抑制する腸内環境は多発性硬化症などの自己免疫疾患に大きな影響を及ぼすことが分かっているが、その免疫細胞機構は解明されていない。これらの細胞は、「誘導性」IELの表現型を示す表面マーカーを発現しており、TH17様プロファイルを持ち、中枢神経系(CNS)に浸潤する。これらの細胞は恒常的にCtla4およびTgfb1を発現しており、CNSではLag3の発現が著明に上昇し、炎症を抑制する。IELが抑制能を持つこと、これらの細胞は腸由来抗原に応答して増殖すること、これらの細胞の誘導には微生物叢や食餌由来のアリール炭化水素受容体リガンドが寄与していることが明らかになった。T細胞の生成を支持し、この機構はCNS自己免疫を防ぐのに重要である可能性がある。