Třebaže mezi režimy obsahujícími abakavir a indinavir byl pozorován podobný protivirový efekt, pokud jde o podíl pacientů s nedetegovatelnou virovou zátěží [≤ 400 kopií/ ml; při analýze „ intention to treat “ (ITT) (tj. analýze všech randomizovaných subjektů) 47% pacientů přidělených k léčbě kombinací obsahující abakavir oproti 49% pacientů přidělených k léčbě kombinací obsahující indinavir; při analýze „ as treated “ (AT) (tj. analýze skutečně odléčených subjektů) 86% pacientů léčených kombinací obsahující abakavir oproti 94% pacientů léčených kombinací obsahující indinavir], výsledky favorizovaly kombinaci s indinavirem, obzvláště v subpopulaci pacientů s vysokou virovou zátěží (s výchozí hodnotou > 100 000 kopií/ ml; při analýze ITT 46% pacientů přidělených k léčbě kombinací obsahující abakavir oproti 55% pacientů přidělených k léčbě kombinací obsahující indinavir; při analýze AT 84% pacientů léčených kombinací obsahující abakavir oproti 93% pacientů léčených kombinací obsahující indinavir).
Bár az abakavirt és indinavirt tartalmazó kezelésben részesülő csoportok között hasonló antivirális hatást figyeltek meg azon betegek aránya alapján, akiknél a plazma vírusterhelése a kimutathatósági határ alatt volt (400 kópia/ ml; az intention to treat (ITT) analízis alapján ez az arány 47% versus 49%, míg az as treated (AT) analízisben 86% versus 94% az abakavir és az indinavir kombinációk esetében, ebben a sorrendben), az indinavir- kombináció kedvezőbb eredményeket mutatott, különösen a betegek azon alcsoportjában, akiknél magas volt a vírusterhelés (> 100. 000 kópia/ ml a vizsgálat kezdetén; ITT analízis alapján 46% versus 55%; AT analízis alapján 84% versus 93% az abakavir, illetve az indinavir esetében, ebben a sorrendben).