Както при всички останали NRTI, Emtriva може също да причини лактоацидоза (натрупване на млечна киселина в тялото) и при бебета или майки, приемали Emtriva по време на бременността – митохондрична дисфункция (увреждане на енерго- произвеждащите компоненти в клетките, което може да доведе до проблеми с кръвта).
Ca în cazul tuturor celorlalţi inhibitori INRT, Emtriva poate cauza şi acidoză lactică (o acumulare de acid lactic în organism) şi la copiii ale căror mame au luat Emtriva în timpul sarcinii, disfuncţii mitocondriale (leziuni ale componentelor din celule care produc energie, care pot cauza probleme în sânge).