[{"text_idx": "#000000", "text": "National Center for Biotechnology Information"}, {"text_idx": "#000003", "text": "La NCBI gastigas serion de datumbazoj signifaj al bioteknologio kaj biomedicino kaj gravan rimedon por bioinformadikiloj kaj servojn.\nGravaj datumbazoj inkludas GenBank por DNA-sekvencoj kaj PubMed, bibliografia datumbazo por la biomedicina literaturo.\nAliaj datumbazoj inkludas la NCBI Epigenomics datumbazon.\nC\u0302iuj tiuj datumbazoj estas havebla rete tra la Entrez serc\u0302ilo."}, {"text_idx": "#000006", "text": "NCBI havis respondecon por igi haveblan la GenBank DNA-sekvencdatumbazo ekde 1992.\nGenBank kunlaboras per individuaj laboratorioj kaj aliaj sekvencdatumbazoj kiel ekzemple tiuj de la European Molecular Biology Laboratory (EMBL) kaj la DNA Data Bank of Japan (DBJ)."}, {"text_idx": "#000008", "text": "La NCBI havas softvarilojn kiuj estas haveblaj per WWW retumado au\u0306 de FTP.\nEkzemple, Blast estas sekvencsimileco serc\u0302anta programon.\nEKSPLODO povas fari sekvenckomparojn kontrau\u0306 la GenBank DNA-datumbazo en malpli ol 15 sekundoj."}, {"text_idx": "#000009", "text": "PubMed estas datumbazo evoluigita fare de NCBI National Library of Medicine (NLM), g\u0302i funkcias kiel parto de la NCBI Entrez rehavigsistemo.\nEstis c\u0302efe dizajnite por disponigi la aliron al referencoj kaj abstraktaj\u0302oj de biomedicinaj kaj vivsciencoj-j\u0302urnaloj.\nPubMed disponigas ligilojn kiuj permesas aliron al la plen-tekstaj j\u0302urnalartikoloj de partoprenantaj eldonistoj.\nMEDLINE- datumbazo estas la primara datenfonto por PubMed, kiu inkludas la kampojn de medicino, dentokuracado, flegon, sansistemon, veterinara kaj la preklinikaj sciencoj."}, {"text_idx": "#000010", "text": "PubMed Central (PMC) estis lanc\u0302ita en februaro 2000, g\u0302i estas libera arkivo kaj funkcias kiel cifereca ekvivalento al la ampleksa presaj\u0302a j\u0302urnalkolekto de NLM.\nPMC disponigas permanentan aliron al c\u0302io el g\u0302ia enhavo kaj estas administrita fare de NLM."}, {"text_idx": "#000011", "text": "La NCBI Librobreto estas kolekto de libere alireblaj, els\u0302uteblaj, enretaj versioj de elektitaj biomedicinaj libroj.\nLa Librobreto kovras larg\u0302an gamon de temoj inkluzive de molekula biologio, biokemio, c\u0302elbiologio, genetiko, mikrobiologion, malsanstatojn de molekula kaj c\u0302ela perspektivo, esplormetodojn, kaj virusologion.\nKelkaj el la libroj estas retaj versioj de antau\u0306e publikigitaj libroj, dum aliaj, kiel ekzemple Kafpau\u0306zo, estas skribitaj kaj redaktitaj fare de NCBI-kunlaborantaro.\nLa Librobreto estas komplemento al la Entrez PubMed deponejo da kolegaro-reviziitaj publikig abstraktaj\u0302oj en tiu Bookshelf-enhavo disponigas establitajn perspektivojn dum evoluigado studfakoj kaj kunteksto en kiuj multaj malsimilaj individuaj pecoj de raportita esplorado povas esti organizitaj."}, {"text_idx": "#000012", "text": "EKSPLODO estas algoritmo utiligita por kalkulado de sekvencsimileco inter biologiaj sekvencoj kiel ekzemple nukleotidsekvencoj de DNA kaj aminoacidosekvencoj de proteinoj.\nEKSPLODO estas potenca ilo por trovado de sekvencoj similaj al la demandsekvenco ene de la sama organismo au\u0306 en malsamaj organismoj.\nG\u0302i serc\u0302as la demandsekvencon sur NCBI-datumbazoj kaj serviloj kaj publikigas la rezultojn reen al la retumilo de la persono en elektita formato.\nKontribuu sekvencojn al la EKSPLODO estas plejparte en FASTA au\u0306 Genbank-formato dum produktaj\u0302o povus esti liverita en diverseco de formatoj kiel ekzemple HTML, XML-formatado kaj klarteksto.\nHTML estas la defau\u0306lta produktaj\u0302formato c\u0302ar NCBI_ estas retpag\u0302o.\nRezultoj por NCBI-EKSPLODO estas prezentitaj en grafika formato kun c\u0302iuj sukcesoj trovitaj, tablo kun sekvencidentigiloj por la sukcesoj havante poentadon ligita datenoj, kune kun la paraleligoj por la sekvenco de intereso kaj la sukcesoj ricevis kun analogaj EKSPLODpoentaroj por tiuj [9]"}, {"text_idx": "#000014", "text": "Geno estis efektivigita c\u0302e NCBI por karakterizi kaj organizi la informojn pri genoj.\nG\u0302i funkcias kiel grava nodo en la interplektaj\u0302o de genomicmapo, esprimo, sekvenco, proteinfunkcio, strukturo- kaj homologiodatenoj.\nUnika GeneID estas asignita al c\u0302iu gendisko kiu povas esti kondukita tra reviziocikloj.\nGen diskoj por konataj au\u0306 antau\u0306diritaj genoj estas establitaj c\u0302i tie kaj estas limitaj per mappozicioj au\u0306 nukleotidsekvenco.\nGeno havas plurajn avantag\u0302ojn super sia antau\u0306ulo, LocusLink, inkluzive de, pli bona integrig\u0302o per aliaj datumbazoj ene de NCBI, pli larg\u0302a taksonomia aplikeco, kaj plifortigitaj opcioj por demando kaj rehavigo disponigita per Enterz-sistemo."}, {"text_idx": "#000016", "text": "PubChem BioAssay-datumbazo de NCBI estas publika rimedo por biologiaj testoj de malgrandaj molekuloj kaj siRNA-reakciiloj.\nLa plej grava celo de PubChem-deponejo devas provizi facila kaj libera de kostaliro al c\u0302iuj deponitaj datenoj, kaj disponigi intuiciajn datenanalizajn ilojn.\nG\u0302i estas strukturita kiel aro de rilataj datumbazoj organizitaj sur Microsoft SQL-serviloj.\nLa BioAssay-datenoj de PubChem estas serc\u0302eblaj kaj alireblaj de Entrez informserc\u0302adsistemo.\nPubChem-datumbazo disponigas programecajn kaj Ret-bazitajn ilojn por uzantoj por serc\u0302i, revizii, kaj els\u0302utas publikaj\u0302ojn, bioaktivecdatenojn por kunmetaj\u0302o, BioAsay-rekordo, molekula celo."}]