Анидулафунгин селективно инхибира 1, 3- β- глюкан синтазата – ензим, намиращ се в гъбичките, но не и в клетките на бозайниците.
Anidulafungina selektywnie hamuje syntazę beta - (1, 3) - D- glukanu, enzym obecny w ścianie komórkowej grzybów, ale nieobecny u ssaków.