В in vitro анализи за потенциална генотоксичност, както и в in vivo извършени хромозомни тестове на миши костен мозък не се установява генотоксичност на каспофунгин.
Kaspofungino galimo genotoksiškumo tyrimo in vitro rezultatai, taip pat in vivo kaulų čiulpų chromosomų testas pelėms buvo neigiami.