Сапроптерин е със слаба мутагенна активност в бактериалните клетки, а при клетките на белия дроб и яйчниците на китайски хамстер се наблюдава увеличаване на хромозомните аберации.
Sapropterina s- a dovedit a fi uşor mutagenă în celulele bacteriene şi o creştere a aberaţiilor cromozomiale a fost detectată în celulele pulmonare şi ovariene ale hamsterului chinezesc.