Tanggal 22 Agustus 1997, Mgr. Pujaraharja kajibah dadi Uskup Ko-konsekrator bareng Uskup Agung Tituler Bellicastrum uga Nuncio Apostolik kanggo Indonesia, Mgr. Pietro Sambi, ing adicara panahbisan Mgr. Ignatius Suharyo minangka Uskup Agung Semarang. Kardinal Julius Darmaatmadja, S.J. dadi Uskup Penahbis Utama.