Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Ziagen (zaznamenané u 1 až 10 pacientů ze 100) patří anorexie (ztráta chuti k jídlu), bolest hlavy, nauzea (pocit nevolnosti), zvracení, průjem, vyrážka, horečka, letargie (nedostatek energie) a únava.
De mest almindelige bivirkninger ved behandling med Ziagen (observeres blandt 1 til 10 patienter ud af 100) er anoreksi (appetitløshed), hovedpine, kvalme, opkast, diarré, udslæt, feber, apati (mangel på energi) og træthed.