本日はバイオインフォマティクスの基礎の基礎。FASTQファイルについて見ていきましょう。bpの塩基配列を取得できます。bioinformaticsアライメント。要するに配列を比較し、並べる操作を指します。遺伝子の発現量を測定したいときなど、遺伝子解析においてはアライメントを必要とする場面が多々登場します。30以上もの生物学的な目的で作成されたデータベースに対する統合的なテキストベースの検索、情報抽出システムです。BiopythonパッケージのBio.Entrezモジュールを使えば、このシステムをpythonから手軽に使えちゃいます。抗原抗体反応を利用して、抗原タンパク質が結合しているクロマチン構造を免疫沈降させ、クロマチン内に含まれるDNAを濃縮する手法。ヒストンや転写因子に対して、それらを認識する抗体を取ってくる。RNASeuratはシングルセルRNA解析で頻繁に使用されるRのパッケージです。effect除去などを含めた手法を丁寧に解説します。SeqPrepはPandaSeqとは違うアルゴリズムのoverlapをマージするツール。TechSupport@illumina.comからイルミナにアダプター配列のリストをもらえたりするらしい。fastqファイルには、シーケンシングのされ方で2種類ある。ブログを報告するスターをつけました引用をストックしましたストック一覧を見る閉じる引用するにはまずログインしてくださいログイン閉じる引用をストックできませんでした。再度お試しください閉じる限定公開記事のため引用できません。