Fungsi isoflavonoid akèh-akèhé durung ana kang ngerti, nanging ana kang minangka zat alelokimia. Tuladhané, rotenon, isoflavonoid saka oyot tuba ("Derris ellipica"), akèh digunakaké minangka insektisida (senyawa pambasmi gegremet). Saliyané iku rumus bangun isoflavonoid memper karo hormon estrogen kéwan, tuladhané estradiol, lan isoflavonoid tuwuhan tinamtu nyebabake kemandulan ing ternak wadon, kususe wedhus gibas. Semanggi ngisor-lemah ngurugi isoflavonoid kanthi cacah kang akèh banget. Senyawa iki nyebabake "lelara semanggi" kang racaké ing wedhus gibas, kawiwitan kacathet ing Australia Barat ing taun 1960-an kanthi sudane tingkat kasuburan. Isoflavonoid uga diprediksekake minangka faktor kang ngendhalekake populasi kéwan pangerat ing pirang-pirang wewengkon tinamtu.