Както при всички тетрациклини, могат да се проявяват алергични реакции и фотосенсибилизация.
Kiaulių kvėpavimo takų ligos, sukeltos doksiciklinui jautrių Pasteurella multocida ir Bordetella bronchiseptica, gydymui ir prevencijai, diagnozavus ligą bandoje.