Bentuk wangunan Masjid Perak iki ngetutaké bentuk saka budhaya ing lingkungan masarakat. Payon masjid nganggo bentuk joglo lan ana 4 saka guru kang bentuké rada lancip. Saka guru kuwi mau ana ing duwu umpak kang bentuke bunder dawa lan ana tembok kang dadi wates ruangan masjid sisih lor lan kidul. Masjid Perak Kotagde duwé alat kang jenengé jam bencet utawa jam matahari. Jam bencet kuwi mau kanggo mangertèni wektu salat. Nanging, jam bencet iki wis angèl ditemokaké ing masjid-masjid jaman saiki. Ing njero masjid uga ana kaligrafi kang dipasang ana ing duwur lawang utama masjid. Kaligrafi ing njero masjid mung ana siji kuwi mau lan ora ana kaligrafi kang dipasang manèh supaya para jamaah bisa khusyu anggoné salat. Ing ngarep masjid ana papan kanggo wudhu wujudé bak, nanging sawisé masjid dibangun manèh ing taun 1960 papan kanggo wudhu kuwi wes ora ana manèh. Saliyané kuwi, uga wis ora ana manèh sumur lan jam matahari ing Masjid Perak Kotagede.