Fauna Indonésia inggih punika manéka warna jinis kéwan ingkang wonten ing Indonésia. Fauna ing Indonésia gadhah rupa ingkang inggil amargi wlayahipun wiyar lan amargi wujud kapuloan Indonésia ingkang gadhah iklim tropis. Rupa fauna ingkang inggil punika dipunjalari amargi wonten Garis Wallace, mbagi Indonésia dados kalih area inggih punika "zoogeografi Asia" ingkang kénging pangaribawa saking fauna Asia, lan zona "zoogeografi Australasia" ingkang kénging pangaribawa saking fauna Australia. Wontenipun campuran fauna ing Indonésia punika ugi kénging pangaribawa saking ékosistem ingkang manéka warna ugi, ing antawisipun: pasisir, bukit pasir, muara, hutan bako, lan terumbu karang.