Нежеланите лекарствени реакции, които са възниквали по- често при бозентан, отколкото при плацебо (≥ 3% от приемащите бозентан пациенти, с ≥ 2% разлика), са били главоболие (15, 8% срещу 12, 8%), зачервяване (6, 6% срещу 1, 7%), абнормна чернодробна функция (5, 9% срещу 2, 1%), оток на краката (4, 7% срещу,. 4%) и анемия (3, 4% срещу 1, 0%), като всички са били дозозависими.
Nežiaduce účinky liečiva, ktoré sa častejšie objavili v skupine s bosentanom než v skupine s placebom (≥ 3% pacientov liečených bosentanom, s ≥ 2% rozdielom), boli bolesti hlavy (15, 8% oproti 12, 8%), sčervenanie (6, 6% oproti 1, 7%), abnormálna funkcia pečene (5, 9% oproti 2, 1%), opuchy dolných končatín (4, 7% oproti 1, 4%) a anémia (3, 4% oproti 1, 0%), pričom všetky záviseli od dávky.