1998년 10월, 월간조선 11월호에 최장집의 연구에 대한 기사가 실리면서
이에 대해 경제를 정치 논리로 본 것이라는 비난이 있다. 2008년 프레시안, 오마이뉴스 등은 조선일보가 리만 브라더스의 파산신청 2주 전에 리만 브라더스의 인수를 촉구하는 칼럼을 쓴 것을 비난하였다. 1998년 10월, 월간조선 11월호에 최장집의 연구에 대한 기사가 실리면서 이른바 '최장집 사상논쟁'이 시작되었다. 이후 조선일보에도 관련기사가 많이 실렸다. 다음은 최장집 사상논쟁과 관련한 조선일보 기사과 그에 대한 다른 언론의 기사 목록이다. 위 기사들에 대해, 교원 노조 설립의 정당성에 관해 논쟁하기 보다는 사상논쟁으로 몰아가고자 했으며, 교원노조의 설립을 막는 법률 자체가 사상의 자유와 결사의 자유를 침해함에도 형식적 법치주의만을 강조했다는 비난이 있다. 위 기사에 대해, 조합원 한명당 지원액수로 환산하면 한교조와 자유교조가 전교조보다 각각 41배, 20배나 더 많은 셈인데 이러한 중요 내용이 빠진 편향된 보도라는 지적이 있다.
최장집 사상논쟁이 시작된건 어디서 부터야
조선일보에 대한 비판