Ing tanggal 14 Juli 2005, Pizarro ditransfer ing F.C. Internazionale Milano kanthi biaya € 10 yuta (ditambah setengah saka hak Goran Pandev, sing Lazio tuku setaun salanjuté € 4 yuta) kanthi kontrak petang taun. Ing wektu iku, Pizarro ngeklaim manawa panjenengané pengen pensiun saka Nerazzurri. Nanging, Pizarro mapan ing bangku cadangan nalika akèh kesempatan, amarga persaingan kanggo posisiné karo bintang Argentina Juan Sebastián Verón.