捕獲ユニット換装パーツグレネードユニット電磁砲ユニットイエーガーユニットシュナイダーユニットパンツァーユニットイクスユニットシュトゥルムユニットスナイパーユニットヘビーウェポンユニット前作と違い、今作は強化・改造した機体を含む全てのゾイドに4種類までのパーツを装備させることができる。各種パーツは作戦中に財宝やクリア報酬として入手することが出来るほか、装備パーツに関してはキャンプコマンドの[補給物資]で購入や、敵機の残骸から回収できることもある。改造パーツだけは使い捨てなのでよく考えてから使うように。固定パーツ各ゾイドに固定されているパーツ。取り外すことは出来ない。ほとんどが武装用のものだが、特定のゾイド固有の特殊なパーツや装備パーツと互換性のあるものもある。自機の周囲3ヘクスにある埋もれた財宝を発見する。自機の周囲3ヘクスにある地雷(機雷)を発見する。発見した地雷は飛行ゾイド以外であれば回収可能。前作と異なり、移動の際の通り道に発見済みの地雷が存在した場合でも通過可能。自機の周囲2ヘクス内に隠れている隠蔽・ステルスゾイドを発見する。(GPS複合センサーと同時装備可。自機の周囲3ヘクス内に隠れている隠蔽・ステルスゾイドを発見する。(GPS複合センサーと同時装備可。敵機のレーダーに探知されても自機のステルス・隠蔽状態が持続し、発見されない。射撃武器の命中率+10%(他の命中補助パーツと同時装備可。射撃武器の命中率+20%(他の命中補助パーツと同時装備可。(他の装甲補助パーツと同時装備可。(他の装甲補助パーツと同時装備可。(他の装甲補助パーツと同時装備可。(他の移動力補助パーツと同時装備可。(他の移動力補助パーツと同時装備可。山と水及び空以外の地形適性を1ランク上げる。(飛行ゾイドには効果なし。水と空以外の地形適性を1ランク上げる。(飛行ゾイドには効果なし。水中を移動できるようになる。範囲攻撃により自機の周囲1ヘクスに状態変化「暗闇」を与える。光線属性の射撃攻撃を反射する。反射した時点で命中判定が行われるので、反射した攻撃が当たらない場合もある。(光線の反射時のみEP100消費。ビーム属性の射撃攻撃を反射する。反射した時点で命中判定が行われるので、反射した攻撃が当たらない場合もある。(ビームの反射時のみEP100消費。光線属性の射撃攻撃を吸収し、ダメージの数値分だけHPを回復する。回復量が自機の最大HPを超えることはない。回避時はEP消費なしで回復できる。(光線の吸収時のみEP50消費。ビーム属性の射撃攻撃を吸収し、ダメージの数値分だけHPを回復する。回復量が自機の最大HPを超えることはない。回避時はEP消費なしで回復できる。(ビームの吸収時のみEP50消費。光線によるダメージが50%減少する。(光線の反射時EP10消費。ビームによるダメージが50%減少する。(ビームの反射時EP10消費。コマンドウルフAT(冷凍砲)状態異常「凍結」を与えることができる唯一の武器。財宝としてのみ入手可能で敵機は使用してこない。前作では敵を一方的にハメ殺しもできたことからお世話になった人も多いはず。冷凍砲の弾数が減り、効果時間も短くなっていることもあって、パーツ欄を1個圧迫してまで使う必要性はあるかは疑問な所であり、前作ほど活躍できないと思われる。改造パーツ使用すると改造前には戻せなくなり、なおかつ使用した改造パーツは消失する。