Přesto, stejně jako u jiných látek ovlivňujících renin- angiotensinový systém, existuje zvýšené riziko závažné hypotenze a renální insuficience včetně selhání ledvin, jestliže jsou pacienti se stenózou renální arterie léčeni aliskirenem.
Mindazonáltal a renin- angiotenzin rendszerre ható egyéb gyógyszerekhez hasonlóan, fokozott a vesekárosodás (beleértve a veseelégtelenséget) kockázata, ha a veseartéria szűkületben szenvedő betegeket aliszkirennel kezelik.