より熊本城の天守閣と同じ高さの中尾山中腹に葬られました。その後、元和2年本妙寺も城内より現在の地へ移転されたそうです。清正公の御廟所(淨池廟)は、真下に清正公が葬られており建物全体がお墓とのことです。毎年7月23日には頓写会(とんしゃえ)も行われており、多くの参詣者でにぎわいを見せます。頓写会は「頓(すみやか)に法華経(69384文字)を写経した法会」ということに由来しています。清正公の御廟所の横には「論語猿」を祀ってあり、論語猿の頭をなでると勉強好きになるといわれ、ついつい頭を撫でたくなります。毎年3月の最終土曜日には「本妙寺桜灯籠」が開催され、夜桜と本殿まで続く参道の数千にもおよぶ和紙灯篭が幻想的な一夜を醸し出しています。※掲載写真の無断転載を禁じます。