على الرغم مما ذكر من وجود بدائل تقنية متوافرة للغالبية الساحقة من استخدامات بروميد الميثيل، أبلغت لجنة الخيارات التقنية لبروميد الميثيل أن بعض مجالات الاستخدام تتسم بقدر أكبر من الصعوبة بما في ذلك بعض أوضاع المشاتل النوعية حيث تطلب الأمر وجود شهادة اعتماد قبل عملية إعادة غرس نبات الجنسينج والقضاء على حشرة الاستريجا والبومريب (Orobanche spp.