Quelle est la fonction de la chymotrypsine?
Chymotrypsine
La chymotrypsine intervient dans la protéolyse des protéines du système digestif des mammifères et autres êtres vivants. Elle catalyse le clivage des chaînes polypeptidiques par hydrolyse, mécanisme au départ extrêmement lent sans un activateur. Chymotrypsine
La chymotrypsine est une peptidase digestive sécrétée par le pancréas, de la famille des protéases à sérine, qui catalyse des protéolyses. Elle est codée par deux gènes situés sur le chromosome 16, dont le produit est une proenzyme appelée chymotrypsinogène, qui doit être activé ultérieurement pour donner la chymotrypsine elle-même. Cette enzyme hydrolyse préférentiellement les protéines au niveau des liaisons peptidiques en aval d'un résidu de tyrosine, de tryptophane, de phénylalanine, de méthionine ou de leucine. Le site actif de la chymotrypsine comporte une poche hydrophobe dans laquelle se loge l'acide aminé du substrat. Ceci permet le positionnement de la liaison à cliver en regard de la sérine catalytique. Chymotrypsinogène
La chymotrypsine est une peptidase puissante qui ne doit être activée qu'au dernier moment afin d'empêcher qu'elle n'endommage le pancréas ni aucun autre organe. Le mécanisme par lequel cette activation est réalisée est bien compris depuis le milieu du siècle dernier .
Caséine kappa
La chymosine () est une protéase aspartique qui hydrolyse spécifiquement la liaison peptidique Phe–Met de la et est considérée comme la plus efficace des protéases de l'industrie fromagère. Il existe également d'autres protéases qui clivent d'autres liaisons peptidiques de cette protéine, comme l'endothiapepsine produite par "Endothia parasitica" . Il existe également plusieurs protéases capables de cliver à la fois les liaisons Phe–Met de la et d'autres liaisons peptidiques de cette protéine, telles que celles produites par "Cynara cardunculus" Drépanocytose
L'hémoglobine est la protéine des globules rouges assurant le transport de l'oxygène dans le sang. Il s'agit d'un hétérotétramère constitué de deux paires identiques de deux sous-unités de types différents. L'une de ces sous-unités est dite α (alpha) et est codée par un gène situé sur le  tandis que l'autre sous-unité est codée par un gène du  et est soit de type β (bêta), γ (gamma) ou δ (delta), donnant respectivement l' de formule et notée HbA, l' de formule et notée HbF, et l' de formule et notée HbA. L' est de loin la plus abondante des trois, constituant environ 95 % de l'hémoglobine totale d'un adulte sain. MTOR
mTOR (de l'anglais mechanistic target of rapamycin - auparavant "mammalian target of rapamycin"), en français cible de la rapamycine chez les mammifères) est une enzyme de la famille des sérine/thréonine kinases qui régule la prolifération cellulaire, la croissance cellulaire, la mobilité cellulaire, la survie cellulaire, la biosynthèse des protéines et la transcription. Érythropoïétine
Elle est utilisée en cas d'anémie chronique due à une insuffisance de sécrétion d'érythropoïetine, essentiellement lors d'une insuffisance rénale chronique mais aussi dans d'autres cas (lors de certains cancers par exemple, même si une étude tend à démontrer un risque de mortalité accru dans le cas de cancers de la sphère ORL traités par radiothérapie, et plusieurs autres études un rôle néfaste lorsque l'EPO est associée avec une chimiothérapie). Elle est utilisée lors de certaines chimiothérapies aplasiantes (c'est-à-dire qui détruisent les cellules souches de la moelle osseuse) car cette hormone a un effet protecteur vis-à-vis des cellules souches érythrocytaires. Enzyme
Les enzymes remplissent un grand nombre de fonctions au sein des êtres vivants. Elles sont indispensables aux mécanismes de transduction de signal et de régulation des processus cellulaires, souvent à travers l'activité de kinases et de phosphatases . Elles interviennent également dans la génération de mouvements, comme la myosine qui hydrolyse l'ATP lors de la contraction musculaire et permet le transport de molécules à travers la cellule en agissant sur le cytosquelette . Les pompes à ions des membranes cellulaires sont d'autres ATPases qui interviennent dans le transport actif transmembranaire. Des enzymes interviennent également dans des processus plus exotiques tels que la bioluminescence produite par exemple par la luciférase chez les lucioles, ou encore par certaines bactéries. Les virus contiennent quant à eux des enzymes leur permettant d'infecter des cellules, comme l'intégrase et la transcriptase inverse du VIH, ou de sortir des cellules infectées comme la neuraminidase du virus de la grippe . Lymphe
Elle a un rôle nutritif, elle apporte au sang circulant les graisses absorbées au niveau des chylifères de l'intestin grêle, sous forme de chylomicron. 5-Énolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase
Cette enzyme est présente chez les bactéries, les mycètes, les protistes et les plantes, où elle intervient à la sixième étape de la voie du shikimate réalisant la biosynthèse de trois acides aminés aromatiques : la phénylalanine, la tyrosine et le tryptophane. Dans la mesure où cette voie métabolique est absente chez les animaux, les enzymes qui la constituent sont des cibles privilégiées pour le développement d'antibiotiques, de parasiticides et d'herbicides non toxiques pour l'homme ; l'EPSP synthase est ainsi la cible du glyphosate, principe actif du "Roundup", herbicide distribué par la société Monsanto. Maladie périodique
La physiopathologie de la fièvre méditerranéenne familiale a connu récemment des avancées importantes: la pyrine est un récepteur de l'inflammasome. A l'état basal, elle est maintenue inactive par une protéine chaperonne (de la famille des protéines 14.3.3) liée à la pyrine au niveau de résidus sérines phosphorylés. La déphosphoration de ces sérines est un préalable indispensable à l'activation de l'inflammasome pyrine. Une inactivation des RhoA GTPase (par des toxines bactériennes par exemple) entraine l'inactivation des kinases PKN1/PKN2 et la déphosphoration de la pyrine. Chez les sujets sains, l'étape de déphosphoration seule n'entraine pas l'activation de l'inflammasome pyrine. En revanche, chez les patients atteints de FMF, la déphosphorylation seule des sérines est suffisante pour déclencher l'activation de l'inflammasome pyrine. Ceci suggère qu'il existe une régulation à deux niveaux et que le second mécanisme de régulation (indépendant de la (dé)phosphorylation) est déficient chez les patients FMF. Ce mécanisme défaillant se situe vraisemblablement au niveau du domaine B30.2 (exon 10) où est située la plupart des mutations pathogènes associées à la FMF. C'est vraisemblablement l'interaction de ce domaine avec le cytosquelette (microtubules) qui est défaillante, comme le suggère l'efficacité de la colchicine. Chronotoxicologie
Le rein est essentiel pour la filtration du sang, en plus d’éliminer les déchets et toxines issus de transformations métaboliques. Étant donné que presque toute substance aboutit aux reins, une vaste gamme d’entre elles est susceptible d’engendrer une néphrotoxicité. La toxicité rénale peut être évaluée par diverses fonctions connexes, comme la diurèse, la clairance de l’urée ou de la créatine et par la variation de certaines enzymes. Les aminosides sont des antibiotiques reconnus pour leur néphrotoxicité. Par exemple, l’amikacine est connue pour son effet néphrotoxique circadien dans l’excrétion de NAG urinaire, en plus d’engendrer une variation circanuelle dans cette même fonction. Lymphotoxine alpha
