كما عمل المركز بشكل مكثف مع آليات الأمم المتحدة وضمنها بما في ذلك المشاركة في مناقشات مشروع البروتوكول الاختياري للعهد خلال الدورات التاسعة والخمسين (17 آذار/مارس - 25 نيسان/أبريل 2003) والستين (13 آذار/مارس - 23 نيسان/أبريل 2004) والحادية والستين (14 آذار/مارس - 22 نيسان/أبريل 2005) للجنة حقوق الإنسان الدورة الأولى لمجلس لحقوق الإنسان، 19-30 حزيران/يونيه 2006، في جنيف، سويسرا.