ويتألف العنصر الثاني من أربع وحدات مسؤولة أمام نائب الممثل الخاص للأمين العام، وهي: وحدة بناء المؤسسات والحكـم الرشيـد ووحدة المنسق المقيم ومنسق الشؤون الإنسانية ووحدة الشؤون الجنسانية (المنقولة من مكتب الممثل الخاص للأمين العام) ووحدة مكافحة المخدرات (ويرد موجز لمهام الوحدات في الفقرات 42 إلى 53 في وثيقة الميزانية).