Lele kada pernah ditemukan di air payau atau air asin, kecuali lele laut nang tergolong ka dalam marga dan suku nang berbeda (Ariidae). Habitatnya di sungai lawan arus air nang perlahan, rawa, telaga, waduk, sawah nang tergenang air. Bahkan ikan lele bisa hidup pada air nang tercemar, misalkan di got-got dan selokan pembuangan.