Protože se zonisamid a jeho metabolity vylučují ledvinami, měl by být vysazen u pacientů, u nichž dojde k akutnímu renálnímu selhání nebo kde bude pozorováno klinicky významné trvalé zvýšení kreatininu v séru.
Mivel a zoniszamid és metabolitjai a vesékben választódnak ki, olyan betegeknél, akiknél akut veseelégtelenség alakul ki, vagy akiknél a szérum kreatinin- szintje klinikailag jelentős, tartós emelkedést mutat, a gyógyszer szedését meg kell szakítani.