Въпреки че е установен сходен противовирусен ефект по отношение на% пациенти с вирусно натоварване под прага на измерване (< 400 копия/ ml; intention to treat analysis (ITT), 47% и 49%; as treated analysis (AT) 86% и 94% за абакавир и индинавир съответно) на терапевтичните схеми, включващи абакавир или индинавир, резултатите са в полза на индинавир комбинацията, особено по отношение на пациентите с високо вирусно натоварване (> 100 000 копия/ ml в началото на терапията; ITT, 46% и 55%; AT, 84% и 93% за абакавир и индинавир съответно).
Hoci medzi režimami obsahujúcimi 31 abakavir a indinavir bol pozorovaný podobný protivírusový účinok, pokiaľ ide o podiel pacientov s nedetekovateľnou vírusovou záťažou (≤400 kópií/ ml; pri analýze ITT 47% pacientov pridelených k liečbe kombináciou obsahujúcou abakavir oproti 49% pacientov liečených kombináciou obsahujúcou indinavir; pri analýze skutočne odliečených subjektov (as treated, AT) 86% pacientov liečených kombináciou obsahujúcou abakavir oproti 94% pacientov liečených kombináciou obsahujúcou indinavir, výsledky favorizovali kombináciu s indinavirom, obzvlášť v subpopulácii pacientov s vysokou vírusovou záťažou (s bazálnou hodnotou > 100 000 kópií/ ml); pri analýze ITT 46% pacientov pridelených k liečbe kombináciou obsahujúcou abakavir oproti 55% pacientov pridelených k liečbe kombináciou obsahujúcou indinavir; pri analýze AT 84% pacientov liečených kombináciou abakavir oproti 93% liečených kombináciou obsahujúcou indinavir).