1985年10月,彼はYSP政治局と中央委員会の秘書に選出されたが,1986年1月13日にアデンでアリ・ナシールの支持者とイスマーイルの支持者の間の暴力的な闘争に危機が勃発した. (参照)
南イエメンの内戦) 戦闘は1ヶ月以上続いた.その結果,数千人の犠牲者が出た. アリ・ナシールの追放,そしてイスマーイルの神秘的な失踪. アリ・ナシールに忠実な海軍軍がアデンにある彼の家を砲撃した際に殺されたとされている.