وكعلامة على التزام بيرو بضرورة تحسين كفاءة وفعالية النظام الدولي المتعلق بمعاهدة عدم انتشار الأسلحة النووية، وقعت بيرو في عام 1999 على البروتوكول الإضافي لاتفاق الضمانات التابع للوكالة، وذلك إسهاما في الأهداف المتعلقة بمنع انتشار الأسلحة النووية.