Както при другите антимикробни средства, включително карбапенеми, за дорипенем е показано, че селектира резистентни бактериални щамове.
Kaip ir vartojant kitus antimikrobinius vaistinius preparatus, įskaitant karbapenemus, gali atsirasti atsparių bakterijų padermių doripenemui.