Проучванията in vitro с човешки чернодробни микрозоми показват, че метаболизмът на саквинавир се медиира от цитохром Р450 със специфичен изоензим, CYP3A4, отговорен за над 90% от чернодробния метаболизъм.
Studiile in vitro în care s- au folosit microzomi din ficat uman au demonstrat faptul că biotransformarea saquinavir este mediată de citocromul P450 cu izoenzima specifică CYP3A4, răspunzătoare pentru mai mult de 90% din metabolizarea hepatică.