Arixtra е противопоказен за хора, които биха могли да проявят свръхчувствителност (алергични реакции) към фондапаринукс натрий или някоя от другите съставки, при които вече се е появило кървене, които имат остър бактериален ендокардит (инфекция на сърцето) или които имат сериозни бъбречни проблеми.
Arixtra nu trebuie administrat pacienţilor care pot prezenta hipersensibilitate (alergie) la fondaparinux sodium sau la oricare alt ingredient care intră în compoziţia medicamentului şi nici pacienţilor care au deja sângerări, care au endocardită bacteriană acută (o infecţie a inimii) sau care au afecţiuni renale grave.