وفي بعض الحالات قامت اللجنة العسكرية المشتركة لوقف إطلاق النار بإجراءات فيما يتعلق بمزاعم تجنيد الأطفال في جنوب السودان، كما حدث في شهر تموز/يوليه 2006 عندما تلقت مزاعم بأن جيش التحرير الشعبي السوداني جنّد أطفالا من المناطق المحيطة بالغضارف وهو يزحف باتجاه جنوب السودان.