, situé sur le chromosome 6. Elle agit contre la prolifération cellulaire et induit la destruction des cellules tumorales. Sa nature cytotoxique lui confère un ensemble de rôles importants dans la régulation du système immunitaire selon la forme sous laquelle elle est sécrétée. Contrairement aux autres facteurs de nécrose tumorale, la lymphotoxine α n'existe que sous forme d'homotrimère soluble, et n'est présente à la surface de la cellule que sous forme d'hétérotrimère avec la lymphotoxine β . Amyline
L'amyline, ou IAPP (islet amyloid polypeptide), est une hormone peptidique de 37 acides aminés. Elle est co-sécrétée avec l' insuline par les cellules β pancréatiques dans un rapport d'environ 100 insuline pour une amyline). L'amyline joue un rôle dans la régulation glycémique en ralentissant la vidange gastrique et en favorisant la satiété, empêchant ainsi les pics postprandiaux de la glycémie. Cytoglobine
En conditions d'hypoxie, la synthèse de cytoglobine est doublée, plus encore dans le cœur que dans le foie. Ce mécanisme peut s'expliquer par le fait que la cytoglobine sert à stocker et à faciliter le transport de l'oxygène vers la chaîne respiratoire dans les mitochondries.  La présence de cytoglobine dans les neurones soulève de nombreuses questions sur les fonctions qu'elle pourrait jouer au niveau du système nerveux central. En effet, ce tissu possède déjà une globine spécifique, la neuroglobine. Les auteurs envisagent son rôle potentiel comme donneur d'O pour certaines réactions enzymatiques - entre autres, la synthèse du NO à partir de l'arginine par les NO synthases. Cylindrospermopsine
Les cylindrospermopsines inhibent la synthèse protéique en se liant de façon irréversible avec les ARN de transfert. Elles affectent donc tous les tissus, mais plus particulièrement les hépatocytes. Alpha-1-antitrypsine
L'alpha-1-antitrypsine ou α-antitrypsine (A1AT) est un inhibiteur de la sérine protéase (serpine). Elle protège les tissus contre des enzymes produites par des cellules inflammatoires, particulièrement l'élastase. On la trouve dans le sang humain à des taux de . Sa carence est une cause d'emphysème et de cirrhose. Ciprofloxacine
La ciprofloxacine est bactéricide. Elle neutralise les enzymes bactériennes de réplication empêchant toute multiplication cellulaire. Elle agit sur les topoisomérases de type (ADN gyrase) et de type . Trypsine
La trypsine appartient à la famille des protéases à sérine dont elle est l'archétype. Ces enzymes sont caractérisées par la présence d'une triade catalytique composée des chaînes latérales de trois acides aminés : une sérine (Ser-195), une histidine (His-57) et un aspartate (Asp-102). Ces résidus sont en interaction et forment un relai de charge qui rend nucléophile la serine du site actif et permet l'attaque du groupement carbonyle de la liaison peptidique hydrolysée.  De plus, la trypsine contient un « trou oxyanion » bordé par les groupements amides du squelette polypeptidique au niveau de la glycine 193 et de la serine 195. Cette cavité accueille l'atome d'oxygène du groupement carbonyle de la liaison peptique clivée et stabilise l'intermédiaire de réaction en favorisant la formation d'une charge négative sur l'oxygène. Hémoprotéine
L'hémoglobine et la myoglobine sont des exemples d'hémoprotéines qui respectivement transportent et stockent l'oxygène chez les mammifères. L'hémoglobine est une protéine à structure quaternaire qui se retrouve dans les globules rouges, alors que la myoglobine est une protéine à structure tertiaire localisée dans les cellules musculaires des mammifères. Bien qu'elles puissent différer dans leur localisation et leur taille, leurs fonctions sont similaires. Étant donné que ce sont des hémoprotéines, elles contiennent toutes deux un groupe hème. Chronopathologie
L’horloge circadienne permet de contrôler l’expression de plusieurs de nos gènes. Cette rythmicité résulte en une temporalité de l’organisme, défini comme étant la chronophysiologie. L’étude de la chronophysiologie permet d’identifier des fonctions métaboliques, neurologiques ou endocriniennes qui varient selon l’heure de la journée, entraînant une rythmicité fonctionnelle selon les besoins de l'organisme. La chronopharmacologie est une application de la chronobiologie qui étudie les effets des médicaments sur les cellules cibles qui dépendent d’un rythme circadien en étudiant les modifications des rythmes biologiques. Cette discipline permet d’introduire la chronotoxicité, défini comme étant la variation de la toxicité d’une substance selon son heure d’administration ainsi que la chronotolérence, c’est à dire l’horaire d'administration d’un médicament étant le plus favorable à l’organisme. La chronothérapie englobe toutes ces disciplines et prend en compte les données chronobiologiques, chronopathologiques ainsi que des résultats chronotoxicologiques et chronoparmacocinétiques afin d'améliorer et d'optimiser l'efficacité thérapeutique ainsi que de diminuer les effets indésirables sur l’organisme. Établir la chronotoxicité des médicaments et les relier à la chronotolérance permet un traitement beaucoup plus efficace et sécuritaire . Ainsi, la chronothérapie permet de restaurer les rythmes biologiques perturbés d’un individu dont l’organisation temporelle a été causée par une chronopathologie. La chronothérapie tient compte de deux systèmes qui cohabitent: l'homéostasie et le système circadien.». Voie de signalisation Hippo
Les régulateurs en amont de la cascade de kinases Hpo / Wts incluent la protéine transmembranaire Fat et plusieurs protéines associées à la membrane. En tant que cadhérine atypique, Fat (FAT1-4 chez les mammifères) peut fonctionner comme un récepteur, bien qu'un ligand extracellulaire n'ait pas été identifié. Alors que Fat est connue pour se lier à une autre cadhérine atypique, Dachsous (Ds), lors de la structuration des tissus, on ne sait pas quel rôle Ds a dans la régulation de la croissance des tissus. Néanmoins, Fat est reconnue comme un régulateur en amont de la voie Hpo. Fat active Hpo via la protéine apicale Expanded (Ex; FRMD6/Willin chez les mammifères). Ex interagit avec deux autres protéines apicalement localisées, Kibra ( KIBRA chez les mammifères) et Merlin (Mer; NF2 chez les mammifères), pour former le complexe Kibra-Ex-Mer (KEM). Ex et Mer sont tous deux des protéines contenant un domaine FERM, tandis que Kibra, comme Sav, est une protéine contenant un domaine WW. Le complexe KEM interagit physiquement avec la cascade de kinases Hpo, localisant ainsi la cascade de kinases de base sur la membrane plasmique pour l'activation. Fat peut également réguler Wts indépendamment de Ex/Hpo, par l'inhibition de la myosine Dachs. Normalement, les Dachs peuvent se lier et favoriser la dégradation des Wts. Synaptophysine
La synaptophysine est une protéine de la famille des glycoprotéines. Elle est utilisée en histochimie pour l'immunomarquage. Elle est en effet exprimée par les tumeurs neuroendocrines et permet leur identification. Son gène est le "SYP" situé sur le chromosome X humain. Trypsine
La trypsine est une endoprotéase qui hydrolyse les liaisons peptidiques dans lesquelles un acide aminé basique (Lys-|-Xaa ou Arg-|-Xaa) engage sa fonction acide (sauf dans le cas où l'acide aminé suivant (schématisé ici par "Xaa") est une Proline). Elle coupe en C-terminal de ces acides aminés. En d'autres termes, elle transforme les chaînes polypeptides en chaînes protéiques plus courtes pour permettre la digestion. Efficace à pH 7,5 - 8,5, elle est inactivée et digérée en quelques heures à pH neutre (=7) dans l'intestin. Entéropeptidase
L'entéropeptidase () (ou entérokinase) est une enzyme de la famille des hydrolases intervenant dans la digestion. Elle est produite par les cellules épithéliales du duodénum puis sécrétée par les glandes duodénales, les cryptes de Lieberkühn, chaque fois que de la nourriture passe de l'estomac dans le duodénum. Le rôle principal de l'entéropeptidase est d'activer le trypsinogène en trypsine par élimination d'un oligopeptide C-terminal, et a donc un rôle-clé dans la digestion. Cystatine C
