Na základě toho reaguje se sulfhydrylovou skupinou H+/ K+ATP- ázy, čímž vyvolává inhibici aktivity enzymu.
Lansoprazol er koncentreret i parietalcellerne og bliver aktiv i deres syrlige miljø, hvorefter det reagerer med sulfydrylgruppen i H+/ K+ATPase, hvilket medfører hæmning af enzymaktiviteten.