وبالإضافة إلى مبادرة العلوم للألفية، يشارك في البرنامج كل من أكاديمية العالم الثالث للعلوم (اليونيسكو)، وأكاديمية العلوم الأفريقية، واللجنة الاقتصادية لأفريقيا؛ بالتعاون مع معهد التعليم الدولي الذي يعمل بصفة استشارية.