Elle bloque l'activité des cathepsines. Elle se fixe également sur la protéine bêta-amyloïde et inhibe sa transformation en fibrille, ce qui pourrait intervenir dans la protection contre la maladie d'Alzheimer. Fluorure de 4-(2-aminoéthyl)benzènesulfonyle
Le fluorure de 4-(2-aminoéthyl)benzènesulfonyle (AEBSF) est un inhibiteur hydrosoluble irréversible de protéases à sérine telles que la chymotrypsine, la kallicréine, la plasmine, la thrombine et la trypsine. Sa spécificité est semblable à celle du fluorure de phénylméthylsulfonyle (PMSF) mais l'AEBSF est plus stable à pH faible. On l'utilise généralement à une concentration molaire de . Chymotrypsine C
La chymotrypsine C () est une protéase à sérine, c'est-à-dire une endopeptidase dont la triade catalytique contient un résidu de sérine, qui catalyse l'hydrolyse des liaisons peptidiques du côté carboxyle de résidus de leucine, de tyrosine, de phénylalanine, de méthionine, de tryptophane, de glutamine ou d'asparagine. Chez l'homme, elle est codée par le gène "CTRC", situé sur le chromosome 1. Clarithromycine
La clarithromycine est un antibiotique macrolide utilisé pour traiter les pharyngites, les angines, les sinusites aiguës maxillaires, en association avec d'autres antibiotiques pour traiter l'infection à "Helicobacter pylori" (principal responsable de maladies ulcéreuses de l'estomac et du duodénum), les complications bactériennes aiguës de la bronchite chronique, les pneumonies (en particulier les pneumonies atypiques associées à "Chlamydia pneumoniae"), les infections cutanées, et, chez les patients porteurs de VIH, pour prévenir et traiter le "Mycobacterium avium complex" disséminé ou MAC. Phomopsine
Les phomopsines sont une famille de mycotoxines produites par une espèce de champignons ascomycocètes, "Phomopsis leptostromiformis" (=" Diaporthe toxica", téléomorphe), qui infecte principalement les lupins ("Lupinus" sp., famille des "Fabaceae"). Les lupins infectés peuvent provoquer une hépatotoxicose, la lupinose, chez les animaux d'élevage, principalement les moutons. Cytokine
Moins connues du grand public que les hormones et neuromédiateurs, elles sont tout aussi essentielles à la communication entre cellules. Elles agissent via des récepteurs spécifiques, de manière paracrine (cellules proches), endocrine (cellules ou tissus distants), juxtacrine (cellules en contact), autocrine (la cellule elle-même va exprimer le récepteur pour la cytokine qu'elle produit), juxtacrine au sein de la synapse immunologique (certaines cytokines peuvent être exprimées sur la membrane sans être libérées) ou intracrine (la cytokine du cytoplasme agit directement au sein du noyau), et ce langage « universel » est compris par toutes les cellules de l'organisme. Gastricsine
La gastricsine, ou pepsine C, est une protéase aspartique qui catalyse le clivage des liaisons peptidiques avec une plus grande spécificité que la et une préférence pour les résidus de tyrosine. Cette enzyme est très active sur l'hémoglobine. Son gène est "PGC" situé sur le chromosome 6 humain. Histone H2B
Un résidu de sérine ou thréonine phosphorylé active la transcription. Quand une cellule connaît un stress métabolique, une AMPK phosphoryle la lysine à la position 36 dans l’histone H2B du promoteur et les séquences codantes sur l’ADN, ce qui aide à la régulation de l’élongation transcriptionnelle. Si les cellules reçoivent de multiples stimuli apoptotiques, caspase-3 active les kinases Mst1 ce qui phosphoryle la serine à la position 14 dans toutes les protéines de l’histone H2B, ce qui facilite la condensation de la chromatine. Les dommages de l’ADN entraînent la même réponse très rapidement pour aider à réparer l’ADN. Alpha-1-antitrypsine
L'alpha-1-antitrypsine est une protéine sécrétée par le foie. Elle est présente dans le sang, pour aller vers les poumons, pour s'opposer à l'action d'une enzyme, l'élastase. Cette enzyme-là est libérée par les leucocytes en cas d'infection, par exemple. Mitochondrie
La membrane externe contient également des enzymes impliquées dans des activités aussi diverses que la biosynthèse des acides gras (entrant notamment dans la constitution de la plupart des lipides), l'oxydation de l'adrénaline (une hormone et un neurotransmetteur) et la dégradation du tryptophane (un acide aminé protéinogène). Il s'agit notamment de la monoamine oxydase, de la NADH- réductase insensible à la roténone, de la kynurénine 7,8-hydroxylase et de l'synthétase. Hémopexine
Lhémopexine (HPX) est une glycoprotéine sanguine dont le rôle est de se lier aux molécules hèmes issues de la dégradation de l'hémoglobine. C'est un équivalent fonctionnel de l'haptoglobine, qui elle, se lie à la molécule hémoglobine entière. Chymotrypsine
Le site actif est situé dans une crevasse bordée par les 2 domaines. Il fixe le substrat au niveau de 2 régions (la région 214-216, liaison non spécifique, et la région 189-216 et 226, liaison spécifique). Chimiotaxie
Le gradient chimique est perçu à l’aide de plusieurs récepteurs transmembranaires, appelés « methyl accepting chemotaxis proteins (MCPs) » qui varient par rapport à la molécule détectée. Ces récepteurs fixent des attractants ou des repellants, soit directement soit indirectement, via des interactions avec des protéines du périplasme. Ces signaux sont ensuite transmis à des récepteurs — à travers la membrane plasmique — au cytosol où les protéines Che  deviennent activées. Les protéines Che altèrent la fréquence de « » et les récepteurs. Kynurénine 7,8-hydroxylase
Cette enzyme intervient dans le métabolisme du tryptophane. Clomipramine
La clomipramine (Anafranil) est un médicament psychotrope utilisé comme antidépresseur et anxiolytique. Il fait partie de la classe des antidépresseurs tricycliques. Il a été développé dans les années 1960 par le fabricant suisse Geigy (aujourd'hui Novartis) et est resté en usage dans le monde entier depuis lors. Il agit comme inhibiteur de la recapture de certains neurotransmetteurs, la sérotonine et la noradrénaline, dans le système nerveux central. Dans la plupart des indications, le plein effet de ce psychotrope n'est ressenti qu'au bout de deux à trois semaines. Dans le cas des TOC, il faut compter deux mois ou plus. Cycle annuel biologique
Les effets de la variation cyclique de la photopériode sur l'activité endocrinienne de plusieurs vertébrés sont médiés par la mélatonine, hormone produite par la glande pinéale. Il a été mis en évidence chez les moutons et les hamsters que l'action photopériode-dépendante de la mélatonine, au niveau de l’hypothalamus, régule les changements saisonniers de l'activité gonadique et de la sécrétion de gonadotrophine, tandis qu’elle régule les changements saisonniers de la sécrétion de prolactine au niveau de l'hypophyse (Pars Tuberalis). Trypsine
Dans la pancréatite et la mucoviscidose, la trypsine étant mal évacuée, elle est la principale cause de la réaction inflammatoire du pancréas. Mélatonine
La sérotonine est synthétisée de façon constitutive le jour et même la nuit . Elle provient de la transformation du tryptophane faisant intervenir deux enzymes. Tout d'abord, le tryptophane est transformé en 5-hydroxytryptophane par l'enzyme tryptophane hydroxylase (TH). Le 5-hydroxytryptophane subit ensuite une autre modification par l'enzyme aminoacide aromatique décarboxylase (AA-DC) pour donner la sérotonine. La sérotonine est stockée dans la glande pinéale au fur et à mesure de sa synthèse. La tryptophane hydroxylase est une enzyme mitochondriale. C'est l'enzyme limitante de la production de sérotonine. Leptine
