Podobně jako všechny léky, může mít i přípravek CellCept nežádoucí účinky, které se ale nemusí vyskytnout u každého. Častěji se může vyskytnout průjem, snížení počtu bílých nebo červených krvinek, infekce a zvracení.
Nogle af de mere almindelige problemer er diarré, nedsat antal hvide og/ eller røde blodlegemer, infektion og opkastning.