Метаболизирането на азацитидин става чрез спонтанна хидролиза и чрез дезаминиране, осъществено от цитидин дезаминазата.
Metabolizmus azacitidínu sa uskutočňuje formou spontánnej hydrolýzy a deaminácie sprostredkovanej cytidín- deaminázou.