आख़िरकार रज़ा शाह ने समस्त लोगों और धर्मगुरुओं को सज़ा देने का आदेश दिया, मशहद शहर की सरकार ने रात के समय अपने सैनिकों को तैयार किया और आधी रात के बाद अपने हमले शुरु किए, इस कार्यवाही से पहले ही मस्जिदे गौहरशाद और शहर के संवेदनशील क्षेत्रों में पुलिसकर्मियों को तैनात कर दिया गया था, मस्जिद के सामने वाली छत पर भारी मशीन गने तैनात कर दी गयी थीं, दोपहर की नमाज़ के समय, सेना के हथियारबंद जवान ईश्वर के घर में घुस गये और लोगों का जनसंहार शुरु कर दिया।