殺人課の女刑事リンデンは新天地サンフランシスコに異動が決まっていた。シアトルでの勤務最終日に血だらけのセーターとATMカードを発見したことから、17歳の美少女ロージーの失踪事件を担当することになってしまう。後任のホールダーと共に、一見ありふれた殺人事件のように思えたこの事件を追う。その頃、ロージーが通っていた高校では、市長選に立候補していた市会議員のリッチモンドと現職市長との討論会が行われようとしていた。事態を重く見たリッチモンドは討論会の中止を決断する。友人たちをも巻き込み、複雑な人間模様が浮かび上がってくる。ペンシルベニア州ローズウッドの高校に通う美少女5人組の一人が、ある日の夜に忽然と失踪。事件から1年、残された4人、アリア、スペンサー、ハンナ、エミリーのもとに謎のメールが送られてくる。そこに記されたメッセージは、誰も知るはずのない4人の秘密に触れるものだった――。2009年10月6日に、世界中の人々が同時に137秒間意識を失うというブラックアウト現象が起き、その瞬間に人々は6ヶ月先の2010年4月29日の未来を見ることに。見た未来を実現させようとする人、防ごうとする人などの思いが交錯して、「既に見た未来」は刻々と近づいてきて...。ボストン国際空港に自動着陸した機内では、乗員・乗客全員の肉体が溶け落ち骨だけになっていた。FBI捜査官のオリビア・ダナムは、相棒スコット捜査官と共に捜査に加わる。すると捜査上にウォルター・ビショップ博士という、フリンジ・サイエンス(非主流科学)の天才博士の名が浮き上がる。博士は17年間ある施設に収容されており、博士に相談できる唯一の手段は、疎遠になっていた博士の息子のピーターに協力を頼むことだった。IQ190の天才ピーターをなんとか説き伏せ、オリビア、ウォルター、ピーターの3人は事件を追う。死のフライトで起きた事が、さらに巨大で衝撃的な真実の氷山の一角に過ぎないと知るのだった...。シアトル郊外の森で記憶を失った状態で目覚めた少年カイル。彼のアイデンティティとルーツを探す旅と、失った記憶に隠された驚くべき陰謀が描かれる。乱気流に巻き込まれた旅客機が南太平洋の孤島に墜落。48名の生存者は互いの幸運を無言でかみしめていたが、姿を見せない救助隊と不足していく食料を廻り徐々にいらだっていく。生き残るための積極的な行動に出ることを決意する彼らを待ちかまえていたのは人智を越えた現実の数々。誰もが「この島は本当に無人島なのか?」という疑問を感じつつ、状況は裏切りと信頼、恐怖と希望とが交錯するパニック状態に。飛行機事故は偶然なのか。彼らの生還を妨げているのは何か。妻キャサリーンが自宅の階段下で血を流して不可解な死を遂げ、その発見者である夫マイケルに殺人の容疑がかけられる。マイケルは犯罪小説家として著名であり、事件発生後すぐにドキュメンタリー監督であるジャン・グザビエ・ド・レストラードに特別に取材する権利が与えられた。行方を鮮烈にとらえたのだ。現場から凶器は見つからず、妻殺害の動機も判明しないまま、捜査と裁判が進むにつれて、この事件の持つもう一つの隠された事実と誰もが予想できなかった驚愕の真相が明らかにされていく。あらゆる時代の様々な場所で、突如、こつぜんと姿を消した4400人もの人々が、2004年、謎の光る球体と共に姿を現す。彼らは皆、得体のしれない特殊な力を宿し帰還したのだった。彼らは一体、何のために連れ去られ、現代に舞い戻ってきたのか?そして彼らに課された使命とは?そこには想像を絶する事実が隠されているのだった。舞台は1930年台の大恐慌のアメリカ。人間の病を治す能力を持つ主人公ベン。母親を亡くした後、カーニバル一座に拾われ、旅をすることになる。ベンはその力を発揮するにはある秘密があった。カーニバルには他にも超人的な能力があるものもいた。カリフォルニアに住むブラザー・ジャスティンは、人間を操る能力があることに気がついていく。二人は何らかの見えない糸で繋がっている。二人の運命はどうなるのか。