Най- често съобщаваните нежелани реакции при лечение с азацитидин са хематологични реакции (71, 4%), включващи тромбоцитопения, неутропения и левкопения (обикновено 3- та−4- та степен), стомашно- чревни нарушения (60, 6%), включващи гадене, повръщане (обикновено 1- ва−2- ра степен) или реакции на мястото на инжектиране (77, 1%; обикновено 1- ва−2- ра степен).
Dažniausios šalutinės reakcijos, gydant azacitidinu, buvo kraujo reakcijos (71, 4%), įskaitant trombocitopeniją, neutropeniją ir leukopeniją (paprastai 3– 4 laipsnio), virškinimo trakto funkcijos sutrikimai (60, 6%), įskaitant pykinimą, vėmimą (paprastai 1- 2 laipsnio) ar injekcijos vietos reakcijos (77, 1%, paprastai 1– 2 laipsnio).