Ing pungkasan jendela transfer Januari 2009, Moyes nggawa striker internasional Brasil Jô kanthi utangan saka Manchester City. Ing tanggal 14 Oktober 2008, Moyes setuju kanggo jangka masa tinggal Taman Goodison suwene limang taun. Ing tanggal 19 April 2009, Moyes nuntun timnya menyang kemenangan semi final Piala FA nglawan Manchester United, sawise adu penalti, kanggo entuk final kaping pisanan wiwit 1995. Ing endi penampilan Everton ing final sajrone Wektu Moyes ing klub kasebut, Everton dikalahake 2-1 dening Chelsea sanajan wis unggul liwat Louis Saha ing menit pambuka.