Sawise metu saka Barcelona ing taun 2001 ing umur 30 taun, Guardiola gabung karo sisih Serie A Brescia minangka pengganti Andrea Pirlo ing peran main play-in, mula dheweke main bareng Roberto Baggio ing sangisore manajer Carlo Mazzone. Sawise tugas ing Brescia, Guardiola pindhah menyang Roma. Nanging ing Italia, dheweke durung sukses lan kalebu larangan papat wulan kanggo tes positif nandrolone. Nenem taun mengko, tanggal 23 Oktober 2007, Guardiola dibebasake saka banding kabeh tuduhan sing gegandhengan karo larangan kasebut. Nanging, CONI, mbuka maneh kasus kasebut marang pemain kasebut amarga nganggep absolusi kasebut ora bisa ditampa, nanging dheweke dibebasake maneh tanggal 29 September 2009.