Биматопрост е главното съединение, циркулиращо в кръвта, след като влезе в системното кръвообращение, при очно приложение.
Kai tik įlašinto į akį vaisto patenka į sisteminę kraujotaką, pagrindinė jo dalis, kuri cirkuliuoja kraujyje, yra nepakitęs bimatoprostas. Paskui, vykstant bimatoprosto oksidacijai, N- deetilinimui ir konjugacijai su gliukurono rūgštimi, susidaro įvairių metabolitų.