Най- честите нежелани реакции при Isentress (наблюдавани при 1 до 10 пациенти на 100) са безсъние (нарушения на съня), замаяност, главоболие, подуване на корема, абдоминални (коремни) болки, запек, диария, флатуленция (газове), гадене (позиви за повръщане), повръщане, хиперхидроза (прекомерно потене), нощно изпотяване, пруритус (сърбеж), обрив, артралгия (болки в ставите), астения (слабост), умора (отпадналост) и повишени нива в кръвта на чернодробните ензими (аланин аминотрансфераза и аспартат аминотрасфераза), триглицеридите (вид мазнини), креатинин киназата (ензим, намиращ се в мускулите) и липазата (ензим, намиращ се в панкреаса).
Cele mai frecvente efecte secundare asociate cu Isentress (observate la 1 până la 10 pacienţi din 100) sunt insomnia (tulburare a somnului), ameţeala, durerile de cap, distensia abdominală (balonare abdominală), durerile abdominale (de burtă), constipaţia, diareea, flatulenţa (gaze), greaţa (senzaţia de rău), vărsăturile,), hiperhidroza (transpiraţie excesivă), transpiraţia nocturnă, pruritul (mâncărime), erupţiile cutanate, atralgia (durerile articulaţiilor), astenia (slăbiciune), fatigabilitatea (oboseala) şi creşterea nivelurilor sanguine ale enzimelor hepatice (alanin aminotransferază şi aspartat aminotransferază), ale trigliceridelor (un tip de grăsime), ale creatin- kinazei (o enzimă din muşchi) şi ale lipazei (o enzimă produsă de pancreas).