Ekologické problémy pramení z velké části ze skutečnosti, že brakická voda a produktivní pobřežní mokřady a přírodní oblasti jsou často zásobovány zpětně zavlažovanou vodou bohatou na živiny, někdy z chovu rýže. Delta Ebro a její mokřady trpí podobnými problémy s kvalitou vody, protože leží na okraji velké oblasti farmy Delta.
Delta Ebro bude získávat vodu z rýžových farem.