Тъй като употребата на концентрати на фактор IX комплекс досега винаги е била асоциирана с развитие на тромбоемболични усложнения, като рискът е по- голям при препаратите с ниска чистота, прилагането на продукти, съдържащи фактор IX, може да е потенциално вредно при пациенти с признаци на фибринолиза и такива с дисеминирана интраваскуларна коагулация (ДИК).
Kadangi istoriškai gydymas IX faktoriaus kompleksiniais koncentratais siejamas su tromboembolinių komplikacijų atsiradimu ir šių komplikacijų pavojus yra didesnis, naudojant mažesnio grynumo preparatus, preparatai, turintys IX faktorių, gali būti pavojingi ligoniams, kuriems yra fibrinolizės požymių, ir ligoniams, kuriems yra diseminuoto intrakraujagyslinio kraujo krešėjimo sindromas (DIK).