В урината, черният дроб, сланината и бъбреците метаболити на диметил- дифлоксацин и дифлоксацин N - окис се срещат в минимални количества.
W moczu, wątrobie, tłuszczu i nerkach stwierdza się niewielkie ilości metabolitów difloksacyny: desmetyl - difloksacyny i N- tlenku difloksascyny.