20 Zonisamid je metabolizován primárně redukčním štěpením benzisoxazolového kruhu výchozího léčiva prostřednictvím CYP3A4, za vzniku 2- sulfamoylacetylfenolu (SMAP), a také N- acetylací.
A zoniszamid metabolizációja elsősorban az anyavegyület benzizoxazol- gyűrűjének reduktív hasítása útján történik, amelyet a CYP3A4 idéz elő 2- szulfamoil- acetil- fenol (SMAP) képződése közben, valamint N- acetiláció útján.