Клинично значимите токсичности, според ОКТ, които са съобщени при < 1% (нечести) от пациентите, рандомизирани да получават пеметрексед включват суправентрикуларна аритмия.
Trijų 2 fazės ir 3 fazės tyrimų duomenimis, kliniškai svarbus 3 ir 4 laipsnio toksinis poveikis laboratoriniams rodmenims vartojant vieną pemetreksedą buvo panašus (n = 164) į aprašytą anksčiau, išskyrus neutropeniją (12, 8%, palyginti su 5, 3%) ir alanino transaminazės aktyvumo padidėjimą (15, 2%, palyginti su 1, 9%).