Nalika tanggal 15 Fèbruari 2003, Muhammad Nuh dilantik dadi rektor ITS. Ing taun kang padha Nuh uga dilantik dadi guru besar (profesor) babagan ngèlmu "Digital Control System" kanthi Sistem Rekayasa Biomedika. Dhèwèké dadi rektor ITS paling enom ya iku umur 42 taun nalika njabat dadi rektor. Nalika dadi rektor ITS Nuh nulis buku kang judhulé "Startegi dan Arah Kebijakan Pemanfaatan Teknologi Informasi dan Komunikasi" (disingkat Indonesia-SAKTI).