Биохимичните фактори, които могат да бъдат показателни за наследствено или придобито предразположение към венозна или артериална тромбоза, включват резистентност към активиран протеин С (АРС), хиперхомоцистеинемия, недостиг на антитромбин- ІІІ, недостиг на протеин С, недостиг на протеин S, антифосфолипидни антитела (антикардиолипинови антитела, lupus антикоагулант).
Medzi biochemické faktory, ktoré môžu indikovať dedičnú alebo získanú predispozíciu k tvorbe žilovej alebo arteriálnej trombózy patrí: rezistencia na aktivovaný proteín C (APC), hyperhomocysteinémia, deficit antitrombínu- III, deficit proteínu C, deficit proteínu S, protilátky proti fosfolipidom (protilátky proti kardiolipínu, lupus vyvolaný antikoaguláciou).