Warak jawa lan India iku siji-sijiné anggota genus Rhinoceros kang sepisanan muncul ing rekaman fosil ing Asia sekitar 1,6 yuta-3,3 yuta taun kepungkur. Prakiraan molekul mènèhi tabet manawa spesies wis kabagi luwih awal, sekitar 11,7 yuta taun kapungkur.[13][15] Sanajan mlebu ing tipe genus, warak jawa lan India dipercaya ora cerak gandhengané karo spesies warak liyané. Panlitén kang béda wis ngetokaké hipotesis manawa warak iku mungkin cerak gandhengané karo Gaindetherium utawa Punjabitherium kang wis punah. Analisis klad Rhinocerotidae mapanaké