Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Pegasys (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří anorexie (ztráta chuti k jídlu), bolesti hlavy, insomnie (potíže se spánkem), podrážděnost, deprese, závratě, nauzea (pocit nevolnosti), průjem, bolesti břicha, alopecie (vypadávání vlasů), pruritus (svědění), myalgie (bolest svalů), artralgie (bolest kloubů), únava, pyrexie (horečka), zimnice (mrazení s třesem), reakce v místě aplikace injekce a bolesti.
A Pegasys leggyakoribb (10 betegből 1- nél több esetében előforduló) mellékhatásai az étvágytalanság, a fejfájás, az álmatlanság, az ingerlékenység, a depresszió, a szédülés, az émelygés (rosszullét), a hasmenés, a hasi fájdalom, a hajhullás, a viszketés, az izomfájdalom, az ízületi fájdalom, a fáradtság, a láz, a hidegrázás, az injekció helyén kialakuló reakciók és a fájdalom.