Може да има особен риск от развитие на ципрофлоксацин- резистентни бактерии при удължаване на времето на лечение и когато се лекуват нозокомиални инфекции и/ или инфекции, причинени от Staphylococcus и Pseudomonas.
Počas predĺženého trvania liečby a pri liečbe nemocničných infekcií a/ alebo infekcií spôsobených kmeňmi Staphylococcus a Pseudomonas je možné významné riziko selekcie baktérií rezistentných na ciprofloxacín.