Agama Kristen ing Jepang mlebu liwat rute perdagangan ing abad kaping 19. Wong Jepang seneng karo ilmu lan teknologi saka Kulon, dadi luwih terbuka nalika agama Kristen mlebu. Malah, pamrentah Jepang dhewe milih wong Kristen dadi guru ing universitas sing wis ana. Keterbukaan Jepang ing wektu iki nyedhiyakake papan kanggo jemaat Kristen sing wis dikabarake injil udakara abad kaping 16, nanging ana tekanan saka negara kasebut mula kepeksa ndhelik. Nanging, Nikolai, pandhita konsul saka Ruslan iso mbangun Greja Orthodok Ruslan ing Jepang. Greja Protestan uga sukses ing antarane para samurai amarga dheweke kepincut karo prinsip kepatuhan lan pelayanan ingkang ditawakake Protèstan. Kajaba iku, masa kebangunan rohani sing kedadeyan udakara taun 1880 uga nyumbang tumrap tuwuhing greja kanthi cepet. Salah sawijining perjuangan utama jemaat Kristen ing Jepang yaiku nasionalisme Jepang ingkang ana gandhengane karo agama Shinto, saengga dheweke angel golek kesetiaan kangge negara kasebut uga kangge agama Kristen dhewe. Kajaba iku, pecahe Perang Donya II nyebabake konflik kesetiaan ing antarane jemaat Kristen lan negarane dadi saya parah. Kejaba perkara kasebut, ana sawetara tokoh Kristen sing duwe peran kanggo Jepang, kayata Toyohiko Kagawa.