Резистентност към ципрофлоксацин се развива на етапи чрез геномни мутации (multiple- step тип).
Klinikoje išaugintose E. coli ir Klebsiella padermėse buvo nustatytas perduodamas atsparumas chinolonams, kuris susijęs su plazmidėmis ir qnr.