Зидовудин може да взаимодейства и със следните лекарства и може да засили нежеланите ефекти: фенитоин, пробенецид, рифампицин, атоваквон, валпроева киселина, метадон, дапсон, пентамидин, пириметамин, ко- тримоксазол, флуконазол, амфотерицин, флуцитозин, ганцикловир, интерферон, кларитромицин, винкристин, винбластин и доксорубицин.
Zydowudyna może również wchodzić w interakcje z następującymi lekami i nasilać ich działania niepożądane: fenytoina, probenecyd, ryfampicyna, atowakwon, kwas walproinowy, metadon, dapson, pentamidyna, pirymetamina, ko- trymoksazol, flukonazol, amfoterycyna, flucytozyna, gancyklowir, interferon, klarytromycyna, winkrystyna, winblastyna i doksorubicyna.