Minecraft: Story Mode/EP2
Если игрок решает отправиться за Магнусом, то Джесси, Аксель, и Рубен идут на отчаянный шаг с целью избавиться от этой напасти путём взрывов и разрушений. Все трое, они возвращаются обратно в Нижний Мир, и прибывают к порталу, который ведёт в "Бумбург" - пристанище гриферов. Куда ни пойди, везде безумные авантюристы, пытающиеся взорвать или застрелить любого встретившегося на пути. Но их азарт увеличивается прямо на глазах, когда они видят завидную "блестяшку" (Амулет) у Джесси в руках, и пытаются её забрать. Еле-еле сбежав от натиска гриферов, друзья добираются до огромной обсидиановой крепости Магнуса, где застают его самого. Но будучи бывалым разбойником, Магнус неохотно доверяет главным героям. К счастью, Джесси удаётся разубедить его в придуманной опасности, и член Ордена Камня придумал особые условия: он пойдёт с ребятами лишь в случае того, если Джесси победит его в Кубке Смерти. Но Магнус плохо знает его/её, именно поэтому ему/ей получается "выиграть" в смертельно опасной битве, но эмоции прерывает всеизвестная Иссушающая Буря, которая добивает полуразрушенный город, и не оставляет ничего. К счастью, четверка в последний момент проходит через портал в знакомый Нижний Мир, и направляется к Храму.

Если же игрок решит отправиться на поиски Элльгорд, Джесси, Оливия, и Рубен вернутся в Нижний Мир и прибудут к порталу, который отправит их в "Краснокамье" - всемирно знаменитую столицу краснокаменной инженерии, где и проживает легендарная мастерица. После моря впечатлений, нахлынувших на Джесси, Оливию, и даже Рубена, после выхода из портала, они приходят на главную площадь города, где Элльгорд выступает перед жителями, чтобы объявить о том, что обладатель лучшей постройки с использованием красного камня, станет её личным протеже, после чего она уходит под "Купол Концентрации", чтобы изобрести командный блок вновь. Но ассистент под именем Кельвин ради безопасности, убирает повторитель из-под схемы, и лестница перестаёт работать. Теперь же, у Джесси снова появляется выбор: или же собрать повторитель самому из найденных подручных средств на верстаке, или же украсть повторитель у одного из претендентов на роль протеже для Элльгорд. В итоге, все они встречаются под Куполом Концентрации. Элльгорд удивляется тому, что это не Кельвин послал их сюда, но Джесси поясняет ей всё произошедшее, после чего предлагает помочь ей в создании командного блока. Казалось бы, с третьего раза всё получится, но Иссушающая Буря прерывает старания, и Элльгорд, Джесси, Оливии, и Рубену, приходится спасаться. Они сбегают из Купола, и направляются к порталу в Нижний мир, который отведёт их к Храму.

Они возвращаются в храм, где они встречают вернувшегося друга (Габриэля или Петру в зависимости от того, кого игрок спас в первом эпизоде). Они узнают, что тот кто остался в храме с Лукасом, привёл другого члена Ордена. Между Эльгард и Магнусом возникает ссора из-за разных интересов и взглядов на то, как всё надо делать. Они упоминают о Гипер-бомбе, самом мощном оружии на свете, которое изобрёл Сорен-последний, давно потерянный член Ордена Камня. Возвращаясь к машине, Джесси обнаруживает, что теперь показывается местоположение Сорена, а также Айвора, который теперь направляется к Сорену. Прибыв на место, Магнус и Эльгард распались после ссоры и Джесси следует из ними. После этого, Петра/Габриэль рассказывает Джесси, что после того, как Джесси спас(ла) его/её, он(а) заразился/заразилась иссушающей хворью, из-за которой он(а) через некоторое время будет иссушен(а). Вскоре они вдвоём находят чародейную комнату, но натыкаются на Айвора. Между ними происходит бой. Когда Айвор был почти побеждён, на подмогу прибежала вся группа Джесси, кроме Магнуса и Эльгард, но Айвор опрыскивает всех зельем медлительности и улавливает их в библиотеке.

В результате, все вместе прибывают к заветному Храму, и их встречает Габриэль или Петра (в зависимости от того, кого игрок спасёт в первом эпизоде). Теперь же, остаётся лишь один план, который нужно реализовать - найти последнего члена Ордена - Сорена-архитектора. Но факт того, что Сорен пропал много лет назад, не остаётся вне внимания. Внезапно, помимо белой метки Сорена, появляется и синяя - всем становится понятно, это Айвор! И он направляется прямо к местонахождению первого. Отныне главной задачей становится остановить Айвора до того, как он дойдет до храма в горах. Добравшись до храма, у Джесси в который раз появляется выбор - следовать за Магнусом, или следовать за Элльгорд. Когда Джесси останется с Габриэлем/Петрой наедине, второй расскажет о том, что он получил иссушающую хворь, когда боролся с ней в комнате из обсидиана. Их волнение перерастает на мгновение перерастает в небольшой испуг, когда позади взрывается крипер, и образует дыру в коридор снизу. Друзья находят библиотеку, в которой копошится Айвор, в итоге чего будет битва на мечах. Но когда к битве присоединяются и другие члены команды (кроме Элльгорд и Магнуса), становится слишком поздно - Айвор бросает в сплотившуюся кучку приятелей зелье медлительности, и с угрозами запирает всех в одном из помещений библиотеки.