1900年,クラークはピッツバーグ・パイレーツに選手と監督として入隊し,1915年に引退するまでその役割を担った.クラークはメジャーリーグのスラギング平均とOPSをリードし,ナショナルリーグのダブルスをリードしたことで,おそらくクラークのキャリアの最高の打撃シーズンだった. 彼はチームメイトのホナス・ワグナーに次いで ナショナルリーグのバッティングタイトルを獲得した. ワールドシリーズで
クラークは265の打撃をしましたが ボストンのサイ・ヤングとビル・ディネンは ピッツバーグを抜いて 8試合でシリーズを勝ちました