Nejčastějšími nežádoucími účinky, které se vyskytly u pacientů léčených antiretrovirovými přípravky včetně nebo mimo Fuzeonu, jsou vyjma reakce v místě vpichu, průjem a nevolnost.
Az injekció beadásának helyén fellépő reakciókat kivéve a leggyakoribb mellékhatások, melyek a Fuzeon- nal vagy anélkül történő antiretrovirális kezelés során előfordulnak, a hasmenés és az émelygés volt.