Muhaimin nikah karo wong wadon kang jenengé Rustini Murtadho. Saka pernikahan iki, Mujaimin nduwé anak loro kang jenengé Mega Safira kang lair tanggal 4 Maret 1996 lan Rahma Arifa kang lair nalika tanggal 29 Fèbruari 1999.