وعلاوة على برنامج مكافحة فيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز والملاريا والسل على صعيد القارة الأفريقية، من المؤسسات الأخرى القائمة بالإشراف على تنفيذ برنامج مكافحة فيروس نقص المناعة البشرية/ الإيدز المؤسسات الموجودة على الصعيد الإقليمي وصعيد الولايات، والمجالس الإدارية بالمجتمعات المحلية والقرى.