Carrel dipunlairaken ing Sainte-Foy-les-Lyon, laladan pinggiran kutha Lyon, Perancis. Piyambakipun minangka putra paling sepuh saking 3 sadhérék, 2 kakung lan satunggal putri, wonten ing kulawarga Katholik Roma. Ibunipun, Anne-Marie Ricard, minangka putri pedagang linen. Bapakipun, Alexis Carrel Billiard, minangka pekerja ing pabrikan tekstil. Carrel ninggalaken nama baptisipun, Marie Joseph Auguste, lan dipunkenal minangka Alexis Carrel nalika sédanipun sang bapak nalika piyambakipun nembé umur 5 taun..