2006年9月17日,スゴルバティは12時30分過ぎに児童病院の外で銃殺されました. 彼女は授業を終えて,姉妹の宿泊所に行くために道路を渡り,他の3人の修道女が彼女とランチを待っていた. 警備員と運転手 モハメド・オスマン・マハムド (4人の子供の父親) も殺された. この攻撃は,教皇ベネディクト16世がレゲンズブルクでの講演で述べた論争の的発言に対する反応だと考えられていた.
これは確認も根拠もなかった. 彼女の死は9月15日の発言の直後に起こりました イスラム教の過激派聖職者シェイク・アブバカー・ハッサン・マリンは 預言者ムハンマドを侮辱した者を皆殺しにするよう モスクの礼拝者に命じたのです 数人の人道支援活動家やキリスト教のボランティアが この時期に殺された. 銃を持った2人の男が タクシーやキオスクから飛び出し 最初の弾が彼女の太もとに当たって 後ろから3回か4回撃った 護衛は彼女を護衛し,攻撃者に発砲した後に撃たれた. 一発は背中に入り 動脈を切断し 急激な出血を引き起こしました スゴルバティは緊急にSOS病院に運ばれましたが,後に手術台で亡くなりました. 彼女の最後の言葉は"私は許す,私は許す,私は許す"でした 彼女はシスター・マルジア・フェーラに囁いたのです 午後3時に飛行機が彼女の遺体をナイロビに運び,午後9時に到着した.彼女の遺体はリー葬儀施設に運ばれた.