Kongkonan program kalebu ing non-volatile flash memory. Nalika MCUs iku 8bit, kabéh instruksi njupuk siji utawa loro tembung-tembung 16bit. ukuran program memory iku jlèntrèhaké jeneng sing ana ing alat iku, kadasta (ATMéga 64x iku nduwèni 64 KB saka flash mémory lan nalika piranti iku jenengé ATMéga32, ATMéga iku saka 32Bit Flash Memory) Ora ana ketentuan kanggo Off-Chip mémory program, kabèh kode digarap karo AVR core musthi ana ing njero chip flash. Nanging, imitasi iku ora isa didawuhaké ing kabèh