2020.11.10大腸菌のミニプレップのキットは便利ですけど高いですよね。250サンプルで53,000円します。PlasmidMiniは300サンプルで25000円です(もっと安いキットがあれば教えて下さい)。計算すると1サンプルあたり、だいたい100円から200円前後かかってしまいます。数サンプルであれば全然問題ないのですが、大量の大腸菌を毎日扱う研究室にとっては、この積み重なる費用は馬鹿になりません。今回紹介するアルカリ溶解法を使うことで、ミニプレップにかかるコストをかなり削ることができると思います。アルカリ溶解法でなぜプラスミドDNAだけが抽出できるのか、その原理も合わせて解説したいと思います。スポンサーリンク目次アルカリ溶解法(アルカリSDS法)準備するものプロトコールまとめアルカリ溶解法(アルカリSDS法)アルカリ溶解法は1979年に発表されたプラスミド抽出法で、簡便でよく使われてきた方法です。大腸菌には染色体DNAはプラスミドDNAがあります。どちらもDNAですが、どうやってこの2つを分離しているのでしょうか?原理は次のように説明できます。DNAはpHを低くすると、塩基間の水素結合が崩壊します。徐々にpHを戻すと二本鎖に戻ることができますが(可逆的)、急にpHを元に戻すと、分子量の大きいDNAはこの変化に対応しきれずに不可逆的に変性したままで残ってしまいます。このアルカリ抽出法でプラスミドだけ抽出できるのは、分子量が大きい染色体は変性しやすく、分子量が小さいプラスミドは変性しにくい性質を利用しています。準備するもの溶液を3種類用意しないといけません。