被害バクテリアによる病気で、春の芽が20cmぐらいから伸び切るまでの期間(葉が最も軟らかい時期)に限って発生します。地際から葉が腐って、ぱたぱたと倒れるのが、典型的な症状です。苗を引き抜くと、元がドロドロに腐っていて、いやなにおいがします。多発する病気ではないが、1回発生すると、毎年同じところで出るようです。花菖蒲が10cmぐらいの高さに伸びたころに、銅剤を散布すれば予防できます。ナメクジが発生を助長することがあるので、ナメクジの防除も同時に行います。株が茂りすぎて風通しが悪かったり、日照不足が続いたりすると発生することがあります。地際の葉に白い菌糸や茶色の粒状の菌殻ができたりします。風通しと日当たりを、よくすることが一番です。ベノミル水和剤・チオファネートメチル水和剤などの殺菌剤が効きます。