Selektivní vazbou na ATIII fondaparinux zesiluje (asi 300x) přirozenou neutralizaci faktoru Xa ATIII.
Az ATIII- hoz történő szelektív kötődéssel a fondaparinux (mintegy 300- szorosára) fokozza ho az ATIII meglévő Xa- Faktort neutralizáló képességét.