والبرنامج الفرعي سينسق ويتعاون أيضا مع المنظمات الأخرى التابعة للأمم المتحدة، ولجنة الاتحاد الأفريقي، ومصرف التنمية الأفريقي، والمنظمات الحكومية الدولية الإقليمية، والجماعات الاقتصادية الإقليمية، ومؤسسات التعليم العالي والبحث، والقطاع الخاص، ومنظمات المجتمع المدني.