Wiwitane, stasiun iki nggunakake sistem sinyal mekanik lan duwe enem jalur sepur kanthi garis 3 dadi garis lurus ditambah loro trek badug tumuju gudang ing sisih kulon stasiun, saben trek badug ing sisih lor lan kidul stasiun, lan siji trek Badug sing ana ing antarane garis lawas 3 lan 4. Sawise garis dobel ing bagean saka stasiun iki menyang Stasiun Bojonegoro dioperasikake kanthi resmi ing pertengahan April 2014 lan banjur nganti Stasiun Kandangan ing wiwitan Mei 2014 , jumlah garis tambah dadi pitung. Trek badug ing wilayah tengah diganti garis anyar 4 dadi garis lurus kanggo arah Surabaya, jalur 3 digunakake minangka garis lurus kanggo arah Semarang wae . Kajaba iku, sistem sinyal wis diganti karo sistem sinyal listrik.