При почти всички антибактериални средства, включително и при ертапенем, са наблюдавани свързани с антибиотика колит и псевдомембранозен колит, като тяхната тежест може да варира от леки до животозастрашаващи.
Colita asociată cu administrarea de antibiotice şi colita pseudomembranoasă au fost raportate la aproape toţi agenţii antibacterieni, inclusiv ertapenem şi pot varia ca severitate de la uşoare până la potenţial letale.