وقد وضع الصندوق استراتيجية لتعميم نوع الجنس في حالات الصراع وما بعد انتهاء الصراع، مع التركيز على الصحة الإنجابية وفيروس نقص المناعة البشرية/متلازمة نقص المناعة المكتسب والعنف القائم على نوع الجنس والاتجار بالبشر.