マリア・イザベラの生活はナポレオンによる行動に深く影響された. 王冠を恐れていたフェルディナンド王は ボナパルトに対する第3連合に加わった. ナポレオンの軍隊はオースターリッツの戦いで連合軍を倒した
1805年12月,カンポ・テネゼでナポリ軍団と この勝利の後,ナポレオン軍は 1806年にナポリを占領した. ナポリの王冠は弟のジョセフ・ボナパルトに与えられ,4年後には義理の弟のヨアキム・ムラトに与えられた.