K velmi častým nežádoucím účinkům (u více než jedné osoby z deseti) patří bolest a pocit necitlivosti v rukou či nohou a ztráta hmotnosti.
Außer den Reaktionen an der Injektionsstelle sind die am häufigsten berichteten Nebenwirkungen bei Patienten, die eine antiretrovirale Behandlung mit oder ohne Fuzeon erhalten hatten, Diarrhö und Übelkeit.