検定とは、カテゴリに順序をつけて、それに重み付けをし、その付与した重み付けの具合と一致しているかどうかと、すべてのカテゴリが平等であるかどうかと比較して、検定するものであるフェノタイプ数が2の場合SNPケース・コントロール関連解析における傾向性の検定で理解する分割表は2x3であるジェノタイプは3種類ある2アリルの片方について、0本、1本、2本を持つ、3ジェノタイプと考える3ジェノタイプが平等である、というとき、このジェノタイプに{a,a,a}という重みをつける今、3ジェノタイプに{a,a+b,a+2b}という重み付けをするこれは、着目しているアリルをもつ本数に比例した重みである着目アリルの本数に比例したリスクがあるのではないか、というモデルについて、平等モデルに対して検定をする場合には、このような重みのモデルを用いる今、3ジェノタイプに{a,a+b,a+b}という重み付けをするこれは、着目しているアリルを1本持つ場合と2本持つ場合とで、同じリスクを持つというモデルである(アディティブモデル)これは、優性モデルである今、{a,a,a+b}という重み付けをするこれは、劣性モデルであるその他、任意の重み付けも可能である自由度2x3分割表は自由度2であるが、2x3表の傾向性の検定は自由度1である重み付けは{a,b,c}のようにできるが、この重み付けは{0,x,1}という重み付けでxを適当にとることで代用できるので、パラメタ数はxの1個のみである。GWAS/GWASメタアナリシスとその周辺解析用のアプリケーションへのリンク複合遺伝性疾患とは----------News----------20万アクセス2008/07/2040万アクセス2010/09/12-------------------------はてなブログをはじめよう!ryamada22さんは、はてなブログを使っています。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。