فقد تأخر إلى حد كبير تنفيذ اتفاق وقف إطلاق النار الشامل الذي وقعته حكومة بوروندي وحزب تحرير شعب الهوتو - قوات التحرير الوطنية) بقيادة رواسا) في أيلول/سبتمبر 2006، وعلقت جلسات الآلية المشتركة للتحقق والرصد في عدة مناسبات بسبب نشوب العديد من الخلافات بين حكومة بوروندي والجماعة المسلحة لقوات التحرير الوطنية.