この師団はアメリカ軍に対して戦った.
モロタイの戦いは1944年9月から戦争の終わりまで続いた. 1944年5月,ハルマヘラからわずか離れたモロタイに飛行場を開発するために211歩兵連隊の2個大隊が派遣されたが,排水問題のために飛行場が放棄された1944年7月に撤退した. 連合軍が1944年9月15日にモロタイに着陸した際,モロタイは軽く防衛され,連合軍は島の南西部の目標を迅速に確保することができた. 第210歩兵連隊の第3大隊と第211歩兵連隊の全部隊を含む第32師団の部隊は,1944年9月から11月の間に,島で開発中の連合軍基地を攻撃しようと,アメリカ海軍封鎖を通ってモロタイに輸送された. しかし,アメリカ軍の封鎖によって十分な物資が運ばれなかったため,この師団は攻撃を開始することができなかった. その結果,モロタイの日本軍は 島の中心部に撤退し,そこで多くの者が病気や飢餓で死んだ.