При някои пациенти с напреднала HIV инфекция (СПИН) и анамнеза на опортюнистична инфекция, могат да се появят симптоми на възпаление от предишни инфекции скоро след започване на анти- HIV лечение.
Unii dintre pacienţii care au primit terapie antiretrovirală combinată pot prezenta o afecţiune osoasă numită osteonecroză (moartea ţesutului osos provocată de pierderea vascularizaţiei la nivelul osului).