Тъй като механизмът на взаимодействие на МАО- Ии и миртазапин е различен от този на МАО- Ии и SSRIs (селективни инхибитори на реабсорбцията на серотонина), малко вероятно е рискът от синдрома на серотонин да е толкова висок, колкото с други серотонинергични антидепресанти, като SSRIs.
Keďže mechanizmus interakcie MAO- Is s mirtazapínom sa líši od mechanizmu interakcie MAO- Is s liekmi skupiny SSRI, je nepravdepodobné, aby riziko sérotonínového syndrómu bolo také vysoké ako pri iných sérotonergných antidepresívach, ako napríklad pri SSRI.