Токсикологията на микафунгин след многократно интравенозно приложение на плъхове и/ или кучета показва нежелани реакции от черен дроб, пикочния тракт, червените кръвни клетки и мъжки репродуктивни органи.
Žiurkėms ir (arba) šunims pakartotinai į veną švirkščiant mikafungino, nustatyta, kad pasireiškė nepageidaujamų reiškinių kepenims, šlapimo takams, eritrocitams ir patinėlių dauginimosi organams.