National Center for Biotechnology Information
#000000
La NCBI gastigas serion de datumbazoj signifaj al bioteknologio kaj biomedicino kaj gravan rimedon por bioinformadikiloj kaj servojn.
Gravaj datumbazoj inkludas GenBank por DNA-sekvencoj kaj PubMed, bibliografia datumbazo por la biomedicina literaturo.
Aliaj datumbazoj inkludas la NCBI Epigenomics datumbazon.
Ĉiuj tiuj datumbazoj estas havebla rete tra la Entrez serĉilo.
#000003
NCBI havis respondecon por igi haveblan la GenBank DNA-sekvencdatumbazo ekde 1992.
GenBank kunlaboras per individuaj laboratorioj kaj aliaj sekvencdatumbazoj kiel ekzemple tiuj de la European Molecular Biology Laboratory (EMBL) kaj la DNA Data Bank of Japan (DBJ).
#000006
La NCBI havas softvarilojn kiuj estas haveblaj per WWW retumado aŭ de FTP.
Ekzemple, Blast estas sekvencsimileco serĉanta programon.
EKSPLODO povas fari sekvenckomparojn kontraŭ la GenBank DNA-datumbazo en malpli ol 15 sekundoj.
#000008
PubMed estas datumbazo evoluigita fare de NCBI National Library of Medicine (NLM), ĝi funkcias kiel parto de la NCBI Entrez rehavigsistemo.
Estis ĉefe dizajnite por disponigi la aliron al referencoj kaj abstraktaĵoj de biomedicinaj kaj vivsciencoj-ĵurnaloj.
PubMed disponigas ligilojn kiuj permesas aliron al la plen-tekstaj ĵurnalartikoloj de partoprenantaj eldonistoj.
MEDLINE- datumbazo estas la primara datenfonto por PubMed, kiu inkludas la kampojn de medicino, dentokuracado, flegon, sansistemon, veterinara kaj la preklinikaj sciencoj.
#000009
PubMed Central (PMC) estis lanĉita en februaro 2000, ĝi estas libera arkivo kaj funkcias kiel cifereca ekvivalento al la ampleksa presaĵa ĵurnalkolekto de NLM.
PMC disponigas permanentan aliron al ĉio el ĝia enhavo kaj estas administrita fare de NLM.
#000010
La NCBI Librobreto estas kolekto de libere alireblaj, elŝuteblaj, enretaj versioj de elektitaj biomedicinaj libroj.
La Librobreto kovras larĝan gamon de temoj inkluzive de molekula biologio, biokemio, ĉelbiologio, genetiko, mikrobiologion, malsanstatojn de molekula kaj ĉela perspektivo, esplormetodojn, kaj virusologion.
Kelkaj el la libroj estas retaj versioj de antaŭe publikigitaj libroj, dum aliaj, kiel ekzemple Kafpaŭzo, estas skribitaj kaj redaktitaj fare de NCBI-kunlaborantaro.
La Librobreto estas komplemento al la Entrez PubMed deponejo da kolegaro-reviziitaj publikig abstraktaĵoj en tiu Bookshelf-enhavo disponigas establitajn perspektivojn dum evoluigado studfakoj kaj kunteksto en kiuj multaj malsimilaj individuaj pecoj de raportita esplorado povas esti organizitaj.
#000011
EKSPLODO estas algoritmo utiligita por kalkulado de sekvencsimileco inter biologiaj sekvencoj kiel ekzemple nukleotidsekvencoj de DNA kaj aminoacidosekvencoj de proteinoj.
EKSPLODO estas potenca ilo por trovado de sekvencoj similaj al la demandsekvenco ene de la sama organismo aŭ en malsamaj organismoj.
Ĝi serĉas la demandsekvencon sur NCBI-datumbazoj kaj serviloj kaj publikigas la rezultojn reen al la retumilo de la persono en elektita formato.
Kontribuu sekvencojn al la EKSPLODO estas plejparte en FASTA aŭ Genbank-formato dum produktaĵo povus esti liverita en diverseco de formatoj kiel ekzemple HTML, XML-formatado kaj klarteksto.
HTML estas la defaŭlta produktaĵformato ĉar NCBI_ estas retpaĝo.
Rezultoj por NCBI-EKSPLODO estas prezentitaj en grafika formato kun ĉiuj sukcesoj trovitaj, tablo kun sekvencidentigiloj por la sukcesoj havante poentadon ligita datenoj, kune kun la paraleligoj por la sekvenco de intereso kaj la sukcesoj ricevis kun analogaj EKSPLODpoentaroj por tiuj [9]
#000012
Geno estis efektivigita ĉe NCBI por karakterizi kaj organizi la informojn pri genoj.
Ĝi funkcias kiel grava nodo en la interplektaĵo de genomicmapo, esprimo, sekvenco, proteinfunkcio, strukturo- kaj homologiodatenoj.
Unika GeneID estas asignita al ĉiu gendisko kiu povas esti kondukita tra reviziocikloj.
Gen diskoj por konataj aŭ antaŭdiritaj genoj estas establitaj ĉi tie kaj estas limitaj per mappozicioj aŭ nukleotidsekvenco.
Geno havas plurajn avantaĝojn super sia antaŭulo, LocusLink, inkluzive de, pli bona integriĝo per aliaj datumbazoj ene de NCBI, pli larĝa taksonomia aplikeco, kaj plifortigitaj opcioj por demando kaj rehavigo disponigita per Enterz-sistemo.
#000014
PubChem BioAssay-datumbazo de NCBI estas publika rimedo por biologiaj testoj de malgrandaj molekuloj kaj siRNA-reakciiloj.
La plej grava celo de PubChem-deponejo devas provizi facila kaj libera de kostaliro al ĉiuj deponitaj datenoj, kaj disponigi intuiciajn datenanalizajn ilojn.
Ĝi estas strukturita kiel aro de rilataj datumbazoj organizitaj sur Microsoft SQL-serviloj.
La BioAssay-datenoj de PubChem estas serĉeblaj kaj alireblaj de Entrez informserĉadsistemo.
PubChem-datumbazo disponigas programecajn kaj Ret-bazitajn ilojn por uzantoj por serĉi, revizii, kaj elŝutas publikaĵojn, bioaktivecdatenojn por kunmetaĵo, BioAsay-rekordo, molekula celo.
#000016