Basa-basa asli Taiwan duwé sujarah sing padha amarga Taiwan dianggep dadi panggon mula bukané kabèh basa ing kulawarga basa Austronésia. Miturut ahli basa Robert Blust, basa-basa Formosa iki cawang sanga saka sepuluh cawang pokok ing kulawarga basa Austronésia, sawatara cawang siji liyané nurunaké mèh 1.200 basa ing kulawarga Malayo-Polinésia ing sajabané Taiwan. Sanajan ana ahli basa sing ora sarujuk karo apa sing ditaliti Blust, akèh-akèhé ahli basa sarujuk yèn basa-basa saka kulawarga Austronésia iku asalé saka Taiwan. Téyori iki uga dikuwataké déning kajian anyar ing génetika populasi manungsa, sing uga nguwataké sipat garis ibu ing migrasi manungsa.