2015年5月,オーストラリア政府はモリアーティを首相と閣僚の部門内の連邦対テロ調整部に任命したと発表した. この役割において,モリアーティは特定の機関の運営を指揮する権限を有せず,代わりにオーストラリアの諜報機関と治安機関間の協力を強化する権限を"各機関にわたって"授与された. 彼の役割は主に国内テロの脅威を防ぐことに焦点を当てていた. 役を始める直後,モリアーティはメディアに対し,問題の深さと範囲に"驚愕"したと語った. ニースでのテロ攻撃の後に
,モリアーティは,テロ対策目的で治安機関が調査しているすべての関心のある人を調査し,精神的健康上の懸念や犯罪行動のパターンを有する脆弱な人を特定し,そのような人々の過激化を防ぐために必要な措置を検討する権限を与えられました.