1861年にアメリカ内戦が勃発すると フェスラーは北軍の味方になった. 1861年8月30日,インディアナ州モルガンタウンで北軍に入隊した. フェスラーは第27インディアナ歩兵連隊のG隊の隊長に任命された. フェスラーは第1ウィンチェスターの戦いで彼の部隊を指揮した.
そしてセダール山の戦いで 1862年,フェスラーの連隊は第12陸軍団に割り当てられ,その中に1863年を通して留まっていた. その後,フェスラーは1862年9月17日にメリーランド州シャープスバーグの近くにあるアンティエタムの戦いで隊を指揮した. 彼の連隊は1862年から1863年の冬をバージニア州スタッフォード裁判所で過ごし,1863年2月13日,フェスラーは第27インディアナ連隊の中佐に昇進した. 1863年3月,第27インディアナが所属していた第12軍団は,軍団のバッジとして星を発行した. 1863年5月5日,フェスラーはバージニア州スポッツシルバニア郡のチャンチェラーズビル戦で負傷した. その後,ゲティスバーグの戦いで1863年7月2日から3日にかけて第27インディアナを一時的に指揮し,連隊の大佐が旅団の司令官に任命された. フェスラーとその連隊は,その月後にニューヨーク市でのドラフト暴動を鎮圧することに参加した.