Naruto Shippūden: Gekitō Ninja Taisen! EX 3
Игра включает в себя три режима игры, которые являются новыми в серии. Трансформация Наруто теперь имеет три хвоста. Еще одной новой особенностью является Senzai Ninriki (переведенный в Clash of Ninja Revolution 3 как Latent Ninja Powers), где каждый персонаж светится определенным цветом, когда попадает в режим низкого здоровья/кризиса. Подобно получению новых специальных предложений в кризисном режиме с первой игры Revolution и заранее Naruto: Gekitō Ninja Taisen! 3, Senzai Ninriki - это специальный кризисный режим, который обеспечивает определенные эффекты в зависимости от персонажа, например, отсталые сильные атаки Наруто и Темари больше не используют чакру, Хината может отменить свои атаки без затрат на чакры, Какаси наносит урон через охрану со всеми своими атаками, Неджи и Большинство эффектов персонажей Senzai Ninriki меняются в Naruto Shippūden: Clash of Ninja Revolution 3.

Одним из новых режимов игры является "Hurricane Clash Mode", который также переработан в новый сюжетный режим, который является оригинальным из основной сюжетной линии. В этом режиме игрок управляет своим персонажем в полной 3D-перспективе движения и может сразиться с полчищами ниндзя в жанре beat em' up, при этом многие наборы движений персонажей ретвиты исключительно для этого режима. Этот стиль с тех пор не появлялся ни в каких более поздних играх Gekitō Ninja Taisen/Clash of Ninja.

Кроме того, теперь игроки могут переключать сценические опасности, препятствия и переходы на сцену. Самое последнее позволяет играть на любом уровне сцены, но ценой отсутствия прыжков на этапе в качестве очевидного компромисса.

Подтвержденные символы

Наруто Узумаки (можно войти в треххвую форму) (форма PTS не имеет Senzai Ninriki)

Саске Учиха (может активировать Sharingan) (форма PTS не имеет Senzai Ninriki)

Какаши Хатаке (можно активировать Sharingan)

Сасори (также можно играть в Хируко)

**Мелочи**

Хидан, наряду с Тёдзи и Дзиробо, являются единственными персонажами, которые не переполняют свои заднюю панель.

Хидан также двойно овладеет как своей косой, так и складным копьем в этой серии; чего-то не видно в других средствах массовой информации.

Хидан также не использует ручные печати, так как вместо этого он проповедует/молится за свои "ручные печати".