Jestliže se Rapamune užívá současně s léky zvanými inhibitory kalcineurinu (cyklosporin nebo takrolimus), může se zvýšit riziko poškození ledvin se sníženým počtem krevních destiček a červených krvinek s vyrážkou nebo bez ní (trombocytopenická purpura/ hemolyticko- uremický syndrom).
Hvis Rapamune tages sammen med medicin kaldet calcineurinhæmmere (cyclosporin eller tacrolimus) kan det muligvis øge risikoen for nyreskade med et lavt antal blodplader og røde blodlegemer, men eller uden udslæt (trombocytopenisk purpura/ hæmolytisk uræmisk syndrom)