Paguron Tinggi Islam Negri ing Indonésia ana ing sangisoré tanggung jawab Kamentrian Agama. Ana telu jinis paguron dhuwur sing kalebu sajeroning kategori iki, yaiku Universitas Islam Negri (UIN), Institut Agama Islam Negri (IAIN), lan Sekolah Tinggi Agama Islam Negri (STAIN). Ing saben provinsi ing Indonésia lumrahé ana siji UIN, IAIN, utawa STAIN.