Преминаването през кръвно- мозъчната бариера на анидулафунгин е било ограничено при здрави плъхове; въпреки това при зайци с дисеминирана кандидиаза анидулафунгин е показал, че преминава кръвно- мозъчната бариера и намалява гъбичките в мозъка.
10 Anidulafungina przenika przez barierę krew- mózg w ograniczonym stopniu u zdrowych szczurów; jednakże u szczurów z rozsianą kandydozą, anidulafungina przenikała przez barierę krew- mózg i zmniejszała nasilenie zakażenia grzybami w mózgu.