Les adipocytes interagissent avec les autres cellules à travers la production et la sécrétion de différentes molécules de signalisation, notamment les protéines de signalisation appelées adipokines. Certaines adipokines peuvent être considérées comme des hormones, car elles régulent les fonctions des organes à distance, et plusieurs d'entre elles sont spécifiquement impliquées dans la physiopathologie de la maladie des articulations. L'une parmi ces adipokines a attiré l'attention du monde de la recherche ces dernières années. Il s'agit de la leptine. En effet, le taux de leptine croient avec l'indice de masse corporelle (IMC) et plus spécifiquement avec la masse grasse. En plus, les personnes obèses ont des niveaux plus élevés de leptine que les personnes non obèses. Chez les personnes obèses, l'augmentation des niveaux de leptine conduit à des réponses inattendues, c'est-à-dire qu'il n'y pas de réduction de l'ingestion d'aliments ni du poids corporel, car il existe une résistance à la leptine. Outre la fonction de régulation de l'homéostasie de l'énergie, la leptine joue un rôle dans d'autres fonctions physiologiques telles que la communication neuro-endocrinienne, la reproduction, l'angiogenèse et la formation d'os. Plus récemment, la leptine a été reconnue comme un facteur de cytokines avec des actions pléiotropiques également dans la réponse immunitaire et l'inflammation. Par exemple, la leptine peut se trouver dans le liquide synovial en corrélation avec l'indice de masse corporelle, et les récepteurs de leptine s'expriment dans le cartilage, où la leptine module et intervient dans de nombreuses réponses inflammatoires et destructrices du cartilage et d'autres tissus des articulations. La leptine est donc un candidat possible pour établir un lien entre l'obésité et l'arthrose, et sert d'objectif putatif pour le traitement nutritionnel de l'arthrose. Triade catalytique
La triade catalytique de la peptidase du cytomégalovirus utilise deux résidus d'histidine contigus à l'emplacement de la base et de l'acide. Retirer l'histidine « acide » conduit à une activité seulement dix fois moindre, alors que le retrait du résidu d'aspartate de la chymotrypsine conduit à une activité moindre. Cette triade particulière a été interprétée comme une possible manière de produire une enzyme à l'activité réduite afin de contrôler le taux de clivage. Créatine kinase
Dans la mitochondrie, où la concentration d' est toujours très importante, elle a pour fonction de catalyser la conversion de la créatine en phosphocréatine, impliquant la conversion de l'adénosine triphosphate (ATP) en adénosine diphosphate (ADP). Bien que l'équilibre de la réaction soit largement en faveur de la réaction inverse, cette réaction a lieu car la molécule d'ADP formée (par consommation d'une molécule d') pour créer une molécule de phosphocréatine est immédiatement transformée en par la mitochondrie, ce qui déplace l'équilibre de la réaction. Méthotrexate
L'inhibition de l'amidophosphoribosyl transférase n'est pas propre au MTX : les dihydrofolates polyglutamylés exercent cet effet de manière physiologique. Ils stimulent ainsi la synthèse de novo des pyrimidines, ainsi que la voie de recapture des purines. Toutefois, cet effet diminue lorsque les cellules entrent en phase de réplication, puisque le taux intracellulaire de dihydrofolate tend à diminuer pour fournir le tétrahydrofolate nécessaire à la synthèse nucléotidique. En contraste, le méthotrexate exerce une inhibition persistante, même à faible dose, ce qui explique son effet anti-inflammatoire. Serpine
La plupart des serpines sont des inhibiteurs de protéase, ciblant les protéases à sérine extracellulaires de type chymotrypsine. Ces peptidases possèdent un résidu nucléophile de sérine appartenant à une triade catalytique dans leur site actif. Ce sont par exemple la thrombine, la trypsine et l' . Les serpines sont des inhibiteurs irréversibles qui agissent en piégeant un intermédiaire du mécanisme catalytique de la peptidase . Chymotrypsine C
Cette enzyme se forme à partir du chymotrypsinogène C (porc) ou à partir de la sous-unité II de la procarboxypeptidase A (bœuf). À l'inverse de la chymotrypsine, elle réagit avec le Tos–Leu–CHCl et le Tos–Phe–CHCl (composés dérivés de la leucine ou de la phénylalanine par estérification à l'acide "para"-toluènesulfonique). Inhibiteur de trypsine
Le trypsinogène est une forme inactive de la trypsine. Sa forme inactive garantit que les parties protéiques de l'organisme, telles que le pancréas et les muscles, ne soient pas décomposés. Il est formé dans le pancréas et activé à la trypsine par l'entéropeptidase Le chymotrypsinogène est la forme inactive de la chymotrypsine et a des fonctions similaires à celles de la trypsine. Chymotrypsine
La chymotrypsine est produite par le pancréas sous une forme inactive appelée le chymotrypsinogène. L'activation est provoquée par la trypsine qui coupe cette molécule en deux chaînes, puis par la chymotrypsine elle-même lors d'une "trans"-protéolyse, donnant à la fin une structure globulaire compacte de trois chaînes reliées par deux ponts disulfures et repliées en 2 domaines de 120 acides aminés. ATP synthase
Au sein du chloroplaste, l’ATP libérée dans le stroma y reste jusqu’à son utilisation par les enzymes plastidiennes. Le chloroplaste ne pourvoit pas aux besoins de la cellule en matière d’ATP. Cependant, l’ATP produit dans la matrice mitochondriale peut gagner le hyaloplasme (autrement dit : sortir de la mitochondrie), et servir au métabolisme cellulaire. Par exemple, son hydrolyse peut servir à l’établissement de gradients (voir les pompes ATP-asiques à ions), au déplacement des nanomoteurs ATP-dépendants (comme la kinésine, la dynéine, la myosine…), ou plus simplement être couplée avec des réactions endergoniques très variées. L’ATP est la seule forme d’énergie chimique convertible en énergies osmotique et mécanique, ce qui ajoute encore à son importance. Chymotrypsinogène
Le chymotrypsinogène est la proenzyme de la chymotrypsine, une enzyme digestive. Chez l'homme, il est codé par les gènes "CTRB1" et "CTRB2" situés sur le chromosome 16, qui produisent un polypeptide de d'acides aminés contenant un peptide signal de . Il est sécrété par les du pancréas sous la forme d'une chaîne unique de d'acides aminés. De la famille des protéases à sérine, la chymotrypsine agit dans le duodénum en y réalisant la protéolyse des peptides à digérer. Ptérine
La ptérine existe dans la nature sous différentes formes, dépendantes de leurs fonctions. La tétrahydrobioptérine, la principale ptéridine non conjuguée chez les vertébrés, est un cofacteur dans l'hydroxylation de composés aromatiques et la synthèse de l'oxyde nitrique. La molybdoptérine est une ptéridine substituée, qui se lie à du molybdène pour donner des cofacteurs d'oxydo-réductases impliqués dans les hydroxylations, la réduction des nitrates et l'oxydation respiratoire. La tétrahydrométhanoptérine est utilisée par les organismes méthanogéniques. La cyanoptérine est une version glycosylée de la ptéridine, dont la fonction est pour l'instant inconnue chez les cyanobactéries. 2-C-méthyl-D-érythritol-4-phosphate cytidylyltransférase
Cette enzyme intervient à la troisième étape de la voie du méthylérythritol phosphate, qui est une voie métabolique de biosynthèse de et du alternative à la voie du mévalonate chez les plantes, certains protozoaires et la plupart des bactéries, l'IPP et le DMAPP étant des métabolites qui conduisent notamment à la synthèse des terpénoïdes. Emtricitabine/ténofovir
