1985年10月,彼はYSP政治局に選出され,中央委員会の秘書に任命されましたが,1986年1月13日,アデンのアリ・ナシール支持者とイスマーイルの支持者の間の暴力的な闘争に危機が勃発しました. 南イエメン内戦
) 戦闘は1ヶ月以上続いた. 結果は数千人の犠牲者, アリ・ナシールの追放,そしてイスマーイルの神秘的な失踪でした. アリ・ナシールに忠実な海軍軍がアデンにある彼の家を砲撃した際に殺されたとされている.