Tahun 1187, Saladin merabut Baitul Lahmi matan tangan Tentara Salib, wan para rohaniwan Latin dipaksa bejauh. Saladin menyetujui bulinya dua imam wan dua diaken Latin pada 1192. Tahun 1250, lawan berkuasanya Rukn al-Din Baibars, tenggang rasa gasan kekeresténan menurun, buhan pendéta meninggalakan kota, wan tahun 1263 tawing-tawing kota dihancurakan. Buhan agamawan Latin bulik ke kota itu selawas abad limbah nitu, membentuk biara nang behigaan lawan Basilika, wan tahun 1347 Ordo Fransiskan mendapatakan hak milik gasan Gua Kelahiran wan hak gasan menyelenggaraakan wan meharagu Basilika nitu.