ГЕНЕТИЧЕСКОЕ РАЗНООБРАЗИЕ ИЗОЛЯТОВ NEISSERIA GONORRHOEAE, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ КАЗАХСТАНА
В настоящем исследовании в геноме Neisseria gonorrhoeae in silico было выявлено девять новых локусов, содержащих варьирующие по числу тандемные повторы (variable number tandem repeats — VNTR). Коллекция из 48 изолятов N. gonorrhoeae, собранных в Алма-Ате, была охарактеризована методами VNTR-анализа, opa-типирования и мультиантигенного типирования последовательностей (N. gonorrhoeae multi antigen sequence typing, NG-MAST). Индекс дискриминации Хантера—Гастона (Hunter-Gaston Discrimination Index, HGDI) для этих методов составил 0,98, 0,97 и 0,95 соответственно. Таким образом, VNTR-анализ является высоко дискриминирующим методом, подходящим для типирования изолятов N. gonorrhoeae.