Hughes har vore med Highlanders sidan desember 2013 og vann Scottish Cup i fjor, den første store æra til klubben. "John vil bli minnt som ein medlem av eit stort vinnande lag", lesa ein kort uttale frå Inverness CT. Hughes var blitt stadig frustrert over tap av viktige medlemmar i laget og snakka om skuffinga sin då ein tilnærming frå Dundee United blei blokkert tidlegare i sesongen. Han var førare manager i Falkirk, Hibernian, Hartlepool og Livingston, og han erstatta Terry Butcher på Caledonian Stadium. I tillegg til å lyfta den skotske cupen, styrte Hughes Inverness til ein tredjeplass i Premiership sist sesong, med denne kampanjen som opna med den første smaken av europeisk fotball. I uttalelsen frå Inverness stod det eit budskap på vegne av Hughes: "Eg vil sjå tilbake på tida mi i Highlands med ein ekte kjærleik og varm kjærleik til klubben, området og samfunnet. "Velkomna eg fekk frå fansen og responsen eg fekk frå spelarane gjennom dei to og ein halv året eg var der, vil leva lenge i minnet, liksom alt anna som vi delte i nokre av dei banebrytande suksessane vi alle hadde saman i den perioden. "Eg kan forsikre etterfølgjaren min om at han vil arva ein fantastisk gruppe spelare, og eg vil gjerne takka kvar og ein av dei for at dei gjorde tida min med dei så vellukka og minneverdig - eg ønskjer dei og klubben alle dei beste framgangsmåta".
Inverness Caledonian Thistle har bekreftet avgang av manageren John Hughes.