Generasi kaping kalih punika jumeneng taun 1601 ingkang wonten dumugi sapunika. Jongmyo punika dipun-ubengi déning tembok persegi dawa kanthi gerbang dhateng kidul, wétan, lan kilen. Gerbang utama kuil boten kenging dipunliwati déning sinten kemawon. Déné gerbang wétan khusus kanggé raja lan gerbang kulon kanggé para pemain musik. Bangunan punika dipundominasi struktur kayu lan lantai granit. Kamar-kamar ing kuil kapérang dhateng bilik-bilik kanthi ornamen kayu abang kanthi wiyar 5.190 meter persegi [3].