ソフトウェアにより制御されるので、大量の試料の測定と評価を自動で行うことができます。ような多変量解析が用いられます。ような様々なアルゴリズムが用いられます。HTS-XT赤外分光を行うメリットとして、各赤外スペクトルから分子情報を得られることが挙げられます。他のハイスループット分析では特定のパラメーターを専用のマーカーシステムで測定する必要がありますが、赤外マイクロプレート分析では、対象物質全体の構造・分子情報を得ることが可能です。回の測定で複数のパラメーターを評価することができます。