頭端式3面2線の地上ホームを有する太宰府線の終着駅である。島式1面2線の反対側に相対式ホームで挟み、終端を繋げて改札を設置した形になっている。真ん中の2番線及び3番線は乗降用になっており、1番線と4番線は降車専用になっている。分岐して太宰府までを結ぶ2.4kmの単線である。同年5月1日太宰府から二日市駅前(湯町口)までの区間が開業する。太宰府馬車鉄道は太宰府軌道に社名を変更、1913年から動力を馬力から蒸気に変更する。太宰府軌道は1934年6月30日に九州鉄道に合併され、太宰府線となった。駅名の由来は最寄りの太宰府天満宮から来ており、駅前から参道上を東へ約300mの距離にある。太宰府天満宮は菅原道真を主祭神とする神社であり、北野天満宮と並んで天満宮の総本社である。翌々年の903年(延喜3年)にこの地で死去し、905年(延喜5年)8月に廟を建立、その後、京都で道真の祟りと思われる出来事が頻発し、919年(延喜19年)に社殿が造営された。