Тъй като сапроптерин дихидрохлорид е синтетичен вариант на срещания в природата 6R- BH4, може логично да се очаква да претърпява същия метаболизъм, включително и регенериране на 6R- BH4.
Keďže dihydrochlorid sapropterínu je syntetickou verziou prirodzene sa vyskytujúceho 6R- BH4, predpokladá sa, že bude podstupovať rovnaký metabolizmus, vrátane regenerácie 6R- BH4.