Естественият хирудин се произвежда в незначителни количества като семейство високо хомоложни изополипептиди от пиявиците Hirudo medicinalis.
Naturalna hirudyna jest wytwarzana w śladowych ilościach jako rodzina wysoce homologicznych izopolipeptydów przez pijawki lekarskie (Hirudo medicinalis).