Taun 1995, ATR 42 ingkang sanèsipun dateng, sami kaliyan penumpang ing kalih yuta. Taun 1996, "Croatia Airlines" dados maskapé kawiwitan ingkang terbang ing Sarajevo sasampunipun Perang Bosnia. Taun 1997 Airbus A320 kawiwitan gadhah maskapé dateng lan diparingi asma "Rijeka". Taun 1998, pesawat kawiwitan saking jinis sanès dateng ing Airbus A319 kawiwitan gabung kaliyan armada. Pesawat punika dipunparingi asma "Zadar". Ing taun ingkang smai, Croatia Airlines dados anggota saking Asosiasi Maskapé Penerbangan Éropa (AEA). Taun 1999, kalih malih jet Airbus dateng lan Croatia Airlines miwiti sade pesawat Boeing ingkang dados pérangan sakingarmada sadèrèngipun. Maskapé nerbangaken penumpang kelimajutanipun.