Im Rahmen der Säkularisation im Joar 1802 worn des Franziskanerkloster in Weilheim afghom. De vuin umliegenden bedeutenden Klöster und Stifte, wegen denen noch heute de Region ois owaboarischa Pfaffawinkl tituliert werd, wurdn enteignet und aufgelöst. Bei einer schweren Brandkatastrophe in der Oberen Stadt am 3.xa0Mai 1810 verbrannten nach einem Blitzeinschlag 120 Häuser und zwoa Personen kamen ums Lebn. Den Brandgeschädigten worn vom Königreich das Abbruchmaterial des romanischen Wessobrunner Minschdas zum Wiederaufbau ihrer Häuser überlassen. Des ehemalige Franziskanerkloster brannte 1825 ab, daraufhin worn 1826 dort ein gmoasames Gebäude für das Heilig-Geist-Spital und a Krankenhaus an der heutigen Mingara Straße gebaut. Das alte Spitalgebäude worn dagegen obgebrocha, daduach entstand da heutige Kirplotz. Am 1.xa0Oktober 1869 erschien die erste Tageszeitung vor Ort, des „Weilheimer Tagblatt“. Zwischn 1872 und 1874 wurdn de dreia Stadttore abgebrochen, zunächst 1872 das Obere Tor, 1873 des Schmied-Tor und zuletzt 1874 des Pöltner-Tor. Duach oans Luftangriff in Zwoata Wödkriag am 19.xa0April 1945 wurdn 24 Personen getötet und der Bahnhof zerstört.