Механизмът на взаимодействие не е изяснен и тъй като с атоваквон суспензия могат да бъдат достигнати по- високи концентрации на атоваквон, възможно е когато атоваквон се прилага като суспензия да се индуцират по - големи промени в стойностите на AUC на зидовудин.
Spôsob interakcie nie je známy a keďže pri používaní suspenzie atovakvónu sa môžu dosiahnuť vyššie koncentrácie atovakvónu, pri podávaní atovakvónu vo forme suspenzie môže dôjsť k väčším zmenám hodnôt AUC zidovudínu.