فمنذ عام 1999، ظل المتعاطون للمخدرات بالحقن وأصحاب السلوك الجنسي المنطوي على مخاطر يشكلون السبب الرئيسي لتفشي وباء فيروس نقص المناعة البشرية/متلازمة نقص المناعة المكتسب (الإيدز) في إندونيسيا، لا سيما في جاكارتا، وغرب جافا، وبالي.