كما أن الصندوق، ضمن مجموعات عالمية محددة، تولى مسؤولية التنسيق للمجموعة الفرعية للصحة الإنجابية ضمن مجموعة الصحة؛ والتنسيق للمجموعة الفرعية للعنف الجنسي والقائم على نوع الجنس ضمن مجموعة الحماية؛ وبشأن المسائل الجنسانية ضمن مجموعة الإنعاش المبكر.