庭園の原型は、蓬春が昭和23年(1948)にこの三ヶ岡の地に居住する際に、住居・庭園に手入れを行ったことから始まります。庭園については、京都から造園師を呼び寄せ作庭したといわれており、完成後も造園業者に丹念に手を入れてもらい料亭を思わせるような端整な庭園へと仕上がっていったのです。際に、橋本明治の障壁画のモチーフとなった福島県三春町の滝桜(紅枝垂桜)の苗を、明治から貰い受けるなど画家同士の交流によるものや、蓬春が自身の絵のモチーフとするために多くの草花を植えていたことなどが挙げられます。そのような庭園も、平成3年(1991)に山口蓬春邸を記念館として開館させるにあたり、建物や庭園に一部改修が加えらたり、また長い歳月の間に植物が成長し、蓬春が生前に残した写真や素描などと比べると、住居からの庭の眺めが全く変わってしまっていることが分かります。時には台風などの自然災害によって大木が倒れてしまったこともあります。蓬春が春子夫人とともに育ててきた庭園は、四季を通じて花が絶えない美しい庭園として、来館される方々に親しまれています。