Užívání následujících léčiv souběžně s přípravkem Agenerase je možné pouze na výslovné doporučení lékaře: anestetika (např. lidokain), antibiotika (např. rifabutin, klarithromycin, dapson a erythromycin), protiplísňová léčiva (např. ketokonazol, itrakonazol), antimalarika (např. halofantin), protikřečová léčiva (např. karbamazepin, fenytoin a fenobarbital), blokátory vápníkových kanálů (např. amlodipin, diltiazem, felodipin, isradipin, nikardipin, nifedipin, nimodipin, nisoldipin a verapamil), léčiva snižující hladiny cholesterolu (např. atorvastatin, lovastatin a simvastatin), léčiva pro léčbu erektilní dysfunkce (např. sildenafil a vardenafil), nenukleosidové inhibitory reverzní transkriptázy (např. delavirdin, efavirenz a nevirapin), opioidy (např. methadon), hormony jako estrogeny a gestageny (např. hormonální antikonceptiva, perorální), některé glukokortikoidy (např. flutikason- propionát a budesonid), tricyklické antidepresiva (např. desipramin a nortriptylin), sedativa (např. midazolam podávaný injekčně) a další léčiva (např. klozapin a loratadin).
Az alábbiakban felsorolt gyógyszerek Agenerase- zal együtt történő alkalmazására csak orvosi javaslat alapján kerülhet sor: érzéstelenítők (pl. lidokain), antibiotikumok (pl. rifabutin, klaritromicin, dapszon és eritromicin), gombaellenes szerek (pl. ketokonazol, itrakonazol), malária elleni szerek (pl. halofantrin), antikonvulzív (görcsoldó) készítmények (pl. karbamazepin, fenitoin és fenobarbitál), kalcium- csatorna blokkolók (pl. amlodipin, diltiazem, felodipin, izradipin, nikardipin, nifedipin, nimodipin, nizoldipin és verapamil), koleszterinszint csökkentők (pl. atorvasztatin, lovasztatin és szimvasztatin), a merevedési zavarokra ható szerek (pl. szildenafil és vardenafil), nem nukleozid reverz transzkriptáz gátlók (pl. delavirdin, efavirenz és nevirapin), ópiát származékok (pl. metadon), hormonok mint az ösztrogének és progesztogének (pl. hormonális fogamzásgátlók, így a „ tabletták ”), egyes glükokortikoidok (pl. flutikazon- propionát és budezonid), triciklikus antidepresszánsok (pl. dezipramin és nortriptilin), nyugtatószerek (pl. injekcióban alkalmazott midazolám), és néhány egyéb gyógyszer (pl. klozapin és loratadin).