Pambentukan Guwa Karangbolong kadayan déning peruntuhan kang kadadosan ing sapanjang wates babagan antawis breksi kaliyan sela pasri utawi sela lempung. Lubang peruntuhan badhé tambah agung amargi lapisan selan kang menggantung ing payon lubang salajeng jugrug akibat awratipun. Prosès punika ugi dipicu déning kekar-kekar kang ana, kang kedhainganipun memperlemah daya ikat antarkomponen selan. Prosès pambentukan gua sangeti saé ing ujung wétan ugi kidul Goa Karangbolong, ing pundi ana skala timur kadadosan peruntuhan selan ing sapanjang wates lapisan kang bènten. amargi sanès gua sela gamping, mila ing lebet Goa Karangbolong mboten dipunpanggihi ornamen.