Както при други флуорохинолони, дифлоксацин не трябва да се използва при бързорастящи кучета, защото може да повлияе на хрущяла на някои стави.
Kaip ir kitų fluorokinolonų, difloksacino negalima skirti greitai augantiems šunims, nes jis gali pažeisti kai kurių sąnarių kremzles.