Sekretariat Jenderal inggih punika unit eselon I ingkang mapan ing sangandhaping Kamenterian Keuangan. Sekretariat Jenderal, asring dipuncekak kanthi nama Setjen, inggih dipunpandhegani déning Sekretaris Jenderal ingkang asring dipuncekak dados "Sekjen". Wonten ing tanggal 13 Januari 2012, Mantri Keuangan nglantik Kiagus Ahmad Badaruddin dados Sekjen ing Sekretariat Jendral Kamentrian Keuangan Indonesia nggantosaken sekjen ingkang rumiyin inggih punika Mulia P. Nasution.