Podobně jako u jiných léků proti HIV mohou být pacienti užívající přípravek Combivir vystaveni také riziku lipodystrofie (změny v rozložení tělesného tuku), osteonekrózy (odumírání kostní tkáně) nebo syndromu imunitní reaktivace (příznaky infekce způsobené zotavujícím se imunitním systémem).
Mint más HIV fertőzés elleni gyógyszereknél, a Combivir- t szedő betegeknél is megnövekedhet a lipodisztrófia (a test zsírszöveteinek átrendeződése), az oszteonekrózis (a csontszövet elhalása) vagy az immunreaktívációs szindróma (a gyógyuló immunrendszer által okozott fertőzés tünetei) kockázata.