Přípravek Kivexa stejně jako všechny ostatní nukleosidové inhibitory reverzní transkriptázy může způsobovat laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí, jejichž matky užívají přípravek Kivexa v těhotenství, dysfunkci mitochondrií (poškození částí buněk, které produkují energii, jež může způsobit poruchy krve).
Mint minden más NRTI, a Kivexa is tejsavas acidózist (a tejsav felhalmozódása a szervezetben) okozhat, valamint a terhesség alatt Kivexát szedő anyák csecsemőiben a mitokondriumok rendellenes működését (a sejtek energia termelő komponensének károsodása, ami vérrel kapcsolatos rendellenességeket okozhat) válthatja ki.