Най- честите нежелани реакции при Cubicin (наблюдавани при повече от 1 на 10 пациенти) са гъбични инфекции (причинени от плесени и дрожди), главоболие, гадене (позиви за повръщане), повръщане, диария, обрив, реакции на мястото на инфузията, нарушени стойности на чернодробните ензими и повишени стойности на CPK (показател за мускулни увреждания) в кръвта.
Dažniausi Cubicin sukelti šalutiniai reiškiniai (pasireiškė daugiau nei vienam pacientui iš 10) yra grybelių (pelėsinio ir mielių) sukeltos infekcijos, galvos skausmas, pykinimas, vėmimas, viduriavimas, bėrimas, infuzijos vietos reakcijos, kepenų patikrinimo rezultatų nukrypimas nuo normos ir kreatinfosfokinaze (KFK) vadinamo fermento kiekio padidėjimas (jis rodo raumenų pažeidimą) kraujyje.