V rámci studií byly nejběžnějšími vedlejšími účinky přípravku Gardasil (zaznamenanými u více než 1 pacientky z 10) pyrexie (horečka) a reakce v místě vpichu (zarudnutí, bolest a otok).
A Gardasil alkalmazása során előforduló leggyakoribb (10 betegből több mint 1- nél fordult elő) mellékhatások a láz és az injekció beadásának helyén kialakuló reakciók (bőrpír, fájdalom és duzzanat).