Невирапин се свързва директно с обратната транскриптаза и блокира активността на РНК - и ДНК- зависимата ДНК- полимераза, като предизвиква разрушаване на ензимните каталитични центрове.
Jis tiesiogiai prisijungia prie atvirkštinės transkriptazės ir dėl to blokuoja nuo RNR ir DNR priklausomos DNR polimerazės aktyvumą, suardydamas jos katalizinį centrą.