В резистентните към хинолон клинични щамове на E. coli and Klebsiella spp е открита трансферируема, плазмид- медиирана хинолонова резистентност, свързана с qnr- гена.
Ako výsledok tohto mechanizmu pôsobenia ciprofloxacín nevykazuje skríženú rezistenciu s ostatnými dôležitými, chemicky odlišnými skupinamilátok, ako sú betalaktámové antibiotiká, aminoglykozidy, tetracyklíny, makrolidy a polypeptidy, sulfónamidy, trimetoprim a nitrofurantoín.