Zeeman miyos wonten ing Zonnemaire (ing pulo Schouwen-Duiveland, provinsi Zeeland) saking Wilhelmina Worst kaliyan Catharinus Farandinus Zeeman, satunggaling mantri Lutheran. Piyambakipun ngangsu kawruh wonten ing HBS ing laladan Zierikzee ingkang sami celak lan lajeng sinau basa-basa klasik ing gimnasium wonten ing Delft antawis 2 taun. Sadangu punika, piyambakipun nerbitaken lapuran babagan aurora borealis ingkang katingal saking Zonnemaire. Piyambakipun mlebet wonten ing Universitas Leiden nalika taun 1885, ing pundi piyambakipun sinau sesarengan kaliyan Hendrik Lorentz lan Heike Kamerlingh Onnes lan dados asisten wonten ing laboratorium Heike Kamerlingh-Onnes nalika taun 1895. Piyambakipun pikantuk gelar dhoktor nalika taun 1893 kanggé disertasinipu babagan punapa ingkang dipunwastani efek Kerr, kanggé panalitén ing pundi piyambakipun pikantuk medali emas saking Hollandsche Maatschappij wonten ing taun sadéréngipun. Sabibaripun satunggal taun wonten ing Institut Kohlrausch, Strasbourg, piyambakipun dados "privatdozent" wonten ing Leiden lan palakrama kaliyan Elisabeth Lebret, ingkang dipunparingi 1 putra lan 3 putri. Saking taun 1896 dumugi pensiun, Zeeman wonten ing fakultas ing Universiteit van Amsterdam (dhosèn, taun 1896; luar biyasa, 1900; biyasa, 1908). Nalika taun 1908 piyambakipun nggantosi Johannes van der Waals minangka direktur laboratorium fisika universitas punika, Lembaga Fisika.