غير أنها عانت من عدد من أوجه الضعف: فبسبب وضع مراكز التنسيق كان من الصعب على المسؤولين فيها حضور الاجتماعات التي تتخذ فيها القرارات؛ وتتغير في كثير من الأحيان مراكز التنسيق من إدارة إلى أخرى؛ كما أن إعادة تشكيل الحكومة يؤدي في كثير من الأحيان إلى توزيع مراكز التنسيق على نحو غير متساوٍ بين الإدارات.