1945年8月30日の8時20分, "I-400"は"I-14"と"プロテウス"と共に,東京湾に向かい,同じ日の14時58分に<unk>をつけました. 1945年8月31日5時00分にアメリカ合衆国の旗が掲げられ,14時45分に"I-400","I-14",および"プロテウス"がヨコスカの潜水艦基地の防水堤内の新しい停泊所へ移動し,16時50分には"プロテウス"が停泊した. 日本降伏式でアメリカ海軍潜水艦隊を代表するために選ばれた12隻のアメリカ海軍潜水艦
東京湾の船もそこに停泊し,I-401も8月31日に到着した. 1945年9月2日の降伏式では,米国太平洋艦隊 (COMSUBPAC) の潜水艦部隊司令官,チャールズ・A・ロックウッド副提督が,個人旗を"I-400"と"I-401"に掲げることを命じた.