Paven appellerte til katolikkar og lutherarar om å "redda" historia og sjå ærleg på fortida, "innmerka feil og søkja tilgjeving". Etter tradisjon nagla den tyske teologen Martin Luther dei 95 tesene sine til døra til ei kyrkje 31. oktober 1517. Lederen av den romersk-katolske kyrkja roste reformasjonen for å ha hjelpt til å gje ei større sentral stilling til skriftene i kyrkjelovet. Luthers pamflett angrep overgrep og misbruk innanfor kyrkja, og handlingane og skriftene hans var svært viktige i splittinga som utvikla seg i vestkristendomen, som blei kjent som reformasjonen. I ei felles uttale sa den romersk-katolske kyrkja og den luteranske verdsforbundet at begge partnerane "ikke lenger er fremmade" og at det felles målet var å få medlemmar av dei to kyrkjene saman ved eukaristiske bordet.
Pave Frans har delteke i arrangementar for å minne om årsdagen for den protestantiske reformasjonen under reisa si til Sverige.