V těle zvířete klomipramin a jeho hlavní metabolit, desmethylklomipramin, zabraňují zpětnému vychytávání některých neurotransmiterů do nervových buněk v mozku a míše.
A szervezetben a klomipramin és fő metabolitja, a dezmetil- klomipramin megakadályozza, hogy az agyban és a gerincvelőben található idegsejtek visszavegyenek bizonyos neurotranszmittereket.