Stejně jako u všech inhibitorů nukleosidové reverzní transkriptázy může Trizivir vyvolat také laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí matek užívajících Trizivir během těhotenství může vzniknout mitochondriální dysfunkce (poškození složek buněk, které vytváří energii, což může vyvolat onemocnění krve).
Trizivir kan ligesom alle andre NRTI’ er medføre ophobning af mælkesyre i kroppen, og nyfødte, hvis mødre har fået Trizivir under graviditeten, kan udvikle mitokondriel dysfunktion (beskadigelse af de energiproducerende cellebestanddele med blodproblemer til følge).