Основният път на метаболизъм на неларабин е О- деметилиране от аденозин дезаминаза, при което се образува ara- G, който претърпява хидролиза и се образува гуанин.
Daugiausia nelarabinas metabolizuojamas adenozino deaminaze O- demetilinimu ir susidaro ara- G, kuris hidrolizuojamas iki guanino susidarymo.