प्रोटोकॉल का ध्यान केंद्रित के साथ साथ एक तरल से निपटने रोबोट और HTP वैद्युतकणसंचलन का उपयोग स्वचालन है, इन तरीकों एक बुनियादी सेटअप के साथ भी प्रयोगशालाओं महंगे उपकरण के लिए किसी भी शर्त के बिना प्रोटोकॉल का लाभ ले सकते हैं जिसका अर्थ है कि यह भी एक उच्च throughput पुस्तिका दृष्टिकोण के लिए उपयुक्त हैं . शुद्धि और विश्लेषण (डाइसल्फ़ाइड युक्त प्रोटीन के लिए विशिष्ट नहीं) के लिए परिवर्तन के लिए मैनुअल प्रोटोकॉल कहीं 24 प्रकाशित किया गया है और यहां दोहराया नहीं जाएगा. recombi द्वारा उत्पादित अभिव्यक्ति क्लोन से मैनुअल प्रक्रिया के throughput (,घुलनशील प्रोटीन के स्तर का विश्लेषण करने के लिए राष्ट्रीय क्लोनिंग 25,) एसडीएस पृष्ठ का पता लगाने के) या 384 (4 x 96 का उपयोग (96 है, (चित्रा 1 देखें)) प्रति सप्ताह संस्कृतियों डॉट धब्बा और एसडीएस पृष्ठ 26 का उपयोग. (जैसे एक कैलिपर GXII LabChip प्रणाली 22 के साथ के रूप में, एक तरल से निपटने रोबोट और डॉट धब्बा 26 या HTP वैद्युतकणसंचलन का उपयोग कर एक अर्द्ध स्वचालित तरीके से प्रदर्शन करते हैं तो यह बढ़ाया जा सकता है इस के साथ साथ वर्णित के रूप में एक सप्ताह से अधिक समानांतर में अप करने के लिए 1,152 (12 x 96) संस्कृतियों, को परिणाम) के विश्लेषण के लिए. नियमित मिलाते इन्क्यूबेटरों पर्याप्त वेंटिलेशन के लिए छोटी कक्षीय उच्च गति मिलाते इन्क्यूबेटरों के उपयोग की जरूरत है, जो 96 (DW96) स्वरूप, (मिलाते हुए गहरे कुएं में उगाई संस्कृतियों के विपरीत इस्तेमाल किया जा सकता है, ताकि संवर्धन गहरे कुएं 24 (DW24) प्रारूप में किया जाता है 800 rpm पर). ऑटो प्रेरण मीडिया 27 का उपयोग भी मार्गदर्शन प्रेरण कदम को नष्ट करने, अभिव्यक्ति सरल करता है. प्रयोगशालाओं पहले से ही पूर्व निर्धारित अभिव्यक्ति और पुरी का उपयोग यहां तक ​​कि जहांदिखाएं शर्तों, इन बस दक्षता में सुधार करने के लिए इस HTP सिस्टम में सीधे हस्तांतरित किया जा सकता है. डाइसल्फ़ाइड युक्त प्रोटीन के लिए उच्च throughput प्रदर्शन पाइपलाइन की एक विस्तृत योजनाबद्ध चित्रा 3 में प्रदान की जाती है. पाइपलाइन में मापदंडों हमें प्रोटीन के उत्पादन के लिए सबसे उपयोगी स्थितियों का चयन करने की अनुमति दी है जो व्यापक प्रदर्शन प्रयोगों 11, 22, के आधार पर चयन किया गया था.