忍術や生活を体験したり学んだりできる甲賀の里忍術村の中、からくり井戸や水ぐもが体験できる池のそばに古い民家風の建物の甲賀忍術博物館があります。ここには、手裏剣などの忍び道具や忍び装束など、テレビや映画でお馴染みのものはもとより、古文書類や日々の生活に使われていた道具も展示されているので、忍者の生活などについてもよくわかります。入場料は甲賀の里忍術村入村料に含まれます。甲賀忍者の忍術や生活を体験したり学んだりできる甲賀の里忍術村の中、からくり井戸や水ぐもが体験できる池のそばに古い民家風の建物の甲賀忍術博物館があります。ここには、手裏剣などの忍び道具や忍び装束など、テレビや映画でお馴染みのものはもとより、古文書類や日々の生活に使われていた道具も展示されているので、忍者の生活などについてもよくわかります。隣りにあるからくり屋敷は、甲賀・伊賀忍者の武術についてまとめた甲賀忍者の古文書「萬川集海(ばんせんしゅうかい)」の編者の一人といわれる藤森保義(ふじもりやすよし)が、実際に住居としていた家を移築、改修したものです。