ومع أخذ دور اللجان الإقليمية أيضا في الحسبان، كما وردت في قرار المجلس الاقتصادي والاجتماعي 1998/46، والأهداف والالتزامات الواردة في إعلان الأمم المتحدة بشأن الألفية (قرار الجمعية العامة 60/1)، وخطة التنفيذ للمؤتمر العالمي للتنمية المستدامة، وتتمثل الأهداف الرئيسية لبرنامج عمل اللجنة للفترة 2008-2009 فيما يلي: (أ) تشجيع التكامل الاقتصادي لبلدان اللجنة على مستوى البلدان الأوروبية، ومراعاة توسيع الاتحاد الأوروبي ومختلف مبادرات التكامل الجارية في الجزء الشرقي من منطقة اللجنة؛ (ب) تعزيز التنمية المستدامة وتشجيع الازدهار الاقتصادي في بلدان المنطقة ولا سيما تهيئة الظروف المواتية للنمو المستمر والتجارة وتحسين البيئة؛ (ج) الإسهام في البعدين الاقتصادي والبيئي للأمن في أوروبا.