Ing sasi Januari 1943 Amir katangkep fasis Jepang ing satengahing gelombang-gelombang panangkepan kang ana ing Surabaya. Kadadeyan iki bisa dinyana minangka kabongkare jaringan organisasi anti fasisme Jepang kang ana gegayutane karo Amir. Apa manèh saka turahan golongan iki Amir suk mben bakalan dadi Mantri Pertahanan, barengan karo kanca-kancané rakete kang ngrewangi. Nanging identifikasi wigati saka kedadeyan Surabaya iku, hukuman paling abot diwènèhake menyang tilas para pandhegan Gerindo lan Partindo Surabaya saka sidhang pangadilan kang dianakake ing taun 1944.