Pura kang ambané 2.400 m² diyasa nalika jaman pamrintahan Gubernur Jènderal J.W. van Lansberge taun 1873 ing kaveling kang isih sapanggonan karo Pura Rijswijk. Ing pisanan, Istana Merdeka ajejuluk Istana Gambir. Pura kang diarsitèki déning Drossaers ing wiwitan jaman pamrintahan Républik Indonésia (RI) tau dadi saksi sajarah penandatangonon naskah pengakuan kedaulatan Rèpublik Indonèsia Serikat (RIS) déning Pamrintah Walanda tanggal 27 Dhésèmber 1949. Nalika iku RI diwakili déning Sri Sultan Hamengkubuwono IX, déné kraton Walanda diwakili A.H.J. Lovink, wakil tinggi makutha Walanda ing Indonèsia.