1481 жылы Фатих Анадолуға жаңа жорыққа аттанды. Бірақ жолшыбай ауырып, 3 мамыр 1481 жылы Гебездің маңындағы Хункар даласындағы қонысында қайтыс болды. Ол індеттен қайтыс болған деп саналады, бірақ уланған деп айтылады. Жеңімпаз қайтыс болғаннан кейін, оның өлімі жасырылды. Патшаның ваннаға мұқтаж екендігі айтылып, оның мәйіті патша сарайында жасырын түрде өткізілді. Сол кезде ханзада Баязид пен ханзада Джемге хабаршы жіберілді. Сол кезде сарбаз Фатихтің өлгенін біліп, Стамбулға келеді де, үлкен анархия басталады. Қарамандық Мехмед Паша Жемнің жақтасы болғандықтан, өлім жазасына кесілді. Барлық жерде тонау басталды. Мұсылман емес саудагерлердің үйлері мен дүкендеріне шабуыл жасалды. Осы уақыт аралығында әркім өз жақтастарын тақтан шығаруға тырысып жатқанда, Фатихтің жерлеу рәсімі сарайдың қараңғы бөлмесінде ұмытылды. Балташылар кесіуінен Қасым есімді адамның ІІ Баязидке жазған хатында, ол сарайда жерлеуге келгенде, үш күн, үш түн бойы оның үстінде шам жанып тұрмағанын, оның денесінің иісімен оған жетуге қиын болғанын айтады. Кейіннен ішкі мүшелері алынып, мәйітті инкубатормен бірге инкубациялайды. Оның денесін емделу үшін киімдерін шешуге тура келді. Бірақ ыстық ауа райынан кейін денесі бүлінгендіктен, киім оның денесінде қалады. Сол себепті оның сол қолынан киімін кесіп алып, тікенеді. Кесілген киім бүгінге дейін Топкоппи сарайында сақталған. II. Баязидтің астанаға келгеніне дейін күтіп тұрды. Оның өлімінен кейін оның ұлы Баязид таққа отырды. Ол Fatih мешітіндегі қабірінде жатыр. Оның қайда сапар шегіп жатқаны белгісіз. Себебі, Фатих бұл ақпаратты саяхат қауіпсіздігі үшін өте құпия ұстап, ешкімге айтпады. Алайда тарихшылар бұл сапарды Мысырға немесе Римге бағыттау керектігін болжап отыр. Бірақ басқа кітаптар мен тарихшылар оның басқа жерлерді жаулап алуы керектігін айтады. Ол өз әскерлерін Үскүдарда жинап, дайындықты бастағандықтан, қазіргі тарихшылар бұл жорықтың Италияға болуы мүмкін деп ойламайды.
Фатих Сұлтан Мехмед қай күні қайтыс болды?
3 мамыр 1481 жылы