Daftar sungai di Malaysia
Berikut ini merupakan daftar sungai di Malaysia. Sungai disusun berdasarkan abjad di dalam negara bagian atau wilayah persekutuannya. Sungai sama mungkin dijumpai di lebih dari satu negara bagian karena banyak sungai melintasi batas negara bagian.

Negara bagian

Johor 

 Sungai Batu Pahat
 Sungai Endau
 Sungai Johor
 Sungai Kesang
 Sungai Mengkibol
 Sungai Mersing
 Sungai Muar

 Sungai Pelentong
 Sungai Pulai
 Sungai Sarang Buaya
 Sungai Segamat
 Sungai Segget
 Sungai Skudai
 Sungai Tebrau

Kedah 
 Sungai Kedah
 Sungai Merbok
 Sungai Muda
 Sungai Pedu
 Sungai Kilim
 Sungai Tajar
 Sungai Langgar
 Sungai Pendang

Kelantan 
 Sungai Kelantan

Melaka 
 Sungai Kesang
 Sungai Melaka

Negeri Sembilan 
 Sungai Gemencheh
 Sungai Linggi
 Sungai Muar
 Sungai Pelentong

Pahang 
 Sungai Kuantan
 Sungai Jelai
 Sungai Lipis
 Sungai Pahang
 Sungai Rompin
 Sungai Tembeling

Perak 
 Sungai Bernam
 Sungai Dinding
 Sungai Kerian
 Sungai Kinta

Perlis 
 Sungai Perlis

Pulau Pinang 
 Sungai Ara
 Sungai Air Itam
 Sungai Juru
 Sungai Nipah
 Sungai Perai
 Sungai Pinang

Sabah 
 Sungai Atling
 Sungai Kinabatangan
 Sungai Labuk
 Sungai Liwagu
 Sungai Mulau
 Sungai Padas
 Sungai Papar
 Sungai Pegalan
 Sungai Segama
 Sungai Sugut

Sarawak 

 Sungai Balleh
 Sungai Balui
 Sungai Bangkit
 Sungai Baram
 Sungai Bintangor
 Sungai Igan
 Sungai Katibas

 Sungai Kemena
 Sungai Maong
 Sungai Padungan
 Sungai Rajang
 Sungai Sarawak

Selangor 

 Sungai Ampang
 Sungai Bernam
 Sungai Damansara
 Sungai Gombak
 Sungai Kemensah

 Sungai Klang
 Sungai Langat
 Sungai Penchala
 Sungai Selangor

Terengganu 
 Sungai Kemaman
 Sungai Terengganu
 Sungai Setiu
 Sungai Bari
 Sungai Besut
 Sungai Chalok
 Sungai Nerus
 Sungai Merang
 Sungai Telemong
 Sungai Berang
 Sungai Neram
 Sungai Ibai
 Sungai Marang
 Sungai Tersat

Wilayah Persekutuan

Kuala Lumpur 
 Sungai Gombak
 Sungai Kerayong
 Sungai Klang
 Sungai Kuyoh

Pranala luar 
 http://forum.mygeoportal.gov.my/smanre/sungai/lembangan_sungai_utama_kategori_satu.php 
 http://forum.mygeoportal.gov.my/smanre/sungai/list_lembangan_sungai_kategori_lain.php?cat=2&tag=Sungai-Sungai%20Merentas%20Negeri 
 http://infobanjir.water.gov.my/real_time.cfm