Penobatan Ekskul dados Film ingkang saé menuai kontroversi saking Masarakat Perfileman Indonésia (MFI). MFI ingkang kapérang saking sejumlah insan perfileman ing antawisipun Sutradara Riri Riza lan Mira Lesmana ingkang meraih Piala Citra 2005 kanggé filem Gie lan kathah 22 peraih Piala Citra saking taun 2004 ngantos 2006 memprotes penyelenggaraan FFI 2006 punika amargi sampun maringi penghargaan Film ingkang saé ing filem Ekskul lan Sutradara Terbaik ing sutradaranipun, Nayato Fionuala, ingkang miturut punika sarat kaliyan unsur plagiat. ing pernyataan sikapipun, MFI nyampaikaken pernyataan sikap ndésak pembubaran Lembaga Sensor Film, lan nolak kasil penjurian Festival Film Indonésia (FFI) taun 2006.