admin理研バイオインフォマティクスセミナーを実施します。近年の大規模なRNA二次構造解析の結果から、mRNAに存在する多様な二次構造特性と機能との関連性が明らかになってきました。実験・計算機的な限界から、スプライシングに大きく影響を及ぼすといわれているイントロン領域に関しては、その全体像は未解明でした。そこで我々はParasoRというRNA二次構造並列計算ソフトウェアを開発し、これによりイントロンを含むpre-mRNA配列やゲノム全体に対する様々な二次構造シミュレーションが可能となりました。今回は、RNA二次構造予測と実験的な解析手法について、またゲノムワイドな二次構造予測によって明らかになった、転写物における二次構造の安定性と、スプライスサイト周囲の特徴的な二次構造についてお話ししたいと思います。アカデミアでも企業でも可。理研外の参加者の方へ理研外の方は、西門守衛所にて一時入構手続きを行う必要があります。尾崎、目的:セミナーとしてください。大会議室(埼玉県和光市広沢2-1)理研バイオインフォマティクスセミナーシリーズを開催します。椿真史さんをお迎えし、ご講演頂きます。本セミナーではまず、機械学習を用いた自然言語処理技術について概観します。それらの技術の中でも特に近年では、表現学習や深層学習といった手法が盛んに研究されています。これらの手法は、自然言語処理だけでなくバイオインフォマティクスにおいても適用可能であり、本セミナーでは特に、タンパク質構造予測への応用についてお話します。アカデミアでも企業でも可。atndから参加登録をお願いします。https://atnd.org/events/72326理研外の参加者の方へ理研外の方は、西門守衛所にて一時入構手続きを行う必要があります。露崎、目的:セミナーとしてください。大会議室(埼玉県和光市広沢2-1)理研バイオインフォマティクスセミナーシリーズを開催します。東京大学の佐藤建太さんをお迎えし、科学計算などで話題の汎用プログラミング言語Juliaについてご講演いただきます。早くからJuliaによるプログラミングやライブラリ開発に取り組まれており、バイオインフォマティクス向けJuliaライブラリ群であるBioJuliaにおけるDNAシークエンサーデータ解析関連の技術開発もされています。アカデミアでも企業でも可。atndから参加登録をお願いします。理研外の参加者の方へ理研外の方は、西門守衛所にて一時入構手続きを行う必要があります。尾崎、目的:セミナーとしてください。輪読会を実施しました。adminアメリエフさんのご協力で第2回理研バイオインフォマティクスセミナー「フリーソフトではじめるRNA-seq解析、ChIP-seq解析入門」開催を開催しました。