وللمنظمة الدولية للهجرة في كولومبيا حاليا ثلاثة برامج موجهة إلى الشعوب الأصلية: (أ) برنامج مساعدة المشردين والفئات الضعيفة؛ (ب) برنامج تعزيز السلام في كولومبيا؛ (ج) برنامج دعم الأطفال المحاربين سابقا.