Нелфинавир има адитивен до синергичен ефект срещу НIV в комбинация с инхибиторите на обратната транскриптаза зидовудин (ZDV), ламивудин (3TC), диданозин (ddI), залцитабин (ddC) и ставудин (d4T), без да се увеличава цитотоксичността.
Nustatyta, kad vartojant nelfinavirą kartu su atvirkštinės transkriptazės inhibitoriais (zidovudinu (ZDV), lamivudinu (3TC), didanozinu (ddI), zalcitabinu (ddC), stavudinu (d4T), pasireiškia suminis arba sinerginis poveikis ŽIV, o citotoksinis poveikis nesustiprėja.