Преминаването през кръвно- мозъчната бариера на анидулафунгин е било ограничено при здрави плъхове; въпреки това при зайци с дисеминирана кандидиаза анидулафунгин е показал, че преминава кръвно- мозъчната бариера и намалява гъбичките в мозъка.
Prienik anidulafungínu hematoencefalickou bariérou bol u zdravých potkanov limitovaný; avšak u králikov s diseminovanou kandidózou anidulafungín vykazoval prienik hematoencefalickou bariérou a redukoval mykotickú nálož v mozgu.