自動化する上でプログラミングの知識が必要となるのですが、当初は全くの素人であったため、プログラミングに詳しい友人には何度も相談させてもらいました。年弱かかってしまいましたが、ヒドラの行動をほぼ全自動で解析できるようになりました。[2]と呼ばれる技術を用いて解析しました。個の遺伝子がありますが、それらの発現を一度に解析することができます。回ヒドラを採取し、時刻に応じた遺伝子発現の変化を調べました。行動は昼に多くなり、夜には少なくなりました。明期では活発に収縮し、暗期になると活動が弱まっている。この行動は一見すると時計遺伝子によるものと思われますが、実際は時計遺伝子とは関係がありません。常に明るい条件下や常に暗い条件下で実験してみると、行動に周期性が見られなかったからです。したがって、ヒドラの行動における昼夜サイクルは、ヒドラが明暗を区別したことによる変動だと考えられます。一方で、遺伝子発現を大規模に解析すると興味深い結果が得られました。[3]を適用し、周期的な発現を示す遺伝子を探索しました。個の遺伝子を番号付けして並べたものである。横軸は実験の経過時間を表す。遺伝子発現が高いときには赤色で示し、低いときには緑色で示している。時間後には弱まっている。時間の周期性をもつことが分かる。