Salah satu efek samping yang paling sering timbul dengan pemberian laktulosa adalah diare, hipokalemia, dan hipernatremia terutama pada individu dengan usia tua. Peningkatan kadar amonia di dalam usus besar akan menyebabkan peningkatan tekanan intrakolon sehingga mengakibatkan kondisi pneumatosis intestinal (pembentukan kista berisi gas di dalam usus). Efek samping yang lainnya adalah kram perut, distensi abdomen akibat gas, sering buang angin, serdawa, mual dan muntah. Pada pemberian laktulosa yang berlebihan, akan timbul asidosis metabolik akibat hiperkloremia, asidosis laktat, dehidrasi, dan gangguan keseimbangan cairan dan elektrolit. Beberapa individu akan memberikan reaksi alergi seperti kulit memerah, gatal, bengkak (di wajah, lidah dan tenggorokan), pusing, dan kesulitan bernapas.