Es contratado para dirigir a los Monarcas Morelia en el Apertura 2014, sin embargo el plantel michoacano no ofrecía armas suficientes para competir de manera sólida y se reflejó en los resultados, x los que José Guadalupe Cruz ya no entrenaria el siguiente torneo a los Monarcas. 

 Puebla. 
 Al quedar libre, la directiva del Puebla lo lleva para que se haga cargo del primer equipo de La Franja, para el Clausura 2015, torneo en el que se definiría si los poblanos lograban eludir el descenso. 

 En el torneo de Copa MX logra llevar a los camoteros a la gran final, misma que disputaría contra el Guadalajara. El 20 de abril los camoteros vence 4-2 al Guadalajara para conseguir el título de la Copa MX.
Es contratado para dirigir a los Monarcas Morelia en el Apertura 2014, sin embargo el plantel michoacano no ofrecía armas suficientes para competir de manera sólida y se reflejó en los resultados, por los que José Guadalupe Cruz ya no entrenaria el siguiente torneo a los Monarcas. 

 Puebla. 
 Al quedar libre, la directiva del Puebla lo lleva para que se haga cargo del primer equipo de La Franja, para el Clausura 2015, torneo en el que se definiría si los poblanos lograban eludir el descenso. 

 En el torneo de Copa MX logra llevar a los camoteros a la gran final, misma que disputaría contra el Guadalajara. El 20 de abril los camoteros vence 4-2 al Guadalajara para conseguir el título de la Copa MX.
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