Етанерцепт може също да модулира биологичните отговори, контролирани от допълнителни молекули по- надолу в сигналния път (напр. цитокини, адхезионни молекули или протеинази), които се индуцират или регулират от TNF.
Etanercept môže tiež modulovať biologické odpovede kontrolované ďalšími molekulami zápalovej kaskády (napr. cytokíny, adhezívne molekuly alebo proteinázy), ktoré sú indukované alebo regulované prostredníctvom TNF.