Džeko main kanggo Bosnia wiwit timnas U-19. Tetandhingan debuté bareng Timnas Bosnia-Herzegovina ya iku nalika nglawan Turki tanggal 2 Juni 2007. Panjenengané ngoleksi 9 gol sasuwéné Kualifikasi Piala Donya FIFA 2010 lan dadi panyétak gol keloro paling akèh ing kualifikasi zona UEFA bareng juru main Timnas Inggris, Wayne Rooney. Ing ngisor cathetan juru main Timnas Yunani, Theofanis Gekas kanthi sepuluh gol..