Miturut sejarahipun, Museum Bahari punika salah setunggaling wewangunan ingkang sampun dangu saking paninggalan VOC.[1]Museum punika dipundamel ingkang sepisanan nalika taun 1652 M.[1] Nalika jaman penjajahan Walanda (VOC), wewangunan punika dipunginakaken kanggé gudhang kangge nyimpen, milih saha ngepaki asil bumi ingkang dados komoditas utama VOC inggih punika rempah-rempah saha pakeyan.[1] Kekalihipun punika laris sanget menawi dipunpasaraken wonten Éropah.[1] Rempah-rempah punika kadosta pala, mrica, saha kopi, tèh, lan kain.[2] Wewangunan punika manggen persis wonten ing pinggiripun kali Ciliwung.[1] Wewangunan punika wonten ingkang manggèn ing sisih wétan saha wonten ugi ingkang manggèn ing sisih kilèn.[1] Namanipun inggih punika