Na základě údajů od 25 pacientů dosud neléčených antiretrovirotiky, u kterých selhává léčba fosamprenavirem (z nichž jeden byl již před zahájením léčby rezistentní vůči lopinaviru a saquinaviru a další vůči tipranaviru), vedly cesty rezistence spojené s amprenavirem k omezené zkřížené rezistenci k atazanaviru/ ritonaviru (tři z 25 izolátů), darunaviru/ ritonaviru (čtyři z 25 izolátů), indinaviru/ ritonaviru (jedenz 25 izolátů), lopinaviru/ ritonaviru (tři z 24 izolátů), saquinaviru (tři z 24 izolátů) a tipranaviru/ ritonaviru (čtyři z 24 izolátů).
Huszonöt, antiretrovirális kezelésben még nem részesült és fozamprenavirt tartalmazó terápiával sikertelenül kezelt beteg (akik közül egy már a kiinduláskor rezisztenciát mutatott a lopinavirrel és szakvinavirrel, egy másik pedig tipranavirrel szemben) adatai alapján, az amprenavirral kapcsolatos rezisztencia kialakulási útvonalakon korlátozott keresztrezisztencia jön létre az alábbiakkal szemben: atazanavir/ ritonavir (25 izolátumból háromban), darunavir/ ritonavir (25 izolátumból négyben), indinavir/ ritonavir (25 izolátumból egyben), lopinavir/ ritonavir (24 izolátumból háromban), szakvinavir (24 izolátumból háromban) és tipranavir/ ritonavir (24 izolátumból négyben).