Rezistence na fluorochinolony se objevuje díky chromozomální mutaci třemi mechanismy: poklesem permeability buněčné stěny, expresí efflux- pumpy nebo mutací enzymů odpovědných za molekulární vazné místo.
A fluoroquinolonokkal szemben fellépő bakteriális rezisztencia kromoszóma mutációk révén, három módon alakulhat ki: csökken a bakteriális sejtfal permeábilitása, aktiválódik a sejt efflux pumpa mechanizmusa, vagy mutálódnak a molekula kötődéséért felelős enzimek.