Předběžné údaje ukazují, že je možné, aby se mezi raltegravirem a jinými inhibitory proteázy objevily přinejmenším některé stupně zkřížené rezistence.
11 Vorläufige Daten deuten auf eine mögliche Kreuzresistenz zwischen Raltegravir und anderen Integrasehemmern, wenigstens bis zu einem gewissen Grad, hin.