Dhèwèké aktif ana ing Front Pembebasan Eritrea (FPE) nalika taun 1966, banjur nalika taun 1987 dadi sekretaris jenderal Front Pembebasan Rakyat Eritrea (FPRE), kang wiwitane cabang saka FPE, nanging nalika iku dadi kelompok perlawanan kang dominan ana ing Eritrea. Isaias Afewerki diakoni dadi perancang strategi kang ana ing pungkasane dimungkinake FPRE ngalahake lan mbusak FPE dadi obahan pembebasan kang utama ing Eritrea, sawatara nalika iku kang pada ningkatake efektivitas kelompoke kanggo nglawan wadyabala-wadyabala Kaisar Haile Selassie lan rezim Derg Ethiopia. Bareng karo Meles Zenawi saka Front Pembebasan Rakyat Tigrea, dhèwèké nganakake aliansi kang padha nguntugake kang pungkasane bisa ngawa kekaron obahan mau meyang Addis Ababa kang tujuwane kanggo nggulingake rezim Derg nalika taun 1991 lan bisa merdeka mawa referendum taun 1993.