Нежеланите лекарствени реакции, които са възниквали по- често при бозентан, отколкото при плацебо (≥ 3% от приемащите бозентан пациенти, с ≥ 2% разлика), са били главоболие (15, 8% срещу 12, 8%), зачервяване (6, 6% срещу 1, 7%), абнормна чернодробна функция (5, 9% срещу 2, 1%), оток на краката (4, 7% срещу,. 4%) и анемия (3, 4% срещу 1, 0%), като всички са били дозозависими.
Działaniami niepożądanymi, które występowały częściej w przypadku bozentanu niż placebo (≥ 3% pacjentów leczonych bozentanem, przy różnicy ≥ 2%), były bóle głowy (15, 8% wobec 12, 8%), nagłe zaczerwienienie skóry (6, 6% wobec 1, 7%), zaburzenia czynności wątroby (5, 9% wobec 2, 1%), obrzęki nóg (4, 7% wobec 1, 4%) oraz niedokrwistość (3, 4% wobec 1, 0%), wszystkie z nich były zależne od dawki.