Поради повишения риск нежелани странични ефекти (вж. по- нататъка в тази част за аниепилептични лекарства), трябва да се внимава, ако клиничните обстоятелства изискват комбинирането на стирипентол с лекарства, метаболизирани от CYP2C19 (напр., циталопрам, омепразол) или CYP3A4 (напр., няколко HIV протеазни инхибитори, антихистамини, астемизол, хлорфенирамин, блокери на калциевите канали, статини, орални контрацептиви, кодеин).
Opatrnosť je nevyhnutná, ak si klinické okolnosti vyžadujú kombináciu stiripentolu s liekmi metabolizovanými CYP2C19 (napr. citalopram, omeprazol) alebo CYP3A4 (napr. inhibítory HIV proteázy, antihistaminiká ako astemizol, chlórfeniramín, blokátory kalciových kanálov, statíny, perorálna antikoncepcia, kodeín) kvôli zvýšenému riziku nežiaducich udalostí (pozri ďalej časť o antiepileptickych liekoch).