1863年初頭,第6ミズーリ連隊はミシシッピ州グランド湾に移され, 砦の建設に役立った. 軍団は
4月29日のグランド湾の戦い 第1ミズーリ旅団の他の多くの兵士と共に,第6ミズーリ旅団は5月1日にミシシッピ州ポート・ギブソンに移転し,北軍の上陸に抵抗した. 5月1日に起こったポート・ギブソンの戦いで,6ミズーリ軍は南軍の右翼を支援するために使用された. 連合軍が南軍の撤退路線を遮断すると脅かしたとき,ミズーリ第6軍は反撃した. 攻撃は北軍のラインに深く入ったが,北軍の補強部隊に出くわしたため,遠距離撤退を余儀なくされた. 第6ミズーリ軍は南軍の残りの部隊から孤立し,弾薬が尽き始め,撤退した南軍の主要部隊に合流するために戦闘撤退を余儀なくされた.