Ставудин е показал генотоксичност при in vitro тестове с човешки лимфоцити, проявявайки трифосфорилираща активност (при което не е установено ниво без ефект), при фибробласти от мишки, и при един in vivo тест за хромозомни аберации.
Tyrimais su žmogaus limfocitais, kuriuose yra trifosforilazių aktyvumo (pastaruosiuose nenustatyta efekto nesukeliančios koncentracijos), ir pelių fibroblastais in vitro bei chromosomų aberacijų tyrimais in vivo nustatytas stavudino genotoksinis poveikis.