Bylo zjištěno, že sapropterin má slabé mutagenní účinky u bakteriálních buněk a v plicích a ovariálních buňkách čínského křečka byly detekovány zvýšené chromozomální aberace.
Sapropterin fandtes svagt mutagent i bakterieceller og en øget kromosomafvigelse sås i lunge - og ovarieceller hos Chinese hamster.