وانطلاقا من النجاح المحقق في الشراكة ما بين المؤسسة ومنظومة الأمم المتحدة، يتعاون الصندوق مع أسرة الأمم المتحدة في وضع برامج ومشاريع ابتكارية دعما لجملة غايات منها إعلان الألفية والأهداف الإنمائية للألفية ونتائج مؤتمر القمة العالمي لعام 2005.