В допълнение, клофарабин притежава по- голяма резистентност към клетъчно разграждане от аденозин деаминазата и намалена податливост към фосфоролитично отцепване, отколкото другите активни вещества от своя клас, докато афинитетът на клофарабин трифосфат към ДНК полимераза α и рибонуклеотид редуктазата е подобен или е по- голям от този на дезоксиаденозин трифосфата.
Okrem toho klofarabín má vyššiu odolnosť proti bunkovej degradácii adenozín deaminázou a znížený sklon k fosforolytickému štepeniu ako iné liečivá jeho triedy, zatiaľ čo afinita klofarabín trifosfátu na DNA polymerázu α a na ribonukleotid reduktázu je podobná alebo väčšia ako afinita deoxyadenozín trifosfátu.