Masjid Jami Karaton Sambas iki wiwitane yaiku daleme sultan kang didadhiake langgar. Kabangun déning Sultan Umar Aqomuddin kang merintah Negeri Sambas ing taun 1702-1727 Masehi, banjur masjid cilik iku direnovasi déning putrane, Sultan Muhammad Saifuddin lan dikembangake dadi masjid jami lan diresmiake ing tanggal 10 Oktober 1885 M. Masjid iki kacathet kados masjid tuwa dhéwé ing Kalimantan Kulon.