Молекулярный анализ микробных сообществ ризосфер злаков, выращенных на контрастных почвах
В работе изучали изменения микробного состава ризосферных сообществ при выращивании различных видов и сортов сельскохозяйственных злаков (ржи и пшеницы) в контрастных по ряду агрохимических признаков почвах. Представлены результаты анализа микробного сообщества ризосфер (секвенирование V4-вариабельного участка гена 16S рДНК), а также данные ионного и масс-спектрометрического состава почвенной вытяжки. Индексы альфа-разнообразия ризосферных и контрольных почвенных сообществ практически не различались. Анализ бета-разнообразия показал большую изменчивость микробных сообществ ризосфер растений, выращенных на черноземе. Ризосферные сообщества растений, выращенных на дерново-подзолистой почве, различались меньше и обособлены в отдельные кластеры. Были выявлены таксоны, достоверно принимающие участие в формировании специфического ризосферного микробиома ржи и пшеницы. Найдены как общие ризосферные таксоны (Sphingobacteriia, Betaproteobacteria), так и видо- и сортоспецифичные (Oxalobacteraceae, Sphingobacteriaceae). Содержание ионов в составе почвенной вытяжки существенно зависело от типа почвы, а сходство масс-спектральных профилей в большей степени определялось видом растения, чем типом почвы.