Ho skreiv om bekymringane sine for konsekvensane av Brexit-avstemninga i eit brev til Theresa May onsdag. Mrs Foster og visepremierminister Martin McGuinness understrekte fem hovudprioriteter til statsministeren. "I fortiden har terroristar nytta grensa som ein måte å unndra seg rettleiing på, og det kan ikkje vera tilfelle i framtida", sa ho. "Vi må sørge for at vi har sterke mekanismar på plass for å sikre at dei ikkje får unna med den typen aktivitet". I brevet sitt understrekte den første og vise-premierministeren til frøken May at Nord-Irland var den einaste delen av Storbritannia som har grense med ein EU-medlemstat. Dei refererte òg til kostnadene, energimarkedet, nedtrekning av EU-finansiering og handsaminga av landbruksnæringsindustrien som andre prioriteringar. Under folkeavstemninga gjorde Demokratisk unionistisk parti (DUP) under Foster kampanje for Brexit, medan Sinn Féin under Martin McGuinness ville bli verande i EU. Når det gjeld økonomien, sa dei at dei ville "bevara så lett som mulig den lettleiken som vi handlar med EU-medlemstatane med". "Det ville vera uaktsomt av meg å ikkje påpeka kvar eg trur utfordringane er i dag", sa Foster. "Vi trekkjer oss ut av EU, og det er sjølvsagt rett at vi identifiserer kvar dei utfordringane ligg, men eg trur at det finst enorme høve". Torsdag sa McGuinness at brevet var "ein svært viktig indikasjon" på at han og Mrs Foster "anerkjenner det enorme ansvaret vårt for folket vi representerer". "Eg trur vi hadde gjort ein alvorlig vondt arbeid om vi ikkje hadde artikulert skilnadane og utfordringane vi kan møta i tidene som kjem", sa han. "Dette handlar om korleis vi vernar om interessene til folket vi representerer og utfordringane som ligg framand". Han la til at det var viktig at han og statsministeren "kom saman etter atkvøtt" til trass for at dei hadde vore på ulike sider av folkeavstemninga. "Mitt klag er ikkje mot Arlene Foster, mitt klag er mot David Cameron som kalla til folkeavstemninga i utgangspunktet", sa han. "Dette er for stort, for alvorleg for oss å ikkje bli samla i samband med korleis vi fører denne prosessen framover". Opposisjonspartiene i Stormont kritiserte brevet, og talsmannen for Ulster Unionist Party (UUP) Steve Aiken spurde "om dette er ein DUP-omvending i posisjonen deira på folkeavstemninga". Mrs Foster svara at posisjonen til UUP om Brexit hadde vore "komisk". Ho la til: "Støflege Steven Aiken har blitt sendt ut att for å vera angrepshund mot styresmaktene, og ærleg talt ser han ut som ein Chihuahua". Men Claire Hanna frå SDLP sa: "Den første ministeren har alvorlige spørsmål å svara på over den pustenfallande omvendte frita ho for tida utfører". "Fra Foster har tydeleg innsett feilene i å støtta Brexit, og no har hesten sleppt og spør den konservative regjeringa om å stenge porten". Mens Storbritannia som heild stemde for å skiljast ut av EU med 52% mot 48%, stemde 56% av folket i Nord-Irland for å verve.
Fyrsteminister Arlene Foster har nekta for at det var eit feilkompleks å gå med på å krevja at Storbritannia skulle skiljast ut av EU.