Alexandre Berthier je umrl leta 1799.
Še leta 1799 so duhovnike zapirali ali pošiljali v kazenske kolonije, preganjanje pa se je še poslabšalo, ko je francoska vojska, ki jo je vodil general Louis Alexandre Berthier, zajela Rim in zaprla papeža Pija VI., ki je nato avgusta 1799 umrl v ujetništvu v mestu Valence v francoski pokrajini Drôme.