أما على صعيد الاستجابات الإنسانية، فيعمل الصندوق مع العديد من الشركاء، من قبيل مفوضية الأمم المتحدة لشؤون اللاجئين، وإدارة عمليات حفظ السلام، واليونيسيف، والأفرقة العاملة التابعة لمجموعة الأمم المتحدة الإنمائية، وبرنامج الأمم المتحدة المشترك المعني بفيروس نقص المناعة البشرية/الإيدز، والاتحاد الدولي لجمعيات الصليب الأحمر والهلال الأحمر، والاتحاد الأوروبي، والمؤسسات الأكاديمية.