Nelfinavir je metabolizován především prostřednictvím izoenzymů CYP3A a CYP2C19 (viz bod 5. 2) cytochromu P450.
A nelfinavir elsősorban a citokróm P450 izoenzimjein a CYP 3A- n és CYP 2C19en keresztül metabolizálódik (lásd 5. 2 pontot).