نظرا لأن إندونيسيا أرخبيل يقع بين ثلاث صفائح تكتونية عالمية، فإنها تتمتع بثراء في المعالم المغمورة من قبيل الارتفاعات المتطاولة، والوهدات, والأحواض، والبراكين في قاع البحار، والبحار والخلجان والأراضي الداخلة في البحر، وليس لغالبيتها أي أسماء؛ وحتى إذا وجدت لها أسماء فإنها لم توحد بعد.