Zwischen 6:45 Uhr und 7:40 Uhr checkten Atta und Omari zusammen mit Satam al Suqami, Wail al Shehri und Waleed al Shehri ein und stiegen in den Flug von American Airlines Flug 11 nach Los Angeles.
Atta und Omari saßen auf Fenstersitzen, während die anderen auf den Inseln saßen.