Чрез селективно свързване с антитромбин, фондапаринукс потенцира (около 300 пъти) естествената неутрализация на 52 фактор Xa от антитромбин.
Selektívnym naviazaním na antitrombín, fondaparín potenciuje (asi 300 krát) prirodzenú neutralizáciu faktora Xa sprostredkovanú antitrombínom.