Mimo to bylo v in vitro studiích prokázáno, že saqchinavir je substrátem a inhibitorem P- glykoproteinu (P- gp), proto všechny ostatní léky, které jsou buď rovněž metabolizovány touto cestou nebo které ovlivňují aktivitu izoenzymu CYP3A4 a/ nebo P- gp, (viz "Další možné interakce") mohou ovlivňovat farmakokinetiku sachinaviru.
Ezért azok a gyógyszerkészítmények, melyek szintén ezen az úton metabolizálódnak, vagy melyek módosítják a CYP 3A4 és/ vagy P- gp aktivitást (lásd Egyéb lehetséges kölcsönhatások), módosíthatják a szakinavir farmakokinetikáját.