ونتيجة لذلك، فقد أُلغيت جميع الوظائف الفنية لهيكل البعثة في كسلا وبورتسودان وانسحبت جميع القوات في تشرين الأول/أكتوبر 2006، ولم يتبق هناك سوى قدرة الدعم اللوجستي في بورتسودان، ويسندها عدد قليل من الوظائف التي كان مركزها في السابق في كسلا للإشراف على الأمن وإدارة المرافق والنقل والخدمات الطبية والخدمات العامة والاتصالات وتكنولوجيا المعلومات.