1990, im letzten vollständigen Lebensjahr der Sowjetunion, wurde Kowaljow in den Rat der Volksbeauftragten gewählt und (mit Unterstützung Boris Jelzins) zum Vorsitzenden der Menschenrechtskommission dieses Rats ernannt.
In 1990, the Soviet Union’s last full year, Kovalev was elected to the Congress of People’s Deputies and chosen (with support from Boris Yeltsin) as the chair of its Human Rights Committee.