1903年に少佐に昇進し,日俄戦争中にIJA第21歩兵連隊を指揮するために戻った. 戦時中,彼はIJA第13師団の参謀部に移された. この部門は独立して
ポートスマス条約の締結前にサハリン島を占領し,1905年7月7日にサハリン島に上陸し,形成からわずか3ヶ月後に1905年8月1日までに島を確保した. この作戦が成功した結果,日本はポルツマス条約で南のカラフトを授与され,戦争中に日本が得た僅かな領土の1つとなった. 戦後,シラカワは1905年10月から陸軍省の人事局に配属された. 1907年に中佐に昇進し,1909年に大佐となり,IJA第34歩兵連隊の指揮官となった.