Metabolismus Palonosetron je odbouráván dvojí cestou, přibližně 40% se odbourává ledvinami a dalších přibližně 50% se metabolizuje za vzniku dvou primárních metabolitů, které mají méně než 1% aktivity palonosetronu jakožto antagonisty receptoru 5HT3.
40% - ban a vesén keresztül, és körülbelül 50% - ban két elsődleges metabolitot képezve, melyek a palonozetron 5HT3 receptor- antagonista aktivitásának kevesebb mint 1% - ával rendelkeznek.