Oproti systémově podávanému cytarabinu, který je rychle metabolizován na ara- U, je konverze na ara- U v cerebrospinální tekutině po intratekálním podání zanedbatelná, a to kvůli významně nižší aktivitě cytidindeaminázy ve tkáních centrálního nervového systému a v cerebrospinální tekutině.
I modsætning til systemisk administreret cytarabin, som hurtigt metaboliseres til ara- U, er omdannelsen til ara- U i cerebrospinalvæsken ubetydelig efter intratekal indgift p. g. a. den signifikant lavere cytidin - deaminaseaktivitet i CNS- væv og cerebrospinalvæske.