U osob, kterým byl podáván Cubicin byly v průběhu léčby a dalšího sledování nejčastěji zaznamenány tyto nežádoucí účinky: bolesti hlavy, nauzea, zvracení, průjem, mykotické infekce, vyrážka, reakce v místě infuze, zvýšená kreatin- fosfokináza (CPK) a abnormální jaterní enzymy: alanin aminotransferáza (ALT), aspartát aminotransferáza (AST), alkalická fosfatáza.
Hos de patienter, der blev behandlet med Cubicin, blev de efterfølgende bivirkninger nævnt oftest under behandlingen samt ved follow- up: hovedpine, kvalme, opkastning, diarré, svampeinfektioner, udslæt, reaktioner på infusionsstedet, forhøjet kreatinfosfokinase (CPK) og abnorme leverenzymer, alanin- amino- transferase (ALAT), aspartat- amino- stransferase (ASAT), alkalinfosfatase.