Клирънсът на силденафил се осъществява предимно от чернодробните микрозомни изоензими CYP3A4 (главен път) и CYP2C9 (второстепенен път).
Metabolizm Syldenafil jest metabolizowany przede wszystkim przez układ enzymów mikrosomalnych wątroby cytochromu P450, w tym przez jego izoenzym CYP3A4 i w mniejszym stopniu przez CYP2C9.