Dalam perjalanan sejarahnya, STAIN Jember kemudian menjadi sebuah perguruan tinggi agama Islam milik pamaréntah. Antara lain, pada 21 Fèbruari 1966 (Senin, 30 Syawal 1385) Fakultas Tarbiyah IAID kanthi resmi dinegerikan menjadi Fakultas Tarbiyah IAIN Sunan Ampel Cabang Jember. 