За лицата, които получават Cubicin, нежеланите лекарствени реакции, които са най- често съобщавани по време на лечението и периода на проследяване са: главоболие, гадене, повръщане, диария, гъбични инфекции, обрив, реакции на мястото на инфузията, повишаване на стойностите на креатин фосфокиназа (CPK) и нарушени стойности на чернодробните ензими; Аланин аминотрансфераза (ALT), Аспартат аминотрансфераза (AST), Алкална фосфатаза.
Cubicin vartojusiems pacientams gydymo metu ir stebėjimo laikotarpiu dažniausiai pasireiškusios nepageidaujamos reakcijos buvo galvos skausmas, pykinimas, vėmimas, viduriavimas, grybelinės infekcijos, bėrimas, infuzijos vietos reakcija, padidėjęs kreatinfosfokinazės (KFK) ir pakitę kepenų fermenų: alaninaminotransferazės (ALT), asparatataminotransferazės (AST) ir šarminės fosfatazės kiekiai.