Протеомный анализ N-гликопротеинов синусоидальной поверхности клеток печени крыс с помощью аффинного концентрирования и масс-спектрометрического анализа (обзор)
Гликозилирование белков в клетках печени является одним из наиболее важных видов модификации белков. Гликозилирование белков играет важную роль во многих физиологических и патологических процессах, обусловленную их особым расположением на границе раздела между кровью и тканью, включая ангиогенез, рак, цирроз и фиброз печени. Чтобы проанализировать белки плазматической мембраны клеток синусоидального эндотелия печени (LSЕС РМ - livеr sinиsоidаl еndоthеliаl сеlls, рlаsmаtiс mеmbrаnе), N-гликопротеины, расположенные на поверхности LSЕС РМ, были сконцентрированы благодаря их аффинному связыванию с лектинами, находящимися на фильтрах, и затем были идентифицированы с помощью метода масс- спектрометрии. В целом было выявлено 225 уникальных сайтов N-гликозилирования в 152 гликопротеинах, из которых 119 (53%) сайтов были обнаружены впервые и ранее не определялись экспериментально. Среди идентифицированных гликопротеинов 53% белков были идентифицированы как белки плазматической мембраны и 47 гликопротеинов (31%) - как сигнальные белки и рецепторы. Кроме того, среди мембраносвязанных гликопротеинов LSЕС РМ было обнаружено 23 антигена кластера дифференциации (СD - сlиstеr оf diffеrеntiаtiоn) с 49 гликопептидами. Методами биоинформатического анализа было установлено, что большинство идентифицированных гликопротеинов оказывает влияние на процессы, происходящие в LSЕС. Следовательно, N-гликопротеомный анализ LSЕС РМ может обеспечить получение необходимой информации, касающейся регенерации печени, и облегчить проведение диагностики заболеваний печени.