Pilihan umum Indonésia 2004 iku pemilu pisanan sing ngéntukaké rakyat milih présidhèn kanthi langsung, lan cara pamilihané nyata-nyata béda karo Pemilu sadurungé. Ing Pemilu iki, rakyat bisa milih langsung présidhèn lan wakil présidhèn (sadurungé présidhèn lan wakil présidhèn dipilih déning MPR sing anggota-anggotané dipilih liwat Présidhèn). Saliyané iku, ing Pemilu iki pamilihan présidhèn lan wakil présidhèn tidak dilakukan kanthi terpisah (seperti Pemilu 1999) -- sajeroning Pemilu iki, sing dipilih yaiku pasangan calon (pasangan calon présidhèn lan wakil présidhèn), bukan calon présidhèn lan calon wakil présidhèn kanthi terpisah.