Емтрицитабин се екскретира основно от бъбреците като цялата приложена доза се открива в урината (приблизително 86%) и фекалиите (приблизително 14%).
Eliminacija: emtricitabinas daugiausiai šalinamas pro inkstus su šlapimu (maždaug 86% vartotos dozės) ir su išmatomis (maždaug 14% dozės).