Sildenafil má především více jak 4000- násobnou selektivitu k PDE5 než k PDE3, izoformě fosfodiesterázy specifické k cAMP, zapojené do kontroly srdeční kontraktility.
Især har sildenafil mere end 4. 000 gange større selektivitet for PDE5 end for PDE3, den cAMP- specifikke fosfodiesteraseisoform, som er involveret i kontrollen af hjertets kontraktilitet.