وتتم معالجة التنبيهات الصادرة من نظام التنبيه الخاص بأمن السفن بالاستناد إلى الإجراءات نفسها التي تطبّق في حالة نداءات الاستغاثة، باستثناء أن رسالة التنبيه الخاص بأمن السفن الناتجة تُرسَل إلى المسؤولين الأمنيين لا إلى دوائر خدمات البحث والإنقاذ.