В урината, черният дроб, сланината и бъбреците метаболити на диметил- дифлоксацин и дифлоксацин N - окис се срещат в минимални количества.
V moči, v pečeni, v tuku a v obličkách sa okrem pôvodnej látky náchádzajú v malom množstve metabolity desmetyl- difloxacínu a difloxacín N- oxidu.