Un autre effet secondaire important est la néphrotoxicité. Étant donné que l’emtricitabine et le fumarate de ténofovir disoproxil sont éliminés par le système rénal, des cas de néphropathie ont été associés à la prise de Viread. Il est important de doser la créatinine de tous les patients qui vont ou qui prennent de l'emtricitabine/ténofovir afin d’assurer qu'il n'y ait aucune complication rénale. Les patients ayant déjà des risques de dysfonctionnement rénal doivent être surveillés étroitement, mais n’importe quel patient prenant de l'emtricitabine/ténofovir peut développer une néphropathie. Lorsque la créatinine a une clairance comprise entre 30 et 49 ml par minute, l’administration de la dose doit être aux 48 heures au lieu d’être quotidiennement. Pour un patient qui aurait une clairance sous les 30 ml par minute, le traitement par emtricitabine/ténofovir doit être arrêté. Par le fait même, les agents néphrotoxiques autres ne doivent pas être combinés à ce comprimé. Cuticule (champignon)
Les rôles de la cuticule chez les champignons sont : la protection mécanique de l'hyménophore ; la protection contre la déshydratation ; la modification de la forme chez les champignons hygrophanes, l'adaptation morphologique par une forme d'appel mimétique, par des couleurs différentes par exemple chez le genre "Russula" et parfois la protection de l'hyménium quand il n'y a pas de chair dans l'hyménophore, comme dans le genre "Parasola". Elle limite probablement l'évapotranspiration. Cylindrospermopsine
En tant que l'une des dernières catégories de toxines identifiées elle est encore mal connue, notamment pour ses comportements toxicocinétiques et toxicodynamiques ; sont aussi mal connus les facteurs favorisant la production de cette toxine par les cyanobactéries concernées ou les facteurs environnementaux qui favorisent ces mêmes cyanophycées.  En 2004, seuls deux variants avaient été décelés alors qu'on en connait bien plus chez d'autres cyanotoxines, mais il pourrait en exister d'autres. Elle n'a été trouvé en France que récemment (publication 2009). Des études ont porté sur ses produits de dégradation lors du processus de chloration de l'eau et sur son éventuelle cancérogénicité et/ou génotoxicité (2009) ; cette étude a montré que la toxine est aussi génotoxique (testée "in vitro" sur deux lignées cellulaires humaines d'entérocytes et d'hépatocytes humains (les Caco-2 et les HepaRG). La CYN semble devenir progénotoxique après . Chez la souris de laboratoire vivante, après 24h l'administration ip ou orale de la toxine fait apparaître . Le test du micronoyau n'a pas montré sur la moelle osseuse ni le colon d'altération chromosomique induite. Chez le hamster pris comme modèle animal, la cylindrospermopsine se montre également cancérogène en induisant une transformation cellulaire des cellules SHE (Syrian Hamster Embryo), même à très faibles doses, ce qui est considéré comme une preuve de potentiel cancérogène. Bléomycine
La bléomycine est un agent anti-cancéreux. C'est un peptide non ribosomique produit par la bactérie "Streptomyces verticillus". Elle agit comme antibiotique glycosylé linéaire, par induction de rupture du brin d'ADN (inhibition de la transcription et de la réplication de l'ADN). On l'utilise dans le traitement des lymphomes, des carcinomes à cellules squameuses, le cancer des testicules, la pleurodèse, les verrues plantaires, les chéloïdes… Inhibiteur de trypsine
L'inhibiteur de trypsine peut également être présent naturellement dans le pancréas d'espèces telles que les bovins. Sa fonction est de protéger l'animal de toute activation accidentelle du trypsinogène ou du chymotrypsinogène. Chymotrypsinogène
Le chymotrypsinogène est stockée dans des granules des , qui libèrent leur contenu dans le duodénum sous l'effet d'un stimulus nerveux ou hormonal. Il est converti en chymotrypsine active par un ensemble de réactions commençant par le clivage de la liaison peptidique située entre les résidus d'arginine-15 et d'isoleucine-16. Cela conduit à la formation d'une protéine appelée π-chymotrypsine formée de deux chaînes peptidiques unies par un pont disulfure. Une molécule de π-chymotrypsine agit sur une autre en clivant la liaison peptide entre des résidus de leucine et de sérine, puis la π-chymotrypsine activée agit sur une autre molécule de π-chymotrypsine pour en cliver deux dipeptides : Ser14–Arg15 et Thr147–Asp148. Cette réaction libère l'α-chymotrypsine active . Voie de la kynurénine
La voie de la kynurénine intervient dans les fonctions physiologiques régissant le comportement, le sommeil, la thermorégulation et la gestation. Elle est également fortement suspectée d'être impliquée dans les processus neurotoxiques associés à diverses maladies neurologiques inflammatoires telles que le syndrome démentiel du SIDA, la maladie d'Alzheimer, la maladie de Huntington, la maladie de Charcot, la maladie de Parkinson et la sclérose en plaques. Protéase 3C-like
Le site de liaison au substrat (la molécule qui va être clivée) de chaque monomère est situé dans une cavité profonde, formée par deux tonneaux β comme dans la chymotrypsine, entre les domaines et . Le site actif catalytique est situé au centre de cette cavité, il est formé par un résidu d'acide aminé histidine situé en (His41) de la chaîne protéique et un résidu de cystéine situé en 145 position (Cys145) . Contrairement à la chymotrypsine, il n'a pas été découvert de troisième résidu intervenant dans l'activité catalytique, il s'agit donc d'une dyade et non d'une triade catalytique. Une molécule d'eau est liée par une liaison hydrogène au résidu His41, cette molécule d'eau pourrait jouer le rôle habituellement tenu par le troisième résidu catalytique (acide aspartique) de la triade des protéases à sérine . Minocycline
La minocycline possède une activité anti-inflammatoire sur le cerveau, en détruisant les biomarqueurs (chimiokines, cytokines...) du type MMP-9, ERO, MAPK, PARP-1 ou caspases 1,3 (Ce dernier jouant un rôle dans l'apoptose). Peptidase
La plupart des peptidases clivent préférentiellement la chaîne peptidique à des positions précises, en fonction de la nature des chaînes latérales des acides aminés qui entourent le site de coupure. Dans certains cas, cette spécificité est faible, mais dans d'autres, elle peut être très sélective. La coupure peut aussi être influencée par la structure de la protéine substrat. Ainsi la chymotrypsine, enzyme digestive, coupe préférentiellement après les acides aminés aromatiques ou aliphatiques. Enzyme
Le clivage d'une chaîne polypeptidique est un autre exemple de modification post-traductionnelle. La chymotrypsine, une peptidase digestive, est produite dans le pancréas sous une forme inactive appelée chymotrypsinogène et transportée sous cette forme jusque dans l'estomac, où elle est activée. Ceci permet d'éviter que la chymotrypsine active ne digère d'autres tissus avant de parvenir dans l'estomac. Ce type de précurseur inactif d'une enzyme est un zymogène. Dépression médullaire
La dépression médullaire, également appelée myélotoxicité ou myélosuppression, est la diminution de la production de cellules responsables de l'immunité (leucocytes), transportant l'oxygène (érythrocytes) et / ou celles responsables de la coagulation sanguine normale (thrombocytes). La dépression médullaire est un effet secondaire grave de la chimiothérapie et de certains médicaments affectant le système immunitaire tels que l'azathioprine. Le risque est particulièrement élevé en chimiothérapie cytotoxique pour la leucémie. Resvératrol
