Най- честите нежелани реакции при Isentress (наблюдавани при 1 до 10 пациенти на 100) са безсъние (нарушения на съня), замаяност, главоболие, подуване на корема, абдоминални (коремни) болки, запек, диария, флатуленция (газове), гадене (позиви за повръщане), повръщане, хиперхидроза (прекомерно потене), нощно изпотяване, пруритус (сърбеж), обрив, артралгия (болки в ставите), астения (слабост), умора (отпадналост) и повишени нива в кръвта на чернодробните ензими (аланин аминотрансфераза и аспартат аминотрасфераза), триглицеридите (вид мазнини), креатинин киназата (ензим, намиращ се в мускулите) и липазата (ензим, намиращ се в панкреаса).
Najčastejšie vedľajšie účinky lieku Isentress (pozorované u 1 až 10 pacientov zo 100) sú insomnia (problémy so spánkom), závraty, bolesť hlavy, abdominálna distenzia (nadúvanie), abdominálna (brušná) bolesť, zápcha, hnačka, flatulencia (plynatosť), nauzea (nevoľnosť), zvracanie, hyperhidróza (nadmerné potenie), potenie v noci, pruritus (svrbenie), vyrážky, artralgia (bolesť kĺbov), asténia (slabosť), únava a zvýšené hladiny pečeňových enzýmov v krvi (alanínaminotransferáza a aspartátaminotransferáza), triglyceridov (typ tuku), kreatínkinázy (enzým nachádzajúci sa vo svaloch) a lipázy (enzým produkovaný pankreasom).