K nežádoucím účinkům, které vedly nejčastěji k ukončení léčby entakaponem během klinických studií, patřily gastrointestinální symptomy (např. průjem, 2, 5%) a zvýšení dopaminergních nežádoucích účinků levodopy (např. dyskineze, 1, 7%).
I kliniske studier har den mest almindelige bivirkning, der har ført til afbrydning af behandlingen med entakapon, været symptomer fra mave- tarmkanalen (f. eks. diarré 2, 5%) og øget dopaminerg bivirkning af levodopa (f. eks. dyskinesi 1, 7%).