(ヤポネシア人(1))の形成に関する「二重構造」モデルは、在来の採集狩猟民(象徴的に「縄文系」と呼ぶ)と弥生時代以降に日本列島に渡来した稲作農耕民(象徴的に「弥生系」と呼ぶ)が混血したと仮定しています。その結果、縄文系の要素は北方に居住するアイヌ人と南方に居住するオキナワ人の双方で高い一方、中央部に居住するヤマト人(2)は弥生系の要素が高くなっています。このモデルは私たちが以前おこなった遺伝子解析で支持されましたが、その解析で使われたヤマト人は主に東京周辺に居住する人々でした。データを生成し、それらとバイオバンクジャパン(3)のデータを含む東アジアの他の人類集団のゲノムデータと比較解析しました。居住するヤマト人内にこのような内部構造が生じたのは、縄文時代以降に東アジア大陸部から複数回の渡来があったことを示唆します。これは、「二重構造」モデルをすこし変更した「うちなる二重構造(6)」モデルを支持しています。らによって実施されました。藤岡大拙館長にお世話になりました。以上にわたってつらなっています。年代にこの列島を「ヤポネシア」と呼びました。ヤポネシアは大きく北部(北海道、{樺太と千島を含むこともある})、中央部(本州、四国、九州およびその周辺の島々)、南部(南西諸島)に分けられます。歴史的に北部にはアイヌ人が、南部にはオキナワ人が、そして中央部にはヤマト人が居住してきました。年に発表した論文で、アイヌ人とオキナワ人の共通性を指摘しました。年代以降に「二重構成」あるいは「二重構造」という名称で、南北2集団の近縁性を指摘しました。2)は、埴原和郎の描いた二重構造モデルを描き直したものです。データを比較解析し、二重構造モデルが基本的に成り立つことを示しました。この研究で用いたヤマト人は、おもに東京周辺在住の人々でした。)のデータと比較解析をおこないました。図1:埴二重構造モデル図2:今回比較した9地域(集団の色は図4と対応)本研究の成果まず主成分分析の結果をお示しします。2)はジャパンバイオバンクの日本人全データ(灰色)東アジアの大陸部5集団(韓国人、北京の漢族、中国南部の漢族、ベトナム人、ダイ族)を比較したものです。日本人がおおきくふたつのかたまりにわかれていますが、左がオキナワ人、右がヤマト人です。ヤマト人のかたまりに位置していますが、九州だけは、オキナワ人のかたまり(A)とヤマト人のかたまり(B)にわかれています。前者(A)は、おそらくオキナワの文化やオキナワ人の影響が強い鹿児島県の奄美大島地方の人々ではないかと推察されます。東北集団は、ヤマト人のかたまりのなかでやや左上にシフトしており、近畿集団はやや右にシフトしています。枕崎集団はややオキナワ人のかたまりに近い位置にシフトしています。ここでは9個の祖先集団が存在したと仮定して、それらの割合をいろいろな色で示しています。(A)の人々は緑色で示された祖先集団から伝えられた割合が大きいのに対して、他の日本人には緑色の成分は少なく、大陸の集団にはほとんど緑色成分がみられません。右からベトナム人、ダイ族、中国南部の漢族、中国北京の漢族には、ピンク色でしめした祖先集団がかなり伝えられていますが、ヤポネシア人にはほとんどピンク色成分がありません。中国南部の漢族、中国北京の漢族、韓国人に多い水色で示された祖先集団の成分は、北海道から九州(B)までのヤマト人には多少みられますが、九州(A)とオキナワ人にはわずかな割合しか伝わっていません。これら南部の2集団を除くヤポネシア人には、茶色の成分が半数以上含まれていますが、韓国人では3割程度見られます。混血を繰り返してきた人類集団の遺伝的関係をしめす方法のひとつに、「系統ネットワーク」があります。5)にしめしたのがその解析結果です。左側にアイヌ人が、右側に東アジア大陸部の2集団(中国北京の漢族と韓国人)が位置しており、オキナワ人とヤマト人は両者のあいだに位置しています。アイヌ人以外の集団で比較しました。集団間の遺伝的関係をしめした系統ネットワーク今度も右側には東アジア大陸部の2集団が位置しますが、左側にはオキナワ人と九州(A)集団がまとまっています。その中央、水色でしめされた部分の拡大図を見ると、左側に枕崎集団が、右側に近畿地方集団が位置しています。どちらも、図4で示した主成分分析の結果と一致しています。(B)の4集団がかたまっています。それらからすこし離れて東北地方集団が位置しています。(A)集団と分けられます。このように、山陰地方の出雲人が枕崎や沖縄の集団と遺伝的に近くなっているのです。枝の長さは短いものの、枝eは東北集団と沖縄・九州(A)集団の共通性を示しています。テストという別の方法でも確認されました。7)でしめした「うちなる二重構造」モデルを支持するものです。らが、最近沖縄の宮古島に明確な集団構造があることを報告しました(引用文献3)。これら沖縄と九州のデータをあわせて解析する計画をすすめています。(山形大学医学部との共同研究)の人々のDNAを調べる予定です。近い将来、ヤポネシアに現在住んでいるひとびとの詳細なゲノムの地理的多様性が浮かび上がることが期待されます。ヤポネシアゲノム」の名称はここから由来している。population)ヤポネシアの中に居住する3集団のうちで、北部中心に居住するアイヌ人と南部中心に居住するオキナワ人以外の大多数の人々を指す。自然人類学でこれまで「本土日本人」と呼んできた集団に対応する。ゲノム研究バイオバンク事業「利活用を目的とした日本疾患バイオバンクの運営・管理」のもと運営・管理されている。サンプルが収集された(https://biobankjp.org)。ヒトデータベースから制限公開され、審査の上データ管理セキュリティが担保された機関に配布されている(https://humandbs.biosciencedbc.jp/hum0014-v21)。試料等配布審査会において研究目的の厳正な審査の上、配布される。本研究でも審査の上配布されたデータが使用された。PCA)大量のデータに含まれる多様性を線形代数理論を利用して、全分散を互いに独立な主成分に分割する手法。通常はもっとも分散の大きな第一主成分と次に分散の大きい第二主成分の平面上に示されることが多い。network)枝分かれしてゆくのみの系統樹と異なり、矛盾する分割を含む場合のある構造を指す。図形的には平行四辺形がくみあわさったようになる。A、B、C、Dの4集団であれば,A+B、C+Dという分け方のほかに、A+C、B+Dという分け方も共存する場合、系統樹ではあらわすことができず、系統ネットワークを用いる。(2015;岩波ジュニア新書)で提案されたモデル。日本列島中央部に中心軸と周辺部の二重構造があるとする。software)多数個人のゲノム情報を用いて、それらの人々がk個(k=1,2,3,・・・)の祖先集団の混血であると仮定して各個人の混血状況を推定するソフトウェア。助教と国立国際医療研究センターの河合洋介副プロジェクト長が中心になって解析をおこないました。コンピュータ解析は、新学術領域ヤポネシアゲノムの予算で購入したサーバーを利用しました。