Universitas Muhammadiyah Purwokerto ya iku alih wujud saka IKIP Muhammadiyah Purwokerto, kang sampun diadhekake ing tanggal 5 April 1965. IKIP Muhammadiyah Purwokerto ya iku cabang saka IKIP Muhammadiyah Surakarta. Tahun 1968 IKIP Muhammadiyah Surakarta Cabang Purwokerto misah lan alih jeneng dadi IKIP Muhammadiyah Purwokerto.