Nalika tanggal 27 Fèbruari 2007, Pura Pagaruyung nandhang kabakaran ageng amargi bledhèg ingkang nyamber pupusipun pura.. Amargi kabakaran punika, wangunan pura punika rata kaliyan lemah. Dhokumén-dhokumén lan rerenggan ingkang wonten ing salebetipun pura ndhèrèk kabakar. Kinten-kinten namung 15 persén dhokumen lan bandha ingkang slamet. Bandha ingkang slamet saking kabakaran punika sapunika dipunsimpen ing Balai Benda Purbakala Kabupatèn Tanah Datar. Ragad ingkang dipunanggé kanggé yasa malih pura punika kinten-kinten nelasaken arta langkung saking Rp 20 miliar. Bandha pusaka Karajan Pagaruyung dipunsimpen ing Istano Silinduang Bulan, 2 kilomèter saking Pura Pagaruyung.