() على حين أن استخدام الترميز هو أحد السمات الرئيسية للتوقيعات الرقمية، فإن كون التوقيع الرقمي لا يستخدم سوى لتوثيق رسالة تحتوي على معلومات مقدّمة في صيغة رقمية ينبغي ألا يُخلط بينه وبين الاستخدام الأعم للترميز لأغراض الحفاظ على السرية، الذي هو طريقة تستخدم لترميز الرسالة الإلكترونية بحيث لا يتمكن من قراءتها أحد غير منشئ الرسالة والمرسل إليه.