ウェバーは 1861 年 5 月 16 日にアメリカ内戦に参戦するために入隊した. 彼は"ターナー・ライフルズ"として知られるドイツ系アメリカ人部隊を設立し 後に第20ニューヨーク歩兵隊の一部となった. ウェバーはバージニアのモンロー砦に 駐留していた 彼はハッターラス砦の占領に参加した.
やってみよう 1861年9月から1862年5月まで,彼はモンロー砦の近くのキャンプ・ハミルトンを指揮し,1862年4月28日に志願兵の准将に任命された. 彼は南軍の陸上攻撃を予想して "モニター"と"バージニア"の間の戦いでニューポート・ニューズにいた. 彼は5月にバージニア州ノーフォークの占領に参加し,9月までサフォークで指揮を執り,ポトマック陸軍に指名され,ポトマック陸軍第3旅団第3師団第2軍団を指揮した.