V rámci studií byly nejběžnějšími vedlejšími účinky přípravku Gardasil (zaznamenanými u více než 1 pacientky z 10) pyrexie (horečka) a reakce v místě vpichu (zarudnutí, bolest a otok).
I undersøgelserne var de mest almindelige bivirkninger ved Gardasil (forekom hos mere end 1 ud af 10) pyreksi (feber) og reaktioner på injektionsstedet (rødmen, smerter, hævelse).