أما بالنسبة للموارد المالية للهيئة السورية لشؤون الأسرة، فهي تعتمد بشكل رئيسي على الموارد المالية الحكومية ولها مخصصات من الميزانية العامة للدولة، كأي وزارة كما أن الحكومة السورية تشجع وتتبنى المشاريع الوطنية وتوافق على دعم منظمات الأمم المتحدة مثل اليونيسيف، صندوق الأمم المتحدة للسكان، اليونيفيم وبرنامج الأمم المتحدة الإنمائي وقد نفّذت الهيئة عدداً من المشاريع الممولة من قبل هذه المنظمات.