I 2002 var han 16 år gamal, og etterforskinga til BBC Panorama hevda at Salazar, som blei trenar for Farah i 2011, hadde brutt antidopingreglene og dopet den amerikanske løparen Galen Rupp. "Eg skal dokumentera og presenterte fakta så fort eg kan, slik at Galen og Mo kan konsentrera seg om å gjera det dei elskar og har arbeidd så mykje for å oppnå det", sa Salazar i ein uttale. "Media-afspelte er ikkje støtta på denne eninga". "Eg har sagt heile tida at eg trur på ein rein idrett, hardt arbeid og eg nekter alle påstandar om doping". Rupp, som var andre etter Farah i 10.000 m på OL 2012 og har den amerikanske 10.000 m-rekorden, nekter òg påstandane om misbrukt. Formanden av den britiske olympiske foreningen, Lord Coe, som kjempar for å bli president i den internasjonale foreningen for friidrett, har forsvara omdømet til Salazar og trur han vil montera eit "robust" forsvar. Den amerikanske antidopingbyråen har ikkje bekreftet om han er i ferd med å utrede påstandane mot Salazar, men presidenten for Verdens antidopingbyrå, Sir Craig Reedie, har sagt at situasjonen bør undersøkast. Salazar, Rupp og Farah sin agent, Ricky Simms, vart gjort klar over påstandane til BBC for ein månad sidan. John Cook, som blei rekruttert av Salazar i 2003 men forlét NOP i 2005, sa at det var lett å få ein Therapeutic Use Exemption (TUE) for noko som kunne ha vore ein inhalator. "Om eg tek deg og løy deg opp og ned trappane fem eller seks eller sju gonger, og så ta deg til legen, så kjem du til å få astma og mislykkast i testen, og du får lov til å ta en inhalator", sa han. "Ikke misforstå meg, nokre av desse medisinane gjer livet betre for visse grupper. Men om du er ein sunn person, kvifor i helvete treng du ein inhalator? Eg var noko uroleg for det". Han spotta òg effektiviteten av dei nåværende narkotikaproblemane. "Eg trur det er ganske åpenbart at narkotikaproblem kan omgås i stort sett alle hjørner", sa den 73-årige amerikanaren. Cook sa òg at synet hans på friidrett hadde vorte forurente av det han kjenner og har sett. "Eg følg sporten utan særleg stor ferv eller spenning fordi eg veit for mykje", sa han. "Dersom eg var naiv, likte eg det mykje betre. Eg har vorte litt av ein gong".
Alberto Salazar, trenaren til Mo Farah, seier at han vil visa at ankjarane "vil medvitende framgje falske utsagnar" ettersom han framleis nekter dopingpåstandane.