Des travaux réalisés en 2010 montrent que le resvératrol augmente l'expression d'un microARN (nommé miR-663) dans les cellules immunitaires humaines, ce qui diminue l'expression d'un autre microARN (le miR-155), ce dernier favorisant la réaction inflammatoire. Le resvératrol est un agent prometteur dans la chimio-prévention. Il assure la médiation de nombreuses cibles cellulaires impliqués dans les voies de signalisation du cancer. On a étudié la cytotoxicité induite par le resvératrol dans les cellules H1299, des cellules du cancer du poumon non à petites cellules ayant une délétion partielle du gène qui code la protéine p53. Le resvératrol a réduit la viabilité de quatre lignées de cellules avec une relation dose et temps-dépendante. La cytotoxicité induite par le resvératrol dans ces cellules a été en partie médiée par la protéine p53 et a participé à l'activation des caspases 9 et 7 et au clivage de la Poly (ADP-ribose) polymérase. Ces résultats suggèrent une possible stratégie thérapeutique basée sur l'utilisation de resvératrol pour le traitement des tumeurs qui sont généralement insensibles aux thérapies conventionnelles en raison de leur perte de fonction p53 normale. Triade catalytique
La chymotrypsine est considérée comme l'un des paradigmes des enzymes à triade catalytique, ici la triade sérine–histidine–aspartate.La même triade a également fait l'objet d'une évolution convergente dans les repliements α/β hydrolase telles que certaines lipases et estérases, mais la chiralité y est cependant inversée. L'acétylcholinestérase utilise l'équivalent sérine–histidine–glutamate. Glande métapleurale
La glande métapleurale, aussi appelée glande métasternale ou glande métathoracique, est une glande exocrine unique aux fourmis. Elle est considérée comme une synapomorphie de cette famille, bien qu'elle soit disparue indépendamment au sein de certaines lignées. Sa principale fonction serait, la sécrétion lors des séances d'auto-toilettage de composés aux activités antimicrobiennes et antifongiques (acide phénylacétique, myrmicine) servant de défenses chimiques contre les pathogènes, mais d'autres fonctions ont été documentées chez certaines espèces. Sa taille varie entre les espèces et entre les castes. Phosphorylation au niveau du substrat
La première de ces deux enzymes intervient dans le cycle de Krebs et on pense qu'elle contribue aux échanges de potentiel de phosphorylation entre le cytosol et la matrice mitochondriale . La seconde est peut-être la seule enzyme susceptible de pouvoir maintenir un certain taux d'ATP dans la matrice mitochondriale en l'absence de la force proton-motrice générée par la chaîne respiratoire, par exemple au cours d'un épisode d'hypoxie temporaire. Lymphocyte
Également appelé « thymocyte » ou « cellule T », ce type de lymphocytes joue un grand rôle dans les réponses immunitaires primaire et secondaire. « T » est l'abréviation de thymus, l'organe dans lequel leur développement s'achève. Elles sont responsables de l'immunité cellulaire : les cellules (bactéries, cellules cancéreuses) reconnues comme étrangères (c'est-à-dire autres que celles que les cellules T ont appris à tolérer lors de leur maturation) sont détruites par un mécanisme complexe. Immunosuppresseur
Les principaux représentants de cette classe sont les moutardes (cyclophosphamide), les nitrosurées, les sels de platine (parmi d'autres). Leur effet cytostatique s'effectue par interaction directe avec l'ADN (acide désoxyribonucléique). La cyclophosphamide est certainement une des substances immunosuppressives les plus puissantes. Elle inhibe la réplication de l'ADN en faisant des liaisons covalentes entre les molécules. À doses faibles c'est un traitement très efficace dans le traitement du lupus érythémateux disséminé, des anémies hémolytiques autoimmunes, de la maladie de Wegener et pour d'autres maladies auto-immunes. À fortes doses, il y a un risque de pancytopénie et de cystite hémorragique. Lymphocyte NK
Les cytokines sont des médiateurs inflammatoires essentiels qui contrôlent de multiples aspects de la biologie des cellules NK. Les cellules NK expriment les récepteurs des cytokines au début de leur développement et nécessitent une signalisation à travers la chaîne gamma commune (γc) pour leur développement, leur homéostasie et leur fonction. La chaîne γc (CD132) est une glycoprotéine transmembranaire qui sert de sous-unité de signalisation pour IL-2, IL-4, IL-7, IL-9, IL-15 et IL-21. Bien que ces cytokines présentent une certaine redondance fonctionnelle, leurs fonctions spécifiques aux cellules au cours d'une réponse immunitaire sont déterminées par l'expression de récepteurs distincts Chylifère
Les chylifères sont des vaisseaux faisant partie du réseau lymphatique, situés au niveau de l'intestin grêle. Ils ont pour fonction de collecter la plus grande partie des lipides (phospholipides, esters du cholestérol, cholestérol, vitamines liposolubles...) absorbés au niveau de cet organe. Tous ces lipides génèrent les chylomicrons qui forment un liquide laiteux, le chyle. La lymphe chylifère est collectée au niveau de la citerne du chyle et rejoint ensuite la circulation sanguine via le canal thoracique. Ciprofloxacine
La ciprofloxacine est un antibiotique à large spectre, habituellement efficace sur les bactéries Gram-positives, Gram-négatives, les germes atypiques (intracellulaires) et certains genres anaérobies. Elle inhibe l'ADN gyrase bactérienne, une enzyme de la famille des topoisomérases, nécessaire à la réplication de l'ADN de la bactérie. Inhibiteur de la 4-hydroxyphénylpyruvate dioxygénase
La 4-hydroxyphénylpyruvate dioxygénase (HPPD) est une enzyme présente chez les plantes et les animaux qui catalyse le catabolisme d'un acide aminé, la tyrosine.  Une moindre dégradation de la tyrosine a trois conséquences négatives chez les plantes : freinage de la croissance par excès de tyrosine, symptômes de stress oxydant en raison du manque de tocophérols (vitamine E) et destruction de la chlorophylle par défaut de caroténoïdes qui la protègent. Lévofloxacine
La lévofloxacine est un antibiotique à large spectre actif contre les bactéries Gram-positives et les bactéries Gram-négatives. Comme toutes les molécules de la famille des quinolones, elle inhibe l'ADN gyrase et la bactérienne. La topoisomérase IV est une enzyme nécessaire à la séparation de l'ADN répliqué (doublé) avant la division cellulaire bactérienne. L'ADN n'étant pas séparé, le processus est arrêté et la bactérie ne peut plus se diviser. La seconde enzyme, l'ADN gyrase, est responsable du surenroulement de l'ADN, de sorte qu'il s'adapte aux cellules nouvellement formées. L'inhibition de ces deux enzymes entrainent la mort des bactéries. La lévofloxacine agit comme un bactéricide. Voie de signalisation Hippo
La voie Hippo consiste en une cascade de kinases de base dans laquelle Hpo phosphoryle (drosophile) la protéine kinase Wartz (Wts) Hpo (MST1/2 chez les mammifères) est un membre de la famille Ste-20 des protéines kinases. Ce groupe hautement conservé de sérine / thréonine kinases régule plusieurs processus cellulaires, y compris la prolifération cellulaire, l'apoptose et diverses réponses au stress. Une fois phosphorylé, Wts ( LATS1/2 chez les mammifères) devient actif. Misshapen (Msn, MAP4K4 / 6/7 chez les mammifères) et Happyhour (Hppy, MAP4K1 / 2/3/5 chez les mammifères) agissent parallèlement à Hpo pour activer Wts Wts est une kinase nucléaire liée à la DBF-2. Ces kinases sont des régulateurs connus de la progression, de la croissance et du développement du cycle cellulaire. Deux protéines sont connues pour faciliter l'activation de Wts: Salvador (Sav) et Mob comme suppresseur de tumeur (Mats). Sav (WW45 chez les mammifères) est une protéine contenant un domaine WW, ce qui signifie que cette protéine contient une séquence d' acides aminés dans laquelle un tryptophane et une proline invariante sont hautement conservés. Hpo peut se lier à Sav et la phosphoryler, ce qui peut fonctionner comme une protéine d'échafaudage car cette interaction Hpo-Sav favorise la phosphorylation de Wts. Hpo peut également phosphoryler et activer Mats (MOBKL1A / B chez les mammifères), ce qui permet à Mats de s'associer et de renforcer l'activité kinase de Wts. Rénine
