2008년 9월 28일에는 기사련이 바이에른 주의 선거에서 1966년 이래 처음으로 과반을 차지하지 못하였고
그들의 통치 수준은 전후 독일 사회에서 꽤 눈여겨 볼만한 것이었다. 1999년부터 CSU의 당수에 오른 에드문트 슈토이버는 2002년의 총리 선거에 출마하였으나 사민당(독일 사회민주당)의 게르하르트 슈뢰더에게 패배한다. 2003년에 기사련은 주 의회의 다수(총원 180석 중 60.7%에 해당하는 124석 획득)를 차지하며 다시 바이에른 주의 집권당이 된다. 2007년 1월 18일, 스토이버는 주지사직에서 사임하는 한편 그해 9월 30일에는 기사련의 당수직 역시 그만두게 된다. 기사련이 바이에른 주에서 강력한 영향력을 행사하고는 있으나, 기초자치단체의 상황은 주 상황보다는 더 다양하다. 바이에른 주의 큰 도시들인 뮌헨과 뉘른베르크의 경우에는 사민당(독일 사회민주당) 출신을 시장으로 선출하기도 하였다. 2008년 9월 28일에는 기사련이 바이에른 주의 선거에서 1966년 이래 처음으로 과반을 차지하지 못하였고, 이는 자민당(독일 자유민주당)과 연립정권을 세우게 되는 배경이 된다.
기사련은 왜 자민당과 연립정권을 세우게 됐어
바이에른 기독교사회연합