Ципрофлоксацин трябва да бъде употребяван в комбинация с други антимикробни средства, например рифампицин при инфекции, причинени от Staphylococci, и бета- лактамни или аминогликозидни антибиотици при инфекции, причинени от Pseudomonas aeruginosa.
Ciprofloksacinas turėtų būti vartojamas kartu su kitomis antimikrobinėmis medžiagomis, tokiomis kaip rifampicinas, kuris skirtas gydyti staflokokų sukeliamas infekcijas, ir betalaktamai arba aminoglikozidai, kurie skirti gydyti Pseudomonas aeruginosa sukeltoms infekcijoms.