Flyet MH370 forsvann på veg frå Kuala Lumpur til Beijing og er framleis savnet, medan MH17 vart skoten ned over austlege Ukraina. Mueller sa at han skulle gå av på grunn av "endring i den personlige situasjonen". Han tok opp jobben sin i mai 2015 for å føre tilsyn med ein ombyggingsplan på 1,56 milliarder dollar som inkluderte massive nedskytingar av arbeid og å droppa ikkje-profitabile destinasjonar. "Vi er svært skuffa over å mista Christoph som administrerende direktør, men vi forstår grunnen til at han gjorde dette og respekterer behovet hans", sa Md Nor Yusof, formann for Malaysia Airlines. Mueller vil fortsette å fungere til september 2016 og vil bli i styresett som ikkje-eksekutiv direktør.
Chief executive for Malaysia Airlines, Christoph Mueller, har gått av etter mindre enn eit år med å ha vore leiaren for omorganisasjonen av flyselskapet.