Métabolit sékundèr ya iku senyawa metabolit kang ora esensial tumrap modhote organisme lan tinemu ing wujud kang unik antarané spésies siji lan liyané. Saben organisme lumrahé ngasilaké senyawa metabolit sekunder kang béda-béda, malah bisa baé siji senyawa metabolit sekunder mung tinemu ing siji spésies ing siji kingdom. Senyawa iki ora mesti ngasialke, nanging mung nalika dibutuhake utawa ing fase-fase tertentu. Fungsi matabolit sekunder ya iku kanggo mertahanake awak saka kondisi lingkungan kang ora apik, tuladhané kanggo ngatasi hama lan lelara, narik polinator, lan minangka molekul sinyal. Intine, metabolit sekunder digunakaké organisme kanggo interaksi marang lingkungane.