Son rôle est de catalyser la transformation de l'angiotensinogène (protéine synthétisée par le foie) en angiotensine I qui donnera elle-même l'angiotensine II, peptide entraînant une augmentation de la volémie en jouant sur la sensation de soif, la sécrétion d'aldostérone, et le calibre des vaisseaux sanguins. Mésotrione
La mésotrione est un herbicide vendu sous les noms de callisto et tenacity par Syngenta depuis 2001. Il s'agit d'une molécule de synthèse analogue à la leptospermone et développer pour imiter les effets de cet herbicide naturel. La mésotrione est un herbicide de classe inhibiteurs HPPD, qui inhibe l'enzyme 4-hydroxyphénylpyruvate dioxygénase. Dans les plantes l'enzyme HPPD est nécessaire à la biosynthèse des caroténoïdes; ces derniers protègent la chlorophylle contre la dégradation par les rayons lumineux. Neuropeptide
L'ocytocine ne pouvant franchir la barrière hémato-encéphalique, comment se fait-il qu'on la retrouve dans le cerveau ? Pour pouvoir jouer le rôle de neurotransmetteur, l'ocytocine doit être produite par les neurones hypothalamiques et être libérée dans des synapses à l'extrémité de leurs axones. L'ocytocine se lie alors à des récepteurs qui sont exprimés par des neurones de l'amygdale, l'hypothalamus ventromédial, du septum, du noyau accumbens et du tronc cérébral. Chymotrypsine
La chymotrypsine doit absolument être conservée au froid pour garder l'activité enzymatique. Amylose à transthyrétine
Le diagnostic reposait auparavant essentiellement sur la biopsie d'organes atteints et la caractérisation des dépôts amyloïdes. Cette biopsie peut concerner également la graisse sous cutanée mais cette dernière est fréquemment négative dans les formes séniles. En dernier ressort, une biopsie endomyocardique est faite. Les échantillons sont traitées par immunohistochimie pour permettre de reconnaître le type d'amylose, éventuellement aidée par une spectrométrie de masse. HMGB1
C'est aussi une protéine impliquée dans la tolérance immunitaire. En effet, l'activation de l'apoptose par la voie des caspases permet le relargage du cytochrome c et une perméabilisation de la membrane externe de la mitochondrie. Il y a alors activation des caspases 3 et 7et clivage de la protéine p75 (composante de la chaîne respiratoire du complexe I). Cette dernière va provoquer une forte libération de ROS ("reactive oxygen species)" qui vont permettre l'oxydation de la protéine HMGB1. Ce faisant, HMGB1 perd sa capacité d'immunostimulateur. On sait que c'est l'oxydation de la C106 précisément qui est suffisante et nécessaire pour l’empêcher d’être fonctionnelle. Martine Jandrot-Perrus
Martine Jandrot-Perrus a consacré sa recherche à l'étude de la biologie plaquettaire et de l'hémostase. Ses travaux ont notamment porté sur la caractérisation d’un inhibiteur de la thrombine, la protéase-nexine 1, et de ses fonctions dans l'hémostase. Elle a également cloné le récepteur majeur des plaquettes au collagène, la (), qu'elle a caractérisée fonctionnellement. Ses travaux ont contribué à démontrer le rôle accessoire de la GPVI dans l’hémostase primaire et son rôle critique dans la thrombose, ouvrant ainsi la porte au développement d'un anticorps thérapeutique anti-GPVI par la spin-off de l'Inserm "Acticor Biotech". Thermogénine
Elle est apparentée à d'autres transporteurs de biomolécules tels que le translocateur de nucléotides à adénine et agit comme un canal à protons à travers la membrane mitochondriale interne. Dans les cellules des tissus adipeux bruns, elle est activée par les acides gras et est inhibée par les nucléotides. Le mécanisme de signalisation cellulaire à l'œuvre à partir des terminaisons du système nerveux sympathique met en jeu la noradrénaline, qui se fixe à un récepteur β-adrénergique de la membrane plasmique. Celui-ci active une adénylcyclase "via" une protéine G, ce qui a pour effet de libérer de l'AMP cyclique dans le cytoplasme. L'AMP cyclique active une protéine kinase A, qui phosphoryle une lipase hormonosensible, ce qui a pour effet de l'activer et de cliver les triglycérides en libérant les acides gras qui les composent. Ces derniers activent la thermogénine, en annulant les effets inhibiteurs du GDP et de l'ATP. Cet effet se prolonge jusqu'à ce que les mitochondries aient oxydé tous les acides gras, ce qui lève l'activation de la thermogénine et rétablit l'imperméabilité de la membrane mitochondriale interne, ce qui rétablit le couplage de la production d'ATP avec la chaîne respiratoire. Imatinib
Il entre en compétition avec l'adénosine triphosphate (ATP) sur le récepteur d'une tyrosine kinase, au niveau intracellulaire, ce qui va empêcher la fixation de l'ATP et donc la phosphorylation du substrat. Ainsi la signalisation sera éteinte, et tend à lancer la cascade apoptotique. Il cible plusieurs tyrosine kinases dont le c-KIT et le PDGFR. L'imatinib est utilisé dans le cas de la leucémie myéloïde chronique, car il est en compétition avec l'activité tyrosine kinase constitutive de la protéine chimérique BCR-ABL qui est issue de la translocation t(9;22) (chromosome de Philadelphie). Aplysiatoxine
L'aplysiatoxine est une cyanotoxine produite par certaines espèces de cyanobactéries, chez lesquelles elle intervient comme défense contre la prédation par des poissons grâce à sa puissante action irritante et cancérogène par activation de la protéine kinase C. Bien que cette action favorise l'apparition de tumeurs, l'activation de la protéine kinase C peut être bénéfique à certaines applications médicales, de sorte que des analogues synthétiques de l'aplysiatoxine ont fait l'objet de recherches comme anticancéreux Depsipeptide
Le depsipeptide étamycine, un produit naturel nouvellement isolé à partir d'un actinomycète marin, démontre une activité in vitro et chez la souris contre le MRSA. On lui observe un rôle positif dans l'expression des gènes en 1990. Un essai clinique a été mené en 1996 pour le lymphome à cellules T. Tétracycline
La tétracycline est un antibiotique bactériostatique de la classe des cyclines (ou tétracyclines), produit par une bactérie du genre Streptomyces. Elle est indiquée contre nombre d'infections bactériennes à Gram positif, Gram négatif et anaérobies, mais aussi contre certains autres micro organismes : Chlamydia, Mycoplasma et Rickettsia. On l'utilise également pour produire de nombreux dérivés semi-synthétiques de la classe des tétracyclines. Protéostase
Deux approches principales ont été utilisées pour le développement thérapeutique ciblant le réseau protéostatique : les chaperons pharmacologiques et les régulateurs de la protéostase. Le principe qui sous-tend la conception de chaperons pharmacologiques pour une intervention dans les maladies liées à la protéostase consiste à concevoir de petites molécules stabilisant des protéines présentant une stabilité limite. Auparavant, cette approche était utilisée pour cibler et stabiliser les récepteurs couplés à la protéine G, les récepteurs des neurotransmetteurs, les glycosidases, les protéines de stockage lysosomales et la protéine CFTR mutante responsable de la fibrose kystique et de la transthyrétine, lesquels peuvent être défectueux et s'agréger, conduisant à l'amyloïdose. Vertex Pharmaceuticals et Pfizer vendent des chaperons pharmacologiques approuvés par les organismes de réglementation pour améliorer, respectivement, la fibrose kystique et les amyloïdoses transthyrétiniques. Amicus vend un chaperon pharmacologique approuvé par un organisme de réglementation pour la maladie de Fabry - une maladie de stockage lysosomal. Pomme de terre
