Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri (STAIN) Kudus utawa STAIN Kudus ya iku Perguruan Tinggi Agama Islam Negri ing Kudus Provinsi Jawa Tengah, Indonésia. STAIN Kudus diadhekaké adhedasar Surat Dudutan Présidhèn Nomor 11 Tanggal 21 Maret 1997 kang bebarengan kanthi Tanggal 12 Dzulqaidah 1417 H.