وتشمل هذه المؤسسات: مؤتمر الأطراف، الذي تستطيع فيه الدول المشاركة مراقبة تنفيذ الاتفاق، واستعراض وتقييم مدى فعاليته، وتبني سياسات وتدابير إضافية الغرض منها تعزيز السعي من أجل تحقيق أهدافه؛ وأمانة تتولى إدارة المعاهدة، بما في ذلك القيام بالمهام المتصلة بالترتيب للاجتماعات، وتسهيل الاتصالات بين الأطراف والمراقبين، وتجميع التقارير؛ وجهاز مساعد أو أكثر، مثل جهاز علمي يقوم بإجراء بحوث بشأن المسائل العلمية ذات الصلة؛ وإجراءات للامتثال وآليات لرصد وتسهيل الامتثال من جانب جميع الأطراف؛ وآلية مالية لمساعدة البلدان النامية في تنفيذ التزاماتها.