Interakce s kombinací indinavir/ ritonavir nebyla studována Ritonavir indukuje glukuronidaci, v důsledku toho se předpokládá, že snižuje plasmatické koncentrace atovaquonu.
Wechselwirkung mit Indinavir/Ritonavir nicht untersucht Ritonavir induziert Glukuronidierung, daher wird erwartet, dass die Plasmakonzentrationen von Atovaquon erniedrigt werden.