Съществува много малък риск, прилагането на по- високи дози Nonafact да предизвика образуването на съсиреци в кръвоносните съдове, което води до тромбоза.
Nonafact môže veľmi zriedkavo spôsobiť vznik krvných zrazenín v cievach s následným vznikom trombózy.