejsavas acidózist (a tejsav felhalmozódása a vérben), illetve a terhességük idején Emtriva- t szedő nők gyermekeinél mitokondriális diszfunkciót (a sejtek energiatermelő alkotórészeinek károsodása, amely problémákat okozhat a vérben) okozhat.