Tilskapa om grovskapar i den siste fasen av krigen har følgt regjeringa heilt sidan den enda. Rebellane vart òg beskyldde for misbruk. Styresmaktene har strenge nekta slike påstandar og insistert på at dei er på vegen til forsoning og gjenoppbygging av nord i Sri Lanka. Etter å ha fått sjølvstende frå britisk styre, byrja stadig meir assertive singalesiske nasjonalister, som var misnøye med det dei såg som britisk favorisering av tamilane, å fanne elden av etnisk deling. I 1983 vart opprøret omskapa etter at 13 soldatar vart drepne av opprørarar over heile landet. Liberation Tigers of Tamil Eelam (LTTE) kom fram under leiarskap til Velupillai Prabhakaran som ein skånseløs og svært effektiv kampstyrke. Det kom til å styra det som i praksis var ein skuggestat i nord og aust. I 1990-talet brukte gruppen sjølvmordsbombingar og andre angrep til å øydeleggja i hovudstaden Colombo og andre stader. Den drap òg høgt representerte personar, inkludert den indiske statsministeren Rajiv Gandhi og den srilankiske presidenten Ranasinghe Premadasa. Etter at ulike fredsintitativ og våpenhvile mislykkast, lanserte regjeringa eit siste offenssiv i 2009 og slo Tigrarne. I 2011 kom det til å uttale seg at fleire tusen sivilbefolkning var omringe i ein liten strimmel av land på den nordøstlege kysten. Regjeringa vart beskyldd for å ha brukt tungt våpen, og bilder frå FN som BBC fekk til har vist seg å visa at dei har skutt i ein "trygg sone" for sivile. Rapporten beskylde også Tamil Tigers for å ha brukt sivile som menneske skjold, og sa at opprørarane skutt dei som freista å rømma. Det sa òg at opprørarane hadde plassert tungt våpen på sykehusgrunden. Sri Lanka avviste påstandane i rapporten som partiske og svindlande. Kritikarane seier at det har vore lite seriøse forsøk på å gjera dette hittil. Regjeringa utnevnte ein Lesar og forsoningskommisjon, som rydde militæret for påstandar om at det hadde påviteleg angrepet sivile. Rettargrupper avviste etterforskinga som "feil". I september 2013 heldt regjeringa val for eit semi-autonomt råd i den tamilskulegmelegdommen nord på øya, eit trekk som det sa var eit viktig skritt i forsoningsprocessen. Tamil National Alliance (TNA) vann 30 seter i det 38-medlemsrådet og dannar no den første fungerande provinsregjeringa i nord. 80-åringen i TNA, Rajavarothiam Sampanthan, sa at seiera var ein sjanse for alle å "tenka om framtida på nytt". Det store flertalet analytikarar er samde i at i det korte løpet er svaret i det minste eit knusande nei. Etter så mange år med krig, er mange tamiler i Sri Lanka trøtte av krig og strevar etter å få levebrød. Men mange advarar òg om at regjeringa risikerar å avvikle dei fleste dersom ho ikkje tek til orde for å få dei til å gjera det same.
Sri Lankas hær vann ein seier over separatistane Tamil Tiger i mai 2009 etter 26 år med borgarkrig.