Зонизамид също има модулиращ ефект върху ГАМК- медиираното невронално инхибиране.
Zonisamidas taip pat turi moduliacinį poveikį gama aminosviesto rūgšties (GASR, angl. gama - aminobutyric acid, GABA) sąlygojamam neuronų slopinimui.