Както при всички останали NRTI, Emtriva може също да причини лактоацидоза (натрупване на млечна киселина в тялото) и при бебета или майки, приемали Emtriva по време на бременността – митохондрична дисфункция (увреждане на енерго- произвеждащите компоненти в клетките, което може да доведе до проблеми с кръвта).
Kaip ir vartojant kitus NRTI, Emtriva vartojantiems pacientams gali pasireikšti laktatacidozė (organizme kaupiasi pieno rūgštis), o kūdikiams, kurių motinos vartoja Emtriva nėštumo metu, gali pasireikšti mitochondrijų funkcijos sutrikimas (energiją gaminančių ląstelių dalelių sutrikimas, dėl kurio gali kilti su krauju susijusių problemų).