Vedlejší účinky se u pacientů užívajících přípravek Circadin nevyskytují často, ale mezi nejčastější vedlejší účinky (pozorované u 1 z 10 až 1 z 1 000 pacientů) patří podrážděnost, nervozita, neklid, nespavost, abnormální sny, migréna, psychomotorická hyperaktivita (neklid se zvýšenou aktivitou), závratě, ospalost, bolest břicha, zácpa, sucho v ústech, hyperbilirubinémie (zvýšené hladiny bilirubinu v krvi, což je rozpadový produkt červených krvinek, který vyvolává zažloutnutí kůže a očí), hyperhidróza (nadměrné pocení), astenie (slabost) a zvýšení tělesné hmotnosti.
Bivirkninger er sjældne hos patienter, der behandles med Circadin, men de mest almindelige bivirkninger (set hos mellem 1 og 10 ud af 1. 000 patienter) er irritabilitet, nervøsitet, rastløshed, søvnløshed, abnorme drømme, migræne, psykomotorisk hyperaktivitet (rastløshed i forbindelse med øget aktivitet), svimmelhed, somnolens (døsighed), mavepine, forstoppelse, mundtørhed, hyperbilirubinæmi (forhøjede niveauer i blodet af bilirubin som er et nedbrydningsprodukt fra røde blodlegemer, og som kan medføre, at huden og det hvide i øjnene bliver farvet gul), hyperhidrose (kraftig svedproduktion), asteni (følelse af svaghed) samt vægtforøgelse.