Stejně jako všechny ostatní NRTI také přípravek Emtriva může způsobit laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí matek užívajících přípravek Emtriva během těhotenství mitochondriální dysfunkci (poškození složek buněk, jež tvoří energii, které může způsobit problémy s krví).
Wie bei allen anderen NRTIs kann auch Emtriva eine Lactatazidose (Milchsäure-Überschuss im Körper) sowie bei Babys, deren Mütter während der Schwangerschaft Emtriva eingenommen haben, eine mitochondriale Dysfunktion verursachen (Schädigung der Mitochondrien, der „ Kraftwerke der Zelle“, die zu Blutproblemen führen kann).