Jako u jiných fluorochinolonů by neměl být vzhledem k možnému nežádoucímu účinku na chrupavku některých kloubů difloxacin používán u rychle rostoucích psů.
A difloxacin más fluorkinolonokhoz hasonlóan nem alkalmazható gyors növekedésben levő kutyáknál, mivel néhány ízület porcára hatással lehet.