Javaいくつかのツールが散在していて、使いにくい。まとめる努力をすることにする。ちなみにこの記事を載せたブログの管理者さんは、英語のチェックのこんなのもやっているし、Hatenarというサービスも管理しているとか。それによると、このryamada22ブログはこんな感じと。公開アプリケーション講義説明用のツール。formulaについて数日前に書いた。それは、ある正の整数を正の整数の和で表す表し方と関係していることも書いた。このように整数を整数の和で表すことを整数分割という。それについては、こちらを参照。その整数分割のパターン数をJavaでべ...分割の個数を出す2009-07-27上流から下流へJava今、家系図が与えられているものとする。遺伝子型データのシミュレーションをするとする。家系図の上流のサンプルの遺伝子型を決めたあとに、下流のサンプルの遺伝子型を決める必要がある。次のようにすることにする。...上流から下流へ2009-06-29有病率、アレル頻度、HWD係数F、ディプロタイプ別リスクからケース・コントロールのディプロタイプ頻度を算出する。ca={total[0]*risk[0],total[...有病率、アレル頻度、HWD係数F、ディプロタイプ別リスクからケース・コントロールのディプロタイプ頻度を算出する。Javaソースをダウンロードして、解凍、その後、eclipseで適当な名称で、Javaプロジェクトを新規作成。前回は、すべての染色体の長さが同じものと仮定した。Javaディリクレ分布については、Wikipediaの記事がこちら。場合について、の範囲での範囲について計算し、その結果を、x1,x2の軸についてプロットしたものである。生起確率コンピュータによる数値計算における精度のこと。浮動小数点のことなどあり、計算結果に誤差が出る話し。Mathematicaを用いて計算していたところ、任意精度という概念を採用していることはこちらに書いた。パーミュテーションテストパーミューテーションテストでモンテカルロを使うとすると、並列プロセスで用いる擬似乱数列も相互にランダムであることが必要である。第1プロセスは管理ファイルを作成する。このファイルは、オリジナル検定セットが終了してから作成する。Java大きな処理があるとする。同一な処理の繰り返しであるとする。それぞれの繰り返し処理単位は小さな出力を持つ。それぞれの繰り返し処理は、並列して行われる処理と、自身の処理との出力を単純に照合することで、継続するか否かの判断ができるとする。Java先日エクセルで線形回帰、という記事を書いた(こちら)。javaやっつけ仕事でGC補正をしたいとき。Javaここ数日の記事にて、形質に3タイプ以上の順位カテゴリや、量的形質を持ってきたときにKruskal-Wallis(3ジェノタイプに順序を考慮せず)と、Jonckheere-Terpstra(3ジェノタイプに順序を考慮する)とを適用することを書いてきた。...Jonckheere-Terpstra2007-09-19Kruskal-Wallisの準備。...</ret.length;i++){>Kruskal-Wallisの準備。今、全部で人いるとする。染色体ハプロイドはセットある。1つの2アレル型SNPについて着目すると、2種類のアレル数はを満足する。他方、2アレルが作る3ジェノタイプの人数はを満足する。この分配方式を一般的に定義しなおすと次のようになる。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。