Metagenomo rilatas al kolekto de totala genetika materialo de miksita komunumo de organismoj, kiel media metagenomo, homa metagenomo, ktp. Ĝi enhavas genamojn de kaj kultiveblaj kaj nekultiveblaj mikroorganismoj.Metagenomic-sekvencado estas molekula ilo uzita por analizi la miksitajn genomicmaterialojn eltiritajn de mediaj provaĵoj, kiu disponigas detalajn informojn pri speciodiverseco kaj abundo, populaciostrukturo, filogenetika rilato, funkciaj genoj kaj korelacia reto kun medifaktoroj.
#000009
● Izoliĝo kaj senkultivado por mikroba komunuma profilado
#000010
● Alta rezolucio en detektado de malalt-abundaj specioj en mediaj specimenoj
#000011
● La ideo de "meta-" integras ĉiujn biologiajn trajtojn je funkcia nivelo, specionivelo kaj gennivelo, kiu reflektas dinamikan vidon kiu estas pli proksima al realeco.
#000012
● BMK amasigas amasan sperton en diversaj specimenaj specoj kun pli ol 10,000 specimenoj prilaboritaj.
#000013
● Kontrolo de kvalito de krudaj datumoj
#000014
● Ne-redunda genaro kaj komentario
#000015
● Analizo de specia diverseco
#000016
● Analizo de diverseco de genetikaj funkcioj
#000017
● Asocia analizo kontraŭ eksperimentaj faktoroj
#000018
Frostigu la specimenojn en likva nitrogeno dum 3-4 horoj kaj konservu en likva nitrogeno aŭ -80 gradojn al longtempa rezervo.Specimena sendado kun seka glacio estas postulata.
#000019
2.Funkciaj genoj komentitaj al KEGG-metabolaj vojoj
#000020
3.Harma mapo: Diferencaj funkcioj bazitaj sur relativa gena abundo4.Circos de CARD antibiotikrezistaj genoj
#000021
Tropezo de antibiotikrezistaj genoj kaj bakteriaj patogenoj laŭ la grund-mangrova radikkontinuumo
#000022
Eldonita:Ĵurnalo de Danĝeraj Materialoj, 2021
#000023
Materialoj: DNA-eltiraĵoj de kvar fragmentoj de mangrova radiko rilataj specimenoj: neplantita grundo, rizosfero, episfero kaj endosfera sekciojPlatformo: Illumina HiSeq 2500Celoj: Metagenomo16S rRNA-geno V3-V4-regiono
#000024
Metagenomic-sekvencado kaj metabarkodiga profilado sur grund-radika kontinuumo de mangrov-arbidoj estis prilaboritaj por studi la disvastigon de antibiotikrezistaj genoj (ARGoj) de grundo en plantojn.Metagenomaj datenoj rivelis ke 91.4% de antibiotikrezistaj genoj estis ofte identigitaj en ĉiuj kvar grundaj sekcioj menciitaj supre, kiuj montris kontinuan modon.16S rRNA-amplikonsekvencado generis 29,285 sekvencojn, reprezentante 346 speciojn.Kombinante kun specioprofilado per amplikonsekvencado, tiu disvastigo estis trovita esti sendependa de radik-rilata mikrobioto, aliflanke, ĝi povus esti faciligita per moveblaj de genetikaj elementoj.Tiu studo identigis la fluon de ARGoj kaj patogenoj de grundo en la plantojn tra interligita grund-radika kontinuumo.
#000025
Bakteria kaj Funga Tuta Genaro Re-sekvencado
#000028
Sendu vian mesaĝon al ni:
#000032