2009년
2008년 팀의 주장을 맡아 자신의 부활을 위해 노력하였으나, 연봉협상에서 비롯된 구단측과의 불화를 겪게 되어 시즌 초반 경기에 결장하게 된다. 공격 포인트 수당 대신 자신 명의로 축구발전기금으로 기부하는 형식으로 합의하여 그라운드에 복귀하였으나, 고질적인 무릎 부상의 수술 여부로 구단과 다시 마찰을 빚었고, 설상가상으로 구단측은 우선계약 대상자에서 고종수를 제외시키며 갈등이 심화되었다. 2009년 31세의 이른 나이로 은퇴한 후 2년 동안 지도자 연수를 받았고, 2011년 6월 수원 삼성 블루윙즈의 트레이너로 합류하였으며, 2013년 서정원 감독 체제 전환 후 최성용 코치와 함께 팀의 1군 코치가 되었다. 왼발을 잘 쓰고 자로 잰 듯한 정교한 볼 배급에 프리킥에도 능하며 미드필드 라인에 창조성을 불어넣을 수 있는 선수로 평가 받았고, 감각적인 패스와 슈팅, 예리한 크로스로 관중을 압도하며 ‘앙팡테리블(, 무서운 아이)’이라는 별명을 가지게 되었다. 그의 장기인 강하고 정확한 프리킥은 특히 아크 정면 오른쪽에서 성공률이 높았으며, 그 곳을 고종수 존이라 불렀다.
고종수는 언제 은퇴했어
고종수