Ing Kapuloan Derawan ana sawetara ekosistem pesisir lan pulo cilik sing wigati banget ya iku terumbu karang, padang lamun lan alas bakau (alas mangrove). Saliyané iku akèh spesies sing diayomi dumunung ing Kapuloan Derawan kayata penyu ijo, penyu sisik, paus, lumba-lumba, kima, yuyu klapa, duyung, iwak barakuda lan sawetara spesies liyané.