Поради продължителния инкубационен период на хепатит B, възможно е в момента на ваксиниране вече да има неразпозната форма на инфекцията.
Vzhľadom na dlhú inkubačnú dobu hepatitídy B je možné, že v čase očkovania je prítomná nezistená infekcia hepatitídy B.