Ципрофлоксацин може да потисне екскрецията на метотрексат през бъбреците, водейки до повишаване нивото на метотрексат в кръвта.
Ciprofloxacín môže inhibovať vylučovanie metotrexátu obličkami, čo spôsobuje zvýšenie hladiny metotrexátu v krvi.