22 Резистентните към емтрицитабин вируси са имали кръстосана резистентност към ламивудин, но са запазили чувствителност към други нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (НИОТ) (зидовудин, ставудин, тенофовир, абакавир, диданозин и залцитабин), всички не- нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (ННИОТ) и всички протеазни инхибитори (ПИ).
Emtricitabinui atsparūs virusai pasižymi kryžminiu rezistentiškumu lamivudinui, tačiau išlieka jautrūs kitiems nukloezidų atvirkštinės transkriptazės inhibitoriams (NATI) (zidovudinui, stavudinui, tenofovirui, abakavirui, didanozinui ir zalcitabinui), visiems ne- nukleozidų atvirkštinės transkriptazės inhibitoriams (NNATI) ir visiems proteazių inhibitoriams (PI).