إن المشاكل الأساسية التي تواجهها ترسانة مكافحة الوباء حاليا هي: إيجاد الموارد الطويلة الأجل لتمويل الخطط الوطنية المتواضعة ولكنها مع ذلك واقعية، وتأمين مقومات استمرار الخطط الوطنية من خلال الأخذ في الحسبان لتغطية نفقات علاج الخيار الثاني، والعناية باليتامى، والاستثمار في الهياكل الأساسية الوطنية وتوفير خدمات الوقاية في القطاعات الأخرى غير الصحية.