pira-pira panalitèn berspekulasi yèn sing gawa grup haplo C3 sing minoritas ing antarané suku Ainu iki mungkin ndudohake siji sipat teka prabawa genetik siji arah saka suku Nivkh, sing karone suku Ainu wis sue duwé interaksi budaya. Meturut Tanaka "et al." (2004), garis mtDNA mereka racaké saka grup haplo Y (21,6%) lan grup haplo M7a (15,7%). Evaluasi manèh ing akir-akir iki tentang ciri-ciri balung tengkorak mereka ndudohake yèn suku Ainu lewih mirib kaliyan suku Okhotsk tinimbang suku Jōmon. Hal iki pas kaliyan rujukan ing budaya Ainu seng dadi gabungan saka budaya Okhotsk lan Satsumon sing dirujuk ing dhuwur mau.