Потенциалът за кръстосана резистентност между ефавиренц и НИОТ е малък, поради различните места за свързване върху мишената и механизма на действие.
Możliwość występowania oporności krzyżowej pomiędzy efawirenzem a nukleozydowymi inhibitorami odwrotnej transkryptazy jest mała, z uwagi na różnice w miejscach wiązania cząsteczki docelowej oraz w mechanizmie działania.