மைக்ரோகண்ட்ரோலர்கள் ஆரம்பத்தில் அசெம்ப்ளி மொழியில் மட்டுமே நிரலாக்கம் செய்யப்பட்டன. ஆனால் தற்போது பல்வேறு உயர்-நிலை நிரலாக்க மொழிகளும் கூட மைக்ரோகண்ட்ரோலர்களை இலக்காக்கி பொதுவாக பயன்படுத்தப்படுகின்றன. இந்த மொழிகள் சிறப்புப் பயன்பாட்டிற்காக வடிவமைக்கப்பட்டதாகவோ அல்லது C நிரலாக்க மொழி போன்ற பொதுவான பயன்பாட்டு நிரலாக்க மொழிகளின் பதிப்புகளாகவோ இருக்கின்றன. மைக்ரோகண்ட்ரோலர்களின் தனித்த பண்புகளை சிறந்தமுறையில் ஆதரிப்பதற்கு, பொதுவான பயன்பாட்டு மொழிகளின் கம்பைலர்கள் பொதுவாக சில கட்டுப்பாடுகள் மற்றும் அதிகமாக்கல் ஆகியவற்றைக் கொண்டிருக்கும். சில மைக்ரோகண்ட்ரோலர்கள் சில வகைப் பயன்பாடுகளை மேம்படுத்துவதற்கு உதவும் சூழல்களைக் கொண்டிருக்கும். மைக்ரோகண்ட்ரோலர் விற்பனையாளர்கள் பொதுவாக அவர்களின் வன்பொருளுக்கு எளிதாக ஏற்புடைய கருவிகளை இலவசமாக கிடைக்கக்கூடிய வகையில் உருவாக்குவார்கள்.