Bylo zjištěno, že sapropterin má slabé mutagenní účinky u bakteriálních buněk a v plicích a ovariálních buňkách čínského křečka byly detekovány zvýšené chromozomální aberace.
Sapropterin erwies sich als schwach mutagen in Bakterienzellen und ein Anstieg von Chromosomenabberationen wurde in Lungen- und Ovarialzellen des chinesischen Hamsters festgestellt.