Zonisamid je částečně metabolizován CYP3A4 (redukční štěpení) a rovněž N- acetyltransferázami a konjugací s glukuronovou kyselinou.
Zonisamid wird teilweise über CYP3A4 (reduktive Spaltung) sowie über N-acetyl-Transferase und Konjugation mit Glukuronsäure metabolisiert.