La pomme de terre contient aussi des inhibiteurs de protéinase capables d’inhiber les principales protéinases digestives des animaux, notamment la trypsine, la chymotrypsine. Ces substances qui jouent un rôle dans la défense de la plante contre certains ravageurs, insectes ou microorganismes, sont détruites par la cuisson. Les lectines sont des protéines capables de se lier de manière réversible à des mono- ou oligosaccharides. Cette propriété permet aux lectines d’agglutiner les hématies de diverses espèces de mammifères dont l’homme et de probablement perturber le bon fonctionnement du tube digestif des insectes se nourrissant de la plante, jouant ainsi un rôle dans la défense de cette plante contre les insectes. Ces molécules sont également thermolabiles. Hémoglobine
Chez les vertébrés, les érythrocytes parvenus en fin de vie du fait de leur sénescence ou de leur altération sont retirés du sang par phagocytose par des macrophages dans la rate et dans le foie. En cas d'hémolyse dans la circulation sanguine, l'hémoglobine se lie à l'haptoglobine, tandis que l'hème libre est fixé par l'hémopexine, ce qui limite l'effet oxydant. L'hémoglobine incomplètement dégradée ou libérée en trop grande quantité à partir de globules rouges endommagés est susceptible d'obstruer les vaisseaux sanguins, notamment les capillaires des reins, ce qui peut provoquer des néphropathies. L'hémoglobine libérée est éliminée du sang par la protéine CD163, exclusivement exprimée dans les monocytes et les macrophages. L'hémoglobine est dégradée dans ces cellules et le fer de l'hème est recyclé, tandis qu'une molécule de monoxyde de carbone est libérée par molécule d'hème dégradée  : la dégradation de l'hème est l'un des rares processus naturels produisant du monoxyde de carbone dans le corps humain et est responsable de la présence de CO dans le sang d'individus respirant même l'air le plus pur. Ce processus forme de la biliverdine, puis de la bilirubine, de couleur jaune. Insoluble, elle est libérée par les macrophages dans le plasma sanguin, où elle se lie à la sérum albumine, qui la transporte jusqu'aux hépatocytes. Ces derniers la solubilisent par conjugaison avec l'acide glucuronique et la sécrètent dans les intestins avec la bile. Les intestins métabolisent la bilirubine en urobilinogène, qui est excrété dans les fèces sous forme de stercobiline ainsi que dans les urines. Lorsque la bilirubine ne peut être excrétée, sa concentration sanguine augmente et elle est éliminée essentiellement par les urines, qui deviennent foncées tandis que les fèces sont décolorées. Érythromycine
L'érythromycine empêche la croissance des bactéries, par interférence avec la biosynthèse des protéines. Elle se lie avec la sous-unité ribosomique 50S et empêche ainsi la translocation des peptides et la formation de polypeptides. Facteurs affectant le cycle reproductif des mammifères
La mélatonine (N-acétyl-5-méthoxy-tryptamine) est une hormone dont la sécrétion est grandement influencée par la lumière. Pour comprendre le rôle de la mélatonine sur le rythme endogène de la reproduction, il a d’abord été nécessaire d’identifier quelles étaient les cibles exactes de son action. En effet, la mélatonine est une composante importante dans de nombreuses fonctions physiologiques. C’est en partie pour cela que les récepteurs de la mélatonine sont distribués dans de nombreux tissus différents. D’ailleurs, il a été démontré que la mélatonine agit sur plusieurs sites, dont chacun régule leur propre fonction saisonnière. Chymosine
Pour fabriquer les fromages, on ajoute au lait de la présure de veau qui contient cette enzyme. Celle-ci hydrolyse la caséine kappa, la coupant ainsi en deux. On obtient d'une part le CMP (Caseino-Macro-Peptide) hydrophile et soluble, diffusé à l'extérieur de la micelle de caséines ; d'autre part la PCK hydrophobe, qui, elle, reste à l'intérieur. L'ajout de chymosine et son action sur la permet la déstabilisation des micelles de caséine du lait qui coagulent alors en présence d'ions calcium pour donner un bloc de lait solide, le caillé, et du lactosérum. Phosphopentose épimérase
Chez les plantes, la phosphopentose épimérase se trouve au sein des chloroplastes, dans la membrane des thylakoïdes . Elle intervient dans le cycle de Calvin pour régénérer le ribulose-1,5-bisphosphate, qui est la molécule sur laquelle le  est fixé par la Rubisco, en convertissant le xylulose-5-phosphate en ribulose-5-phosphate, lequel est ensuite phosphorylé en ribulose-1,5-bisphosphate par la phosphoribulokinase. En vertu de cette position particulière, il est probable que la phosphopentose épimérase joue un rôle dans la régulation du flux de matière circulant à travers le cycle de Calvin. Cytoplasme
La mitochondrie est un organite qui se trouve dans toutes les cellules eucaryotes, bien qu'elles puissent être absentes des cellules très spécialisées. Leur taille est généralement de cinq micromètres de large sur 0,2 µm d'épaisseur et possède une double membrane. L'espace inter-membranaire a une composition similaire à celle du hyaloplasme. Le rôle de cet espace est principalement de produire des molécules qui servent de précurseurs à la biosynthèse de macromolécules dans le hyaloplasme et d'être le lieu où se déroulent l'oxydation respiratoire et la synthèse des protéines mitochondriales. Cette dernière fonction se déroule de la même manière que la synthèse des protéines dans le hyaloplasme. Chymosine
C'est une hydrolase spécifique de la caséine. Elle clive la liaison Phe(105)–Met(106), donc entre une phénylalanine et une méthionine, de la , et la liaison 23-24 (donc entre deux phénylalanines) de la caséine αS1. Son activité optimale se situe à et à pH acide (3,5-4). Déficit en alpha-1-antitrypsine
En 1970 on découvre que la protéase élastase peut donner des emphysèmes chez l'animal de laboratoire. On a la première description de l'élastase sur le neutrophile humain, avec des modifications identiques à celles observées chez l'animal. L'élastase des neutrophiles humains est inhibée par alfa-1-antitrypsine. On a aussi découvert que le foie était une cible au même titre que les poumons. En 1990 on a compris que la déficience en alpha-1-antitrypsine plasmatique était en fait un défaut de la structure tertiaire de la protéine avec polymérisation dans le foie. Cette polymérisation entraîne une accumulation de la protéine et semblait, sinon être la cause, du moins contribuer à la maladie hépatique. Capréomycine
La capréomycine agit en bloquant la biosynthèse des protéines des bactéries qui présentent un gène "tlyA" actif, ce qui est le cas d'un nombre restreint d'organismes, essentiellement des mycobactéries, parmi lesquelles "Mycobacterium tuberculosis". Plus précisément, la capréomycine se lie à l'ARNr 16S et à l'ARNr 23S, d'une façon qui rappelle celle de la , un antibiotique structurellement apparenté mais présentant une plus grande toxicité. Le gène "tlyA" code une méthyltransférase qui modifie les ARNr 16S et 23S en formant un site de liaison pour la capréomycine, permettant à cette molécule de bloquer la biosynthèse des protéines. Les souches bactériennes dépourvues de gène "tlyA" actif sont résistantes à cet antibiotique. Aminopeptidase B
Cette enzyme des mammifères peut être cytosolique ou liée à la membrane plasmique. Elle est activée par les ions chlorure ainsi que par de faibles concentrations de thiols. Avec l'activité leucotriène A hydrolase (), elle est l'une des deux activités portées par une même protéine bifonctionnelle.