Alternativní diagnóza invazivními endoskopickými metodami může být indikována za účelem zjištění dalších komplikací, například žaludečního vředu, autoimunní gastritidy a malignity.
Invazív endoszkópos módszerekkel végzett alternatív diagnózisra lehet szükség bármilyen más, komoly betegség jelenlétének vizsgálata céljából, ilyen például a gyomorfekély, az autoimmun gastritis és a rosszindulatú daganat.