Тъй като сапроптерин дихидрохлорид е синтетичен вариант на срещания в природата 6R- BH4, може логично да се очаква да претърпява същия метаболизъм, включително и регенериране на 6R- BH4.
Câtă vreme diclorhidratul de sapropterină este versiunea sintetică a 6R- BH4 natural, este plauzibil de presupus că va urma aceeaşi cale de metabolizare, inclusiv regenerarea 6R- BH4.