Ammonaps se používá spolu s jinými typy léčby a zvláštní dietou k dlouhodobé léčbě pacientů s poruchami metabolismu močoviny, kteří mají nedostatek jednoho nebo více z následujících enzymů: karbamoylfosfátsyntetáza, ornitin- karbamoyltransferáza nebo argininsukcinátsyntetáza.
Ammonaps anvendes sideløbende med andre behandlinger og med en særlig diæt til langtidsbehandling af patienter, der lider af forstyrrelser i urinstofcyklus og mangler et eller flere af følgende enzymer: carbamylfosfat syntetase, ornithin transcarbamylase eller argininosuccinat syntetase.