2020年2月3日,ラピッド・ウィーンのファンは,オーストリアのクラブでの優れたパフォーマンスのおかげで,ファウンタスを2019年の最高の選手に選出した. 2月16日,WSGスワロフスキーティロルとのホームで2対0で勝利した試合で,サノス・ペツソスがミスしたことで,シーズン12番目となった. 3月1日,ファウンタスはクリストフ・クナスミュルナーからのパスに変換し,SVマターズブルクとのホームで3対1で勝利した試合で2番目のゴールを記録した. 3月7日,彼は再びゴールを記録し,ネマンヤ・ルニッチの重大なミスから恩恵を受け,ヴォルフスベルガーACとの2対2の引き分けで,シーズン14番目のゴールを獲得した. 6月7日,COVID-19の流行によりリーグが中止された後,彼はSKストームグラッツに4対0で勝利した試合で再び得点しました. 3日後,彼はLASKリンツに対する1<unk>0の客勝で重要なゴールを記録した. 1週間後,彼は再びゴールし,TSVハートバーグに対して1<unk>0の勝利を収めた. 6月24日,彼はエルカン・カラのアシストの後,リーグチャンピオンであるレッドブル・サルツブルクに2対7でホームで敗れた. 7月1日,彼は5試合連続でゴールを記録し,LASKとのホームで3対1で勝利した. フォウンタスは2019年~20年のオーストリア・フットボール・ブンデスリーガの終了までラピッド・ウィーンで活躍した.
クラブが UEFA チャンピオンズリーグ予選で優勝するまでに19ゴールを記録した. さらに,ファウンタスは,オーストリアのブンデスリーガで3番目に高い得点としてシーズンを終了し,パットソン・ダカ (24ゴール,RBザルツブルク) とショーン・ワイスマン (30ゴール,ウルフスベルガー) に次ぐ.