RepositoryへPushしてあげましょう。別々の歴史を持っているので、同じ箇所を編集してしまっていたということもあるでしょう。addでインデックスに編集内容を追加します。その後、commitを作成します。commitを作成してくれません(エラー状態なので当たり前ですよね)。あとはそのcommitをPushして終了です。最後に開発をやっていく上で、Gitは非常に強力なツールとして積極的に活用していくと思います。その強力さ故に理解するのに非常に時間がかかります。以下のサイトを一通り流し読みされることをオススメします。日本語なので言語的には不自由なく読めます。通学・通勤中だったり授業中だったり趣味の時間だったりに少しずつ読んでいくと思います。