وسيزداد التعاون مع الهيئتين اللتين تشتركان في رعاية المركز وهما مؤتمر الأمم المتحدة للتجارة والتنمية (الأونكتاد) ومنظمة التجارة العالمية، بوسائل منها بدء مرحلة جديدة من المساعدة في بناء قدرات أفريقيا على إجراء مفاوضات تجارية تشترك فيها الوكالات الثلاث في إطار متابعة البرنامج المتكامل المشترك للمساعدة التقنية.