Jestliže je nateglinid podáván společně s dalšími více účinnými inhibitory CYP2C9, např. flukonazolem nebo gemfibrozilem nebo u pacientů, o kterých je známo, že špatně metabolizují enzymem CYP2C9, se doporučuje zvláštní opatrnost.
Særlig forsigtighed anbefales når nateglinid administreres sammen med andre mere potente CYP2C9 - hæmmere, f. eks. fluconazol eller gemfibrozil, eller hos patienter, der er kendt for at være dårlige til at metabolisere CYP2C9.