Kanthi dhasar SK Dirjen Dikti Depdikbud No. 345/DIKTI/Kep/1995 tanggal 26 Juli 1995, IKIP Muhammadiyah Purwokerto kaubah dadi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Nganthi taun 1995, Universitas Muhammadiyah Purwokerto duwé memiliki enem fakultas, ya iku Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan (FKIP), Fakultas Agama Islam, Fakultas Ékonomi, Fakultas Pertanian, Fakultas Perikanan lan Fakultas Teknik.