Metabolismus Palonosetron je odbouráván dvojí cestou, přibližně 40% se odbourává ledvinami a dalších přibližně 50% se metabolizuje za vzniku dvou primárních metabolitů, které mají méně než 1% aktivity palonosetronu jakožto antagonisty receptoru 5HT3.
50% metaboliseres, således at der dannes to primære metabolitter, som har mindre end 1% af palonosetrons 5HT3 receptor antagonistvirkning.