Miturut legenda, pura iki dibangun karo salah sawijiné brahmana kang asalé saka Jawa. Dhèwèké ya iku Danghyang Nirartha kang bisa nguwataké kapitayan pandhudhuk Bali ngenani ajaran Hindu lan mbangun Sad Kahyangan iku nalika abad kaping 16. Nalika iku kang nguwasani Tanah Lot ya iku Bendésa Beraben,nduwèni rasa iri karo brahmana iku Dhèwèké iri amarga akèh anak buahé kang ninggalaké ajarané lan melu Danghyang Nirartha.Bendésa Beraben ngongkon Danghyang Nirartha supaya ninggalaké Tanah Lot.Dhèwèké nyanggupi ananging sadurungé ninggalaké Tanah Lot dhèwèké kanhti kakuwatané mindhahaké watu ing tengah pasisir dudu ing tengah segara.Dhèwèké banjur mbangun pura ing kono. Dhèwèké uga bisa ngowahi sléndhangé dadi ula kang bakalé njaga pura.Ula iki isih ana nganti saiki lan miturut ilmu kang ilmiah ula iki kalebu jinis ula laut kang nduwèni ciri-ciri buntuté kang trépés kaya iwak.Ula laut iki wernané ireng lan rada belang-belang kuning.Ula laut iki uga nduwèni racun kang kakuwatané kaping telu luwih kuwat tinimbang ula cobra, Ing akhir legenda diterangaké yèn