При протеазните инхибитори са докладвани повишени нива на креатинин фосфокиназата (СРК), миалгия, миозит и, в редки случаи, рабдомиолиза, особено при комбинации с нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза.
Vartojant proteazės inhibitorius, ypač kartu su nukleozidiniais atgalinės transkriptazės inhibitoriais, būna padidėjęs KFK kiekis, mialgija, miozitas ir retai rabdomiolizė.