За лицата, които получават Cubicin, нежеланите лекарствени реакции, които са най- често съобщавани по време на лечението и периода на проследяване са: главоболие, гадене, повръщане, диария, гъбични инфекции, обрив, реакции на мястото на инфузията, повишаване на стойностите на креатин фосфокиназа (CPK) и нарушени стойности на чернодробните ензими; Аланин аминотрансфераза (ALT), Аспартат аминотрансфераза (AST), Алкална фосфатаза.
U osôb, ktorým bol podávaný Cubicin, boli v priebehu liečby a ďalšieho sledovania najčastejšie zaznamenané tieto nežiaduce účinky: bolesti hlavy, nauzea, dávenie, hnačky, mykotické infekcie, vyrážka, reakcia v mieste infúzie, zvýšená kreatin- fosfokináza (CPK) a abnormálne pečeňové enzýmy; alanín aminotransferáza (ALT), aspartát aminotransferáza (AST), alkalická fosfatáza.