Museum punika resmi dipunbangun nalika surya kaping 10 Juni 1793, salaminipun Revolusi Prancis.[3] Ananging asal-usulipun muséum punika dipunbangun inggih punika nalika Jardin des Plantes médicinales royal (taman kerajaan ingkang lèbètipun wonten waneka werni tetandhuran obat), salah satunggaling lembaga èlmiyah paling tuwa ing Prancis, ingkang dipunbangun amargi royal dekrit taun 1635 nalika masa pamerintahan Louis XIII saking Prancis.[3] Amargi dipunbangun kagem lembaga, mila ingkang jaga Muséum National d'Histoire Naturelle sarta ingkang nyèpeng cathetan penting punika para dhokter.[3]