Guardiola miwiti debut senior ing tanggal 14 Oktober 1992 nalika main imbang 0-0 karo Irlandia Lor ing Windsor Park ing kualifikasi Piala Dunia. Ing taun sing padha, Guardiola dadi kapten Spanyol nalika menang medali emas ing Olimpiade Barcelona. Ana ing taun iki nalika dheweke menangake Penghargaan Bravo, sing ngakoni pemain paling apik ing donya kanthi umur 21. Antarane 1992 lan 2001, Guardiola main kaping 47 kaping lan mencetak limang gol kanggo tim senior Spanyol. Dheweke dadi anggota tim Spanyol nalika Piala Dunia 1994, ing endi dheweke entuk perempat final, kalah 2-1 saka Italia. Dheweke ora seneng karo Javier Clemente, manajer Spanyol, amarga ora setuju lan gagal ing Euro 1996. Dheweke ngalami cedera sing ngancam karier ing taun 1998, sing ndadekake dheweke ora bisa main ing Piala Dunia 1998, nanging banjur main ing Euro 2000, ing ngendi dheweke nuntun Spanyol menyang babak perempat final liyane, kali iki dikalahake Prancis kanthi wates sing padha, 2-1. Dheweke dadi lini tengah Spanyol nganti penampilan terakhir kanggo la Roja, menang 1-0 ing pertandingan persahabatan nglawan Meksiko tanggal 14 November 2001; dheweke nyetak gol internasional pungkasan nglawan Swèdhen nalika seri 1-1 nalika penampilan kaping 45.