Малко вероятна е кръстосаната резистентност между абакавир и антиретровирусните лекарства от други класове (напр. протеазните инхибитори или ненуклеозидните инхибитори на обратната транскриптаза).
Kryžminis atsparumas tarp abakaviro ir kitų klasių antiretrovirusinių vaistų (pvz., PI arba NNRTI) pasireikšti neturėtų.