Podobně jako u jiných léků pro léčbu HIV existuje u pacientů užívajících přípravek Atripla zvýšené riziko lipodystrofie (změny rozložení tuku v těle), osteonekrózy (odumření kostní tkáně) nebo syndromu imunitní reaktivace (příznaky infekce způsobené zotavujícím se imunitním systémem).
Más HIV- ellenes gyógyszerekhez hasonlóan az Atripla- t szedő betegeknél is fokozódhat a lipodisztrófia (a testzsírállomány eloszlásának megváltozása), az oszteonekrózis (a csontszövet elhalása), illetve az immun reaktivációs szindróma (a gyógyuló immunrendszer által kiváltott fertőzéses tünetek) kialakulásának kockázata.