ssh-keygen鍵の保存場所やパスフレーズを聞かれますので、適切に設定しましょう。ssh-copy-id作成した鍵ペアでログインできるように、接続先サーバーへ公開鍵を登録します。コマンドはこの辺を一発で済ませる事ができます。「パスフレーズ無しは良くないよね」という大義が有ると思うので使い方を。利用できる状態でそのコマンドが起動します。意図せずに秘密鍵の情報がキャッシュに残る可能性がグンと減ります。