Той притежава първична аминокиселинна структура, която е сравнима с Ala148 алелната форма на плазмения фактор IX, като някои посттранслационни модификации на рекомбинантната молекула се различават от тези на плазмената молекула.
Jo pirminė aminorūgščių seka panaši į iš plazmos išskirto IX faktoriaus Ala148 alelinės formos seką, o kai kurios vėlesnės rekombinantinės molekulės modifikacijos skiriasi nuo iš plazmos išskirtos molekulės